MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 2240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008740	TCACT	2	10	1566	1575	20 %	40 %	0 %	40 %	120552945
2	NC_008740	ACCAC	2	10	1823	1832	40 %	0 %	0 %	60 %	120552945
3	NC_008740	CCTTC	2	10	3357	3366	0 %	40 %	0 %	60 %	120552947
4	NC_008740	CTTTT	2	10	8229	8238	0 %	80 %	0 %	20 %	120552950
5	NC_008740	TTCTT	2	10	8533	8542	0 %	80 %	0 %	20 %	120552950
6	NC_008740	CGGGC	2	10	10873	10882	0 %	0 %	60 %	40 %	120552952
7	NC_008740	AGGCC	2	10	11974	11983	20 %	0 %	40 %	40 %	120552952
8	NC_008740	TGGCC	2	10	12830	12839	0 %	20 %	40 %	40 %	120552953
9	NC_008740	ACGAA	2	10	13876	13885	60 %	0 %	20 %	20 %	120552953
10	NC_008740	CTGTC	2	10	15127	15136	0 %	40 %	20 %	40 %	120552954
11	NC_008740	GCACC	2	10	15299	15308	20 %	0 %	20 %	60 %	120552954
12	NC_008740	GGGCA	2	10	15366	15375	20 %	0 %	60 %	20 %	120552954
13	NC_008740	ACCGC	2	10	15580	15589	20 %	0 %	20 %	60 %	120552954
14	NC_008740	GCGCG	2	10	18220	18229	0 %	0 %	60 %	40 %	120552955
15	NC_008740	CCGCA	2	10	18362	18371	20 %	0 %	20 %	60 %	120552955
16	NC_008740	GGCTG	2	10	18607	18616	0 %	20 %	60 %	20 %	120552955
17	NC_008740	TGGGT	2	10	21318	21327	0 %	40 %	60 %	0 %	120552956
18	NC_008740	CGGAA	2	10	21704	21713	40 %	0 %	40 %	20 %	120552956
19	NC_008740	CCTTG	2	10	23280	23289	0 %	40 %	20 %	40 %	120552956
20	NC_008740	CGGCG	2	10	23724	23733	0 %	0 %	60 %	40 %	120552956
21	NC_008740	TGAGC	2	10	25785	25794	20 %	20 %	40 %	20 %	120552958
22	NC_008740	CTGCA	2	10	26266	26275	20 %	20 %	20 %	40 %	120552958
23	NC_008740	TTCCC	2	10	27055	27064	0 %	40 %	0 %	60 %	120552959
24	NC_008740	CAGCG	2	10	27993	28002	20 %	0 %	40 %	40 %	120552959
25	NC_008740	GGCGT	2	10	29249	29258	0 %	20 %	60 %	20 %	120552960
26	NC_008740	GTTTG	2	10	30742	30751	0 %	60 %	40 %	0 %	120552962
27	NC_008740	GCTGT	2	10	30865	30874	0 %	40 %	40 %	20 %	120552962
28	NC_008740	CGGTC	2	10	32983	32992	0 %	20 %	40 %	40 %	120552962
29	NC_008740	CACGG	2	10	33759	33768	20 %	0 %	40 %	40 %	120552963
30	NC_008740	GGCCC	2	10	34639	34648	0 %	0 %	40 %	60 %	120552964
31	NC_008740	TTCGC	2	10	36643	36652	0 %	40 %	20 %	40 %	120552967
32	NC_008740	TTGCT	2	10	40885	40894	0 %	60 %	20 %	20 %	120552971
33	NC_008740	ATTGC	2	10	41573	41582	20 %	40 %	20 %	20 %	120552971
34	NC_008740	CGGAT	2	10	41961	41970	20 %	20 %	40 %	20 %	120552971
35	NC_008740	CTTCA	2	10	43803	43812	20 %	40 %	0 %	40 %	120552972
36	NC_008740	GATGG	2	10	45060	45069	20 %	20 %	60 %	0 %	120552973
37	NC_008740	TTTGG	2	10	50523	50532	0 %	60 %	40 %	0 %	120552977
38	NC_008740	CAAAG	2	10	55627	55636	60 %	0 %	20 %	20 %	120552979
39	NC_008740	CAATC	2	10	55654	55663	40 %	20 %	0 %	40 %	120552979
40	NC_008740	CCCTG	2	10	56674	56683	0 %	20 %	20 %	60 %	120552980
41	NC_008740	GGCGG	2	10	56850	56859	0 %	0 %	80 %	20 %	120552980
42	NC_008740	ACGGT	2	10	59906	59915	20 %	20 %	40 %	20 %	120552981
43	NC_008740	CGGGT	2	10	60002	60011	0 %	20 %	60 %	20 %	120552981
44	NC_008740	GGCCG	2	10	60040	60049	0 %	0 %	60 %	40 %	120552981
45	NC_008740	CCCAG	2	10	60872	60881	20 %	0 %	20 %	60 %	120552982
46	NC_008740	GCTGG	2	10	61086	61095	0 %	20 %	60 %	20 %	120552982
47	NC_008740	GCCAG	2	10	63661	63670	20 %	0 %	40 %	40 %	120552984
48	NC_008740	GTAAC	2	10	63859	63868	40 %	20 %	20 %	20 %	120552984
49	NC_008740	TCCGG	2	10	63903	63912	0 %	20 %	40 %	40 %	120552984
50	NC_008740	GGCCA	2	10	65510	65519	20 %	0 %	40 %	40 %	120552986
51	NC_008740	GGCCG	2	10	67170	67179	0 %	0 %	60 %	40 %	120552988
52	NC_008740	GCACC	2	10	69422	69431	20 %	0 %	20 %	60 %	120552990
53	NC_008740	CGGAC	2	10	72508	72517	20 %	0 %	40 %	40 %	120552994
54	NC_008740	GCTGG	2	10	79515	79524	0 %	20 %	60 %	20 %	120553001
55	NC_008740	CTTCG	2	10	85517	85526	0 %	40 %	20 %	40 %	120553006
56	NC_008740	GCCGG	2	10	86733	86742	0 %	0 %	60 %	40 %	120553008
57	NC_008740	CCGCG	2	10	87820	87829	0 %	0 %	40 %	60 %	120553010
58	NC_008740	TCAGG	2	10	88502	88511	20 %	20 %	40 %	20 %	120553011
59	NC_008740	CTGGC	2	10	89249	89258	0 %	20 %	40 %	40 %	120553012
60	NC_008740	GGTCT	2	10	92324	92333	0 %	40 %	40 %	20 %	120553015
61	NC_008740	CTGGC	2	10	92800	92809	0 %	20 %	40 %	40 %	120553015
62	NC_008740	CTGTT	2	10	93499	93508	0 %	60 %	20 %	20 %	120553016
63	NC_008740	GGCCG	2	10	94107	94116	0 %	0 %	60 %	40 %	120553016
64	NC_008740	GGGCC	2	10	96268	96277	0 %	0 %	60 %	40 %	120553017
65	NC_008740	CCAGT	2	10	99327	99336	20 %	20 %	20 %	40 %	120553021
66	NC_008740	CGGGC	2	10	99817	99826	0 %	0 %	60 %	40 %	120553021
67	NC_008740	CATAA	2	10	102948	102957	60 %	20 %	0 %	20 %	120553024
68	NC_008740	GGGCT	2	10	103581	103590	0 %	20 %	60 %	20 %	120553024
69	NC_008740	CGGTG	2	10	105818	105827	0 %	20 %	60 %	20 %	120553026
70	NC_008740	GCCGA	2	10	108858	108867	20 %	0 %	40 %	40 %	120553028
71	NC_008740	GGGCT	2	10	109827	109836	0 %	20 %	60 %	20 %	120553029
72	NC_008740	GCTTT	2	10	110121	110130	0 %	60 %	20 %	20 %	120553029
73	NC_008740	GTGGG	2	10	111806	111815	0 %	20 %	80 %	0 %	120553031
74	NC_008740	AGGCC	2	10	117432	117441	20 %	0 %	40 %	40 %	120553034
75	NC_008740	GGAAC	2	10	117535	117544	40 %	0 %	40 %	20 %	120553034
76	NC_008740	CGGTG	2	10	117946	117955	0 %	20 %	60 %	20 %	120553034
77	NC_008740	CCAGG	2	10	120086	120095	20 %	0 %	40 %	40 %	120553036
78	NC_008740	CCAGG	2	10	120700	120709	20 %	0 %	40 %	40 %	120553037
79	NC_008740	GAATG	2	10	120820	120829	40 %	20 %	40 %	0 %	120553037
80	NC_008740	ATCGT	2	10	122230	122239	20 %	40 %	20 %	20 %	120553039
81	NC_008740	TGGCG	2	10	123179	123188	0 %	20 %	60 %	20 %	120553039
82	NC_008740	TCGGG	2	10	123493	123502	0 %	20 %	60 %	20 %	120553040
83	NC_008740	CCCGG	2	10	124537	124546	0 %	0 %	40 %	60 %	120553040
84	NC_008740	ATGGA	2	10	127147	127156	40 %	20 %	40 %	0 %	120553043
85	NC_008740	CCTGG	2	10	127419	127428	0 %	20 %	40 %	40 %	120553043
86	NC_008740	CCGGG	2	10	133421	133430	0 %	0 %	60 %	40 %	120553050
87	NC_008740	AAGCA	2	10	133665	133674	60 %	0 %	20 %	20 %	120553050
88	NC_008740	CGGGC	2	10	135686	135695	0 %	0 %	60 %	40 %	120553052
89	NC_008740	CCCGG	2	10	136576	136585	0 %	0 %	40 %	60 %	120553053
90	NC_008740	GCCAG	2	10	136623	136632	20 %	0 %	40 %	40 %	120553053
91	NC_008740	CGTGG	2	10	136764	136773	0 %	20 %	60 %	20 %	120553053
92	NC_008740	TGCCC	2	10	136783	136792	0 %	20 %	20 %	60 %	120553053
93	NC_008740	CTGGC	2	10	139579	139588	0 %	20 %	40 %	40 %	120553055
94	NC_008740	GCGTG	2	10	146388	146397	0 %	20 %	60 %	20 %	120553062
95	NC_008740	GTCCA	2	10	147736	147745	20 %	20 %	20 %	40 %	120553064
96	NC_008740	CCAGT	2	10	147906	147915	20 %	20 %	20 %	40 %	120553064
97	NC_008740	GGCCA	2	10	149219	149228	20 %	0 %	40 %	40 %	120553065
98	NC_008740	TCGTT	2	10	151576	151585	0 %	60 %	20 %	20 %	120553067
99	NC_008740	CATGA	2	10	152736	152745	40 %	20 %	20 %	20 %	120553068
100	NC_008740	GCCTG	2	10	153615	153624	0 %	20 %	40 %	40 %	120553069
101	NC_008740	GACTG	2	10	155109	155118	20 %	20 %	40 %	20 %	120553070
102	NC_008740	CGGTG	2	10	162348	162357	0 %	20 %	60 %	20 %	120553078
103	NC_008740	GTGGC	2	10	163134	163143	0 %	20 %	60 %	20 %	120553078
104	NC_008740	GCTGA	2	10	164490	164499	20 %	20 %	40 %	20 %	120553079
105	NC_008740	GGGCC	2	10	165470	165479	0 %	0 %	60 %	40 %	120553079
106	NC_008740	TCCAA	2	10	167914	167923	40 %	20 %	0 %	40 %	120553081
107	NC_008740	GCCCG	2	10	172252	172261	0 %	0 %	40 %	60 %	120553085
108	NC_008740	AACGG	2	10	176083	176092	40 %	0 %	40 %	20 %	120553088
109	NC_008740	GGGTT	2	10	176294	176303	0 %	40 %	60 %	0 %	120553088
110	NC_008740	TGCAG	2	10	178299	178308	20 %	20 %	40 %	20 %	120553090
111	NC_008740	CCGAT	2	10	180474	180483	20 %	20 %	20 %	40 %	120553092
112	NC_008740	GCTTG	2	10	182753	182762	0 %	40 %	40 %	20 %	120553093
113	NC_008740	ATTCG	2	10	185125	185134	20 %	40 %	20 %	20 %	120553098
114	NC_008740	CCATG	2	10	200922	200931	20 %	20 %	20 %	40 %	120553111
115	NC_008740	AGGCA	2	10	201413	201422	40 %	0 %	40 %	20 %	120553111
116	NC_008740	CCATG	2	10	208975	208984	20 %	20 %	20 %	40 %	120553116
117	NC_008740	GCCAG	2	10	212233	212242	20 %	0 %	40 %	40 %	120553119
118	NC_008740	CCGGG	2	10	212560	212569	0 %	0 %	60 %	40 %	120553119
119	NC_008740	GGTTT	2	10	213737	213746	0 %	60 %	40 %	0 %	120553120
120	NC_008740	TGGCC	2	10	217847	217856	0 %	20 %	40 %	40 %	120553122
121	NC_008740	GGCAA	2	10	219960	219969	40 %	0 %	40 %	20 %	120553124
122	NC_008740	GTGCG	2	10	220698	220707	0 %	20 %	60 %	20 %	120553125
123	NC_008740	CTGCT	2	10	223204	223213	0 %	40 %	20 %	40 %	120553128
124	NC_008740	GATTC	2	10	225805	225814	20 %	40 %	20 %	20 %	120553130
125	NC_008740	AGCCA	2	10	226676	226685	40 %	0 %	20 %	40 %	120553130
126	NC_008740	AGCCA	2	10	230819	230828	40 %	0 %	20 %	40 %	120553134
127	NC_008740	GCAGA	2	10	237627	237636	40 %	0 %	40 %	20 %	120553139
128	NC_008740	GGATC	2	10	238184	238193	20 %	20 %	40 %	20 %	120553139
129	NC_008740	CATGC	2	10	243084	243093	20 %	20 %	20 %	40 %	120553148
130	NC_008740	TGGCA	2	10	248630	248639	20 %	20 %	40 %	20 %	120553152
131	NC_008740	CCGGC	2	10	248731	248740	0 %	0 %	40 %	60 %	120553152
132	NC_008740	TTAAA	2	10	249956	249965	60 %	40 %	0 %	0 %	120553153
133	NC_008740	TTTCC	2	10	254919	254928	0 %	60 %	0 %	40 %	120553160
134	NC_008740	ACAGC	2	10	255204	255213	40 %	0 %	20 %	40 %	120553160
135	NC_008740	CCATG	2	10	262189	262198	20 %	20 %	20 %	40 %	120553168
136	NC_008740	TTTTC	2	10	272200	272209	0 %	80 %	0 %	20 %	120553172
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256	NC_008740	GTTCT	2	10	508746	508755	0 %	60 %	20 %	20 %	120553382
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