MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	GCTTC	2	10	6412	6421	0 %	40 %	20 %	40 %	120537044
2	NC_008739	TGGGC	2	10	7632	7641	0 %	20 %	60 %	20 %	120537045
3	NC_008739	CTCTG	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	120537055
4	NC_008739	GGTCA	2	10	18898	18907	20 %	20 %	40 %	20 %	120537057
5	NC_008739	CGATG	2	10	21028	21037	20 %	20 %	40 %	20 %	120537058
6	NC_008739	TCCCG	2	10	23594	23603	0 %	20 %	20 %	60 %	120537059
7	NC_008739	CCTGC	2	10	24538	24547	0 %	20 %	20 %	60 %	120537061
8	NC_008739	ATCGT	2	10	29762	29771	20 %	40 %	20 %	20 %	120537064
9	NC_008739	CGGGC	2	10	32583	32592	0 %	0 %	60 %	40 %	120537067
10	NC_008739	TCTGA	2	10	35077	35086	20 %	40 %	20 %	20 %	120537071
11	NC_008739	GCAGG	2	10	36383	36392	20 %	0 %	60 %	20 %	120537072
12	NC_008739	GCCTT	2	10	39212	39221	0 %	40 %	20 %	40 %	120537074
13	NC_008739	GGATC	2	10	39537	39546	20 %	20 %	40 %	20 %	120537074
14	NC_008739	TTCGC	2	10	39984	39993	0 %	40 %	20 %	40 %	120537074
15	NC_008739	GTTGA	2	10	43090	43099	20 %	40 %	40 %	0 %	120537078
16	NC_008739	AGTGA	2	10	47861	47870	40 %	20 %	40 %	0 %	120537083
17	NC_008739	AAAGA	2	10	51315	51324	80 %	0 %	20 %	0 %	120537086
18	NC_008739	AGAGA	2	10	51346	51355	60 %	0 %	40 %	0 %	120537086
19	NC_008739	AGGGC	3	15	52138	52152	20 %	0 %	60 %	20 %	120537086
20	NC_008739	CCTGG	2	10	55328	55337	0 %	20 %	40 %	40 %	120537087
21	NC_008739	GGATC	2	10	56395	56404	20 %	20 %	40 %	20 %	120537088
22	NC_008739	ACCAA	2	10	56448	56457	60 %	0 %	0 %	40 %	120537088
23	NC_008739	TGATC	2	10	57104	57113	20 %	40 %	20 %	20 %	120537090
24	NC_008739	GGTGG	2	10	60396	60405	0 %	20 %	80 %	0 %	120537095
25	NC_008739	CTGGA	2	10	60988	60997	20 %	20 %	40 %	20 %	120537096
26	NC_008739	CCCTT	2	10	64398	64407	0 %	40 %	0 %	60 %	120537100
27	NC_008739	TTTGG	2	10	64732	64741	0 %	60 %	40 %	0 %	120537100
28	NC_008739	CTTGC	2	10	68052	68061	0 %	40 %	20 %	40 %	120537102
29	NC_008739	AGGAT	2	10	72701	72710	40 %	20 %	40 %	0 %	120537107
30	NC_008739	CGCAG	2	10	73804	73813	20 %	0 %	40 %	40 %	120537107
31	NC_008739	GCGCC	2	10	74067	74076	0 %	0 %	40 %	60 %	120537107
32	NC_008739	TGCCT	2	10	74676	74685	0 %	40 %	20 %	40 %	120537107
33	NC_008739	CAGGA	2	10	78754	78763	40 %	0 %	40 %	20 %	120537112
34	NC_008739	CCCAC	2	10	81549	81558	20 %	0 %	0 %	80 %	120537114
35	NC_008739	GCCTC	2	10	82135	82144	0 %	20 %	20 %	60 %	120537115
36	NC_008739	GACCA	2	10	84913	84922	40 %	0 %	20 %	40 %	120537117
37	NC_008739	GCGAT	2	10	85061	85070	20 %	20 %	40 %	20 %	120537117
38	NC_008739	CGTGA	2	10	87415	87424	20 %	20 %	40 %	20 %	120537119
39	NC_008739	ACGCC	2	10	90000	90009	20 %	0 %	20 %	60 %	120537122
40	NC_008739	CCGAT	2	10	90586	90595	20 %	20 %	20 %	40 %	120537123
41	NC_008739	ACTCC	2	10	91291	91300	20 %	20 %	0 %	60 %	120537123
42	NC_008739	CTCGA	2	10	93988	93997	20 %	20 %	20 %	40 %	120537126
43	NC_008739	ACCGG	2	10	98345	98354	20 %	0 %	40 %	40 %	120537131
44	NC_008739	TGCCG	2	10	101708	101717	0 %	20 %	40 %	40 %	120537135
45	NC_008739	TTGGC	2	10	105902	105911	0 %	40 %	40 %	20 %	120537138
46	NC_008739	GCCTC	2	10	108519	108528	0 %	20 %	20 %	60 %	120537142
47	NC_008739	GAAAC	2	10	108960	108969	60 %	0 %	20 %	20 %	120537142
48	NC_008739	GCGGT	2	10	115599	115608	0 %	20 %	60 %	20 %	120537150
49	NC_008739	ACCGC	2	10	118679	118688	20 %	0 %	20 %	60 %	120537154
50	NC_008739	GCCTG	2	10	120426	120435	0 %	20 %	40 %	40 %	120537156
51	NC_008739	GATCA	2	10	122897	122906	40 %	20 %	20 %	20 %	120537158
52	NC_008739	ACCAG	2	10	123381	123390	40 %	0 %	20 %	40 %	120537158
53	NC_008739	TGGCA	2	10	130258	130267	20 %	20 %	40 %	20 %	120537161
54	NC_008739	CCGGC	2	10	130359	130368	0 %	0 %	40 %	60 %	120537161
55	NC_008739	TTAAA	2	10	131584	131593	60 %	40 %	0 %	0 %	120537162
56	NC_008739	TTTCC	2	10	136547	136556	0 %	60 %	0 %	40 %	120537169
57	NC_008739	ACAGC	2	10	136832	136841	40 %	0 %	20 %	40 %	120537169
58	NC_008739	CCATG	2	10	143817	143826	20 %	20 %	20 %	40 %	120537177
59	NC_008739	GATCA	2	10	148664	148673	40 %	20 %	20 %	20 %	120537184
60	NC_008739	AATCC	2	10	149686	149695	40 %	20 %	0 %	40 %	120537186
61	NC_008739	ACAGG	2	10	151101	151110	40 %	0 %	40 %	20 %	120537187
62	NC_008739	AACCA	2	10	151949	151958	60 %	0 %	0 %	40 %	120537189
63	NC_008739	CACTG	2	10	157462	157471	20 %	20 %	20 %	40 %	120537195
64	NC_008739	GAACA	2	10	157865	157874	60 %	0 %	20 %	20 %	120537195
65	NC_008739	GATGC	2	10	161374	161383	20 %	20 %	40 %	20 %	120537199
66	NC_008739	TTCCG	2	10	161428	161437	0 %	40 %	20 %	40 %	120537199
67	NC_008739	CTGAT	2	10	168695	168704	20 %	40 %	20 %	20 %	120537207
68	NC_008739	TTCAG	2	10	169202	169211	20 %	40 %	20 %	20 %	120537207
69	NC_008739	ATAAC	2	10	169280	169289	60 %	20 %	0 %	20 %	120537207
70	NC_008739	TCAGG	2	10	169535	169544	20 %	20 %	40 %	20 %	120537207
71	NC_008739	CAGTT	2	10	170770	170779	20 %	40 %	20 %	20 %	120537208
72	NC_008739	AACCG	2	10	171219	171228	40 %	0 %	20 %	40 %	120537208
73	NC_008739	TTTTC	2	10	173693	173702	0 %	80 %	0 %	20 %	120537209
74	NC_008739	GCGTT	2	10	175647	175656	0 %	40 %	40 %	20 %	120537213
75	NC_008739	TCGAT	2	10	178823	178832	20 %	40 %	20 %	20 %	120537216
76	NC_008739	CGTAT	2	10	179278	179287	20 %	40 %	20 %	20 %	120537216
77	NC_008739	CCGCA	2	10	180456	180465	20 %	0 %	20 %	60 %	120537216
78	NC_008739	CCCAC	2	10	183989	183998	20 %	0 %	0 %	80 %	120537217
79	NC_008739	GCCTC	2	10	184575	184584	0 %	20 %	20 %	60 %	120537218
80	NC_008739	CCAAT	2	10	184981	184990	40 %	20 %	0 %	40 %	120537219
81	NC_008739	GTTCA	2	10	185366	185375	20 %	40 %	20 %	20 %	120537219
82	NC_008739	AGGTG	2	10	191103	191112	20 %	20 %	60 %	0 %	120537221
83	NC_008739	TTTGC	2	10	192481	192490	0 %	60 %	20 %	20 %	120537221
84	NC_008739	ATGGG	2	10	195291	195300	20 %	20 %	60 %	0 %	120537222
85	NC_008739	GTGGC	2	10	196928	196937	0 %	20 %	60 %	20 %	120537223
86	NC_008739	GCCCT	2	10	198791	198800	0 %	20 %	20 %	60 %	120537226
87	NC_008739	ACAGG	2	10	203441	203450	40 %	0 %	40 %	20 %	120537230
88	NC_008739	GCAGG	2	10	207559	207568	20 %	0 %	60 %	20 %	120537234
89	NC_008739	TGAAT	2	10	208151	208160	40 %	40 %	20 %	0 %	120537234

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.