MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	CCCCAT	2	12	3728	3739	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	120537040
2	NC_008739	TCAGGA	2	12	4010	4021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120537040
3	NC_008739	GCACGG	2	12	6679	6690	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120537044
4	NC_008739	GCTTGT	2	12	29211	29222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120537064
5	NC_008739	GCTTTG	2	12	31084	31095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120537066
6	NC_008739	GAACGT	2	12	31263	31274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120537066
7	NC_008739	CTTTTG	2	12	31536	31547	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	120537066
8	NC_008739	CCATGG	2	12	36402	36413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120537072
9	NC_008739	TTTCCT	2	12	38988	38999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120537074
10	NC_008739	GCGATG	2	12	41009	41020	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120537075
11	NC_008739	CCAGGG	2	12	41591	41602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120537076
12	NC_008739	GGTTCC	2	12	43595	43606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120537078
13	NC_008739	AGCTTT	2	12	48482	48493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120537084
14	NC_008739	TTCAAA	2	12	50444	50455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	120537085
15	NC_008739	CCAGAT	3	18	55029	55046	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120537087
16	NC_008739	CAGCTC	2	12	57336	57347	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120537090
17	NC_008739	TTATTG	2	12	61249	61260	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120537097
18	NC_008739	ACCGAT	2	12	74014	74025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120537107
19	NC_008739	TCCACT	2	12	75319	75330	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	120537108
20	NC_008739	CCCTGA	2	12	78453	78464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120537111
21	NC_008739	AGTTCC	2	12	79162	79173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120537112
22	NC_008739	ACAGCA	2	12	79699	79710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120537113
23	NC_008739	CAGCTG	2	12	80198	80209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120537113
24	NC_008739	TGGACG	2	12	84962	84973	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120537117
25	NC_008739	GTGCCG	2	12	89884	89895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120537122
26	NC_008739	ACTCTT	2	12	92886	92897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	120537125
27	NC_008739	TTGGAT	2	12	95404	95415	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120537128
28	NC_008739	GGGCAG	2	12	103850	103861	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120537137
29	NC_008739	TGTCCC	2	12	105154	105165	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120537138
30	NC_008739	AGAACC	2	12	105970	105981	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120537138
31	NC_008739	CTTGCT	2	12	114657	114668	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	120537149
32	NC_008739	GACGAG	2	12	128963	128974	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120537161
33	NC_008739	TATCGG	2	12	131829	131840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120537163
34	NC_008739	ATTCTG	2	12	134978	134989	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120537167
35	NC_008739	GGCTTT	2	12	138208	138219	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120537171
36	NC_008739	GCTGTT	2	12	138792	138803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120537171
37	NC_008739	CCTGCT	2	12	140449	140460	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120537173
38	NC_008739	GCGCGT	2	12	142351	142362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120537175
39	NC_008739	GAGCTG	2	12	148430	148441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120537184
40	NC_008739	CACGAC	2	12	151688	151699	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120537188
41	NC_008739	TTGTAC	2	12	151911	151922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120537189
42	NC_008739	AGGCTA	2	12	153037	153048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120537191
43	NC_008739	TCCTGG	2	12	156134	156145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120537194
44	NC_008739	CGCCAG	2	12	156698	156709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120537195
45	NC_008739	GCTTCC	2	12	157319	157330	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120537195
46	NC_008739	ACTGAA	2	12	162242	162253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120537200
47	NC_008739	GCCGGA	2	12	163378	163389	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120537201
48	NC_008739	CGTCTT	2	12	167410	167421	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	120537206
49	NC_008739	CTGGTT	2	12	170690	170701	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120537208
50	NC_008739	CACCGA	2	12	171539	171550	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120537208
51	NC_008739	TCAAGG	2	12	176788	176799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120537214
52	NC_008739	ACCGGT	2	12	178025	178036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120537215
53	NC_008739	TCGTTA	2	12	178561	178572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120537216
54	NC_008739	CCGGCA	2	12	180104	180115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120537216
55	NC_008739	AGCAGG	2	12	190379	190390	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120537220
56	NC_008739	TCCAGA	2	12	190917	190928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120537221
57	NC_008739	CCCAAG	2	12	192516	192527	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120537221
58	NC_008739	GGTATA	2	12	195823	195834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120537222
59	NC_008739	TCCGGC	2	12	198136	198147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120537225
60	NC_008739	GTTTGG	2	12	199848	199859	0 %	50 %	50 %	0 %	120537227
61	NC_008739	CCGGCA	2	12	210427	210438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120537236
62	NC_008739	ATATCA	2	12	210493	210504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	120537236

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.