MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	CGG	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008741	TCC	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008741	GTG	2	6	3546	3551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008741	ACG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008741	GAA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008741	ATC	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008741	CCG	2	6	4813	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008741	ATC	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008741	CGG	2	6	5236	5241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008741	CCA	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008741	GAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008741	CGC	2	6	5560	5565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008741	GCC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008741	CGT	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008741	AGG	2	6	5651	5656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008741	CGG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008741	TCT	2	6	5725	5730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008741	GAT	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008741	TGG	2	6	7874	7879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008741	AAT	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008741	ATG	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008741	CGC	2	6	9109	9114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008741	GTG	2	6	15170	15175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008741	CGG	2	6	15344	15349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008741	GCC	2	6	15363	15368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008741	CCG	2	6	15670	15675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008741	GCC	2	6	15689	15694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008741	AAG	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008741	GCA	2	6	20140	20145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008741	TGT	2	6	20146	20151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008741	TGG	2	6	20203	20208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008741	GGC	2	6	20216	20221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008741	GCA	2	6	20234	20239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008741	CCG	2	6	20254	20259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008741	CGA	2	6	20516	20521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008741	GCG	2	6	20705	20710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008741	CCG	2	6	20885	20890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008741	CTG	2	6	22649	22654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008741	GAC	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008741	TCA	2	6	23364	23369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008741	TGT	2	6	23393	23398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008741	GCC	2	6	25815	25820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008741	CGG	2	6	28684	28689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008741	GTC	2	6	29657	29662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008741	CAT	2	6	29934	29939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008741	CGA	2	6	30118	30123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008741	GAC	2	6	30258	30263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008741	GCG	2	6	30386	30391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008741	CGG	2	6	30464	30469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008741	CGC	2	6	30710	30715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008741	GAG	2	6	30726	30731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008741	TGG	2	6	30787	30792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008741	CGA	2	6	30905	30910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008741	CGA	2	6	31097	31102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008741	ACC	2	6	31181	31186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008741	CAC	2	6	31328	31333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008741	ACG	2	6	31432	31437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008741	ACC	2	6	31497	31502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008741	CTG	2	6	31696	31701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008741	CAC	2	6	31705	31710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008741	CGC	2	6	31770	31775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008741	CGA	2	6	31826	31831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008741	GTT	2	6	31862	31867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008741	ACG	2	6	31925	31930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008741	AAG	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008741	CAC	2	6	31983	31988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008741	CAG	2	6	32048	32053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008741	CAT	2	6	32107	32112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008741	CCA	2	6	32174	32179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008741	ATG	2	6	32394	32399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008741	TTG	2	6	32456	32461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008741	GGT	2	6	32587	32592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008741	AGT	2	6	32646	32651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008741	CCT	2	6	38111	38116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008741	GAT	2	6	40384	40389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008741	CCT	2	6	40524	40529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008741	GAC	2	6	40610	40615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008741	GCC	2	6	40624	40629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008741	CCA	2	6	43823	43828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008741	CGT	2	6	43876	43881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008741	GTC	2	6	43948	43953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008741	GTG	2	6	44022	44027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008741	CCG	2	6	48924	48929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008741	CGG	3	9	50809	50817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008741	CGT	2	6	50822	50827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008741	GCG	2	6	50834	50839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008741	GCC	2	6	50850	50855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008741	CTG	2	6	50948	50953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008741	GCC	2	6	50976	50981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008741	GCC	2	6	51018	51023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008741	TTC	3	9	51042	51050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008741	GCT	2	6	51060	51065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008741	GCC	2	6	51066	51071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008741	CGG	2	6	54839	54844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008741	TCC	2	6	55157	55162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008741	CAG	2	6	59051	59056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008741	CGT	2	6	59200	59205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008741	GCC	2	6	59252	59257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008741	CCA	2	6	59339	59344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008741	TGC	2	6	62737	62742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008741	TCC	2	6	63071	63076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008741	CCG	2	6	63101	63106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008741	AGC	2	6	63108	63113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008741	CAT	2	6	63169	63174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008741	GCG	2	6	63248	63253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008741	CAG	2	6	63255	63260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008741	CAT	2	6	63384	63389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008741	AGC	2	6	63509	63514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008741	GTT	2	6	63549	63554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008741	GCA	2	6	63584	63589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008741	CAT	2	6	63607	63612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008741	CAG	2	6	63750	63755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008741	GGA	2	6	63763	63768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008741	GCA	2	6	68191	68196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008741	CGT	2	6	68305	68310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008741	GGA	2	6	75079	75084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008741	GGC	2	6	76152	76157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008741	CTT	2	6	76292	76297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008741	CAC	2	6	76311	76316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008741	CGC	2	6	76328	76333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008741	GTG	2	6	77928	77933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008741	GTG	2	6	78069	78074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008741	GTC	2	6	78083	78088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008741	GTC	2	6	78122	78127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008741	GCA	2	6	78176	78181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008741	GTC	2	6	78198	78203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008741	TTC	2	6	78701	78706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008741	CGG	2	6	78788	78793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008741	TCG	2	6	78837	78842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008741	TCC	2	6	80365	80370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008741	TGC	2	6	80409	80414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008741	GGC	2	6	81402	81407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008741	GAT	2	6	81441	81446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008741	CGT	2	6	81591	81596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008741	TGT	2	6	81731	81736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008741	TGG	2	6	81752	81757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008741	GGT	2	6	81768	81773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008741	GGC	2	6	81793	81798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008741	GGA	2	6	81818	81823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008741	TGC	2	6	88871	88876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_008741	ATG	2	6	93122	93127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_008741	CCG	2	6	195018	195023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_008741	GAC	2	6	195148	195153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_008741	GCC	2	6	197389	197394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.