MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	CG	3	6	4641	4646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008741	GC	3	6	4917	4922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008741	CA	3	6	5461	5466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008741	GT	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008741	CA	3	6	15574	15579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008741	CA	3	6	20238	20243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008741	CT	3	6	20586	20591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008741	AT	3	6	23486	23491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008741	CG	3	6	29694	29699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008741	CG	3	6	29828	29833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008741	AC	3	6	30250	30255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008741	GT	3	6	30404	30409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008741	GC	3	6	31382	31387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008741	TG	3	6	32700	32705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008741	TG	3	6	40468	40473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008741	CG	3	6	40505	40510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008741	GC	3	6	46149	46154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008741	GT	3	6	50786	50791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008741	TC	3	6	54701	54706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008741	GC	3	6	59194	59199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008741	GC	3	6	59215	59220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008741	GT	3	6	63146	63151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008741	GC	3	6	76236	76241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008741	GC	3	6	76302	76307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008741	GC	3	6	76346	76351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008741	CA	3	6	78111	78116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008741	CG	3	6	78754	78759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008741	GC	3	6	80403	80408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008741	TC	3	6	81372	81377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008741	GT	3	6	81735	81740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008741	GA	3	6	81812	81817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008741	GT	3	6	92916	92921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008741	CG	3	6	92992	92997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008741	AC	5	10	109780	109789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008741	TC	3	6	122743	122748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008741	CG	3	6	135204	135209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008741	CG	3	6	135296	135301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008741	GC	3	6	145376	145381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008741	CG	4	8	145395	145402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008741	TC	3	6	153228	153233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008741	AC	3	6	167059	167064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008741	AT	4	8	167069	167076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008741	CA	3	6	168084	168089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008741	AC	3	6	169257	169262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008741	GC	3	6	169398	169403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008741	TA	3	6	172265	172270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008741	AC	3	6	177260	177265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008741	GC	3	6	177356	177361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008741	AG	3	6	179134	179139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008741	CG	3	6	181099	181104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008741	TG	3	6	181109	181114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008741	GC	3	6	181486	181491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008741	CG	3	6	195000	195005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008741	CG	3	6	195028	195033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008741	AT	3	6	195194	195199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008741	GT	3	6	197901	197906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008741	TA	3	6	198373	198378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.