MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008740	GGGCT	2	10	5645	5654	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008740	CTCCG	2	10	50719	50728	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_008740	TTGGC	2	10	51532	51541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008740	GTGCG	2	10	52705	52714	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008740	CAGGC	2	10	53122	53131	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008740	AGGTC	2	10	54336	54345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008740	CCTTG	2	10	56625	56634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008740	AGCCG	2	10	70741	70750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008740	CGCAG	2	10	72408	72417	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008740	CTTAT	2	10	82948	82957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008740	TGCCA	2	10	104250	104259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008740	CGCGG	2	10	135859	135868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008740	TCTTT	2	10	138789	138798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008740	CCCAA	2	10	204000	204009	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_008740	TTTGC	2	10	262497	262506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008740	TAACG	2	10	267350	267359	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008740	AAAGC	2	10	300740	300749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008740	GTGCC	2	10	304357	304366	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008740	GTTTT	2	10	307678	307687	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008740	TAAAC	2	10	329554	329563	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008740	GCGGT	2	10	352447	352456	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008740	TGATC	2	10	355076	355085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008740	CAGCG	2	10	355693	355702	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008740	CGAGG	2	10	406429	406438	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008740	ACAAA	2	10	447311	447320	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008740	GTCGG	2	10	449312	449321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008740	AAGCC	2	10	465316	465325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008740	CGGTG	2	10	466329	466338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008740	TTTGG	2	10	481948	481957	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008740	CCAAC	2	10	486143	486152	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_008740	TCAGT	2	10	509875	509884	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008740	GTCTA	2	10	510039	510048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008740	CCCCG	2	10	524889	524898	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
34	NC_008740	CTGGT	2	10	541512	541521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008740	ACCAG	2	10	541604	541613	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008740	CCAGA	2	10	545887	545896	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008740	TTTGA	2	10	589034	589043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008740	GGCTT	2	10	625745	625754	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008740	TGTAG	2	10	627395	627404	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008740	ACGAT	2	10	628909	628918	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008740	GAGCC	2	10	634320	634329	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008740	CAAAG	2	10	669807	669816	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008740	TTGGC	2	10	670535	670544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008740	GGCAC	2	10	680219	680228	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008740	CGAAT	2	10	680256	680265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008740	ATTGT	2	10	700038	700047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008740	GACGC	2	10	714274	714283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008740	TGCCG	2	10	717070	717079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008740	CGAGC	2	10	717325	717334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008740	CCGGC	2	10	718369	718378	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_008740	GCCGG	2	10	718993	719002	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008740	GACTT	2	10	719429	719438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008740	ATTGA	2	10	720720	720729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008740	CCGGG	2	10	729264	729273	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008740	AAACA	2	10	753906	753915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008740	GGCCC	2	10	756576	756585	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008740	GAAAA	2	10	756855	756864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008740	GCTGG	2	10	761136	761145	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008740	GGCAG	2	10	777598	777607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008740	TCGTG	2	10	799822	799831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008740	AGTCG	2	10	802039	802048	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008740	ATCCC	2	10	803967	803976	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_008740	TAAGG	2	10	843753	843762	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008740	CGGGG	2	10	869236	869245	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008740	CAGCG	2	10	870864	870873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008740	AACAG	2	10	911290	911299	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008740	CCGGT	2	10	920021	920030	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_008740	CAGGG	2	10	929496	929505	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008740	TCGCC	2	10	938517	938526	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_008740	TCGTG	2	10	1011203	1011212	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008740	AGTCG	2	10	1013420	1013429	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008740	ATCCC	2	10	1015348	1015357	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_008740	CATTT	2	10	1022363	1022372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008740	TTCTG	2	10	1055589	1055598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008740	GAAAG	2	10	1062014	1062023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008740	AATTG	2	10	1095057	1095066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008740	TTTAC	2	10	1118057	1118066	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008740	CGGCG	2	10	1120936	1120945	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_008740	GGCTC	2	10	1122624	1122633	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008740	AGTCG	2	10	1126535	1126544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008740	CCGGA	2	10	1126972	1126981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_008740	GGTGC	2	10	1130252	1130261	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008740	GGTGC	2	10	1130643	1130652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008740	TGGTT	2	10	1130727	1130736	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008740	ACCAA	2	10	1131314	1131323	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_008740	CCAGG	2	10	1133139	1133148	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008740	ACAGC	2	10	1133636	1133645	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_008740	TAGGA	2	10	1138457	1138466	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008740	GATTG	2	10	1138581	1138590	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008740	AAAAG	2	10	1141567	1141576	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008740	TGATG	2	10	1145622	1145631	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008740	AAAAG	2	10	1194434	1194443	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008740	TATTT	2	10	1200379	1200388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008740	GTCAG	2	10	1202277	1202286	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008740	TCCGC	2	10	1210291	1210300	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_008740	AACAA	2	10	1212475	1212484	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008740	TCCGG	2	10	1227052	1227061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008740	GGACA	2	10	1242760	1242769	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008740	AAAAG	2	10	1244330	1244339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008740	GTATT	2	10	1306105	1306114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008740	ACTAT	2	10	1307046	1307055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008740	CCGGG	2	10	1339268	1339277	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008740	GTTGA	2	10	1363646	1363655	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008740	GGCTG	2	10	1378764	1378773	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008740	CGCCA	2	10	1380380	1380389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_008740	GATGG	2	10	1382606	1382615	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008740	TCCGG	2	10	1386662	1386671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008740	ATTCT	2	10	1387318	1387327	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008740	TCCGC	2	10	1404574	1404583	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_008740	GGAAA	2	10	1428509	1428518	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008740	CCACC	2	10	1435061	1435070	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_008740	GATTT	2	10	1440524	1440533	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008740	ACCGA	2	10	1441498	1441507	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008740	AAATA	2	10	1441521	1441530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008740	GAATT	2	10	1450382	1450391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008740	TGAAA	2	10	1450411	1450420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008740	CCGGA	2	10	1454968	1454977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008740	CAGAA	2	10	1496417	1496426	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008740	AGATC	2	10	1499720	1499729	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008740	TAATT	2	10	1500622	1500631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008740	CCTGC	2	10	1540392	1540401	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_008740	TCCTG	2	10	1564254	1564263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008740	AAACA	2	10	1566465	1566474	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008740	TGGCT	2	10	1569428	1569437	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008740	GCGTG	2	10	1570077	1570086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008740	CAAAG	2	10	1587353	1587362	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008740	TAACT	2	10	1600257	1600266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008740	CCCGC	2	10	1604467	1604476	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
129	NC_008740	TCTGC	2	10	1626465	1626474	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008740	TTCAC	2	10	1630121	1630130	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008740	CTTCC	2	10	1630136	1630145	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_008740	AACAG	2	10	1636630	1636639	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008740	AACTT	2	10	1646406	1646415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008740	CGTTC	2	10	1662898	1662907	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008740	GGGCC	2	10	1662919	1662928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_008740	GACAG	2	10	1678969	1678978	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008740	ATCAG	2	10	1684021	1684030	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008740	TTCCC	2	10	1684118	1684127	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_008740	CACGG	2	10	1701451	1701460	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_008740	ATGTT	2	10	1706596	1706605	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008740	GACAA	2	10	1710191	1710200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008740	GTCCT	2	10	1740740	1740749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008740	GTCAA	2	10	1765586	1765595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008740	TATGA	2	10	1769441	1769450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008740	GTATT	2	10	1809124	1809133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008740	GAACA	2	10	1815707	1815716	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_008740	TCTTG	2	10	3964305	3964314	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
282	NC_008740	CGCCA	2	10	3965591	3965600	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
283	NC_008740	CCCAC	2	10	3965623	3965632	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
284	NC_008740	AATCA	2	10	3982293	3982302	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_008740	ACTCT	2	10	3994742	3994751	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_008740	CGCTT	2	10	4002202	4002211	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_008740	GCCCG	2	10	4005346	4005355	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
288	NC_008740	ACTCG	2	10	4076515	4076524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_008740	TCAGC	2	10	4081279	4081288	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
290	NC_008740	TCCGG	2	10	4111921	4111930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
291	NC_008740	CCAGC	2	10	4115721	4115730	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
292	NC_008740	GCTCC	2	10	4133123	4133132	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
293	NC_008740	GCACC	2	10	4145972	4145981	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
294	NC_008740	CGGAG	2	10	4152081	4152090	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
295	NC_008740	TGTTT	2	10	4159855	4159864	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008740	CAGAC	2	10	4165058	4165067	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
297	NC_008740	TGACC	2	10	4169900	4169909	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
298	NC_008740	GGTCA	2	10	4169916	4169925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
299	NC_008740	GCCGG	2	10	4191828	4191837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
300	NC_008740	GAGCT	2	10	4197901	4197910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_008740	CACTT	2	10	4201664	4201673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
302	NC_008740	TGCCG	2	10	4202089	4202098	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
303	NC_008740	CATCC	2	10	4232823	4232832	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
304	NC_008740	ATCCG	2	10	4251219	4251228	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
305	NC_008740	CCGGG	2	10	4260669	4260678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
306	NC_008740	AATTA	2	10	4264563	4264572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_008740	GGCCA	2	10	4275811	4275820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
308	NC_008740	CTAGC	2	10	4275833	4275842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
309	NC_008740	GCTCC	2	10	4289731	4289740	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
310	NC_008740	CTTTT	2	10	4295130	4295139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
311	NC_008740	AATTA	2	10	4312294	4312303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_008740	TCCCG	2	10	4320781	4320790	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
313	NC_008740	GTCAG	2	10	4324099	4324108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.