MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	CAAT	2	8	257	264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008739	CAAA	2	8	2960	2967	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008739	ACGA	2	8	3048	3055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008739	AGCA	2	8	4505	4512	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008739	TTGG	2	8	5798	5805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008739	CAAC	2	8	7996	8003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008739	CAAA	2	8	8151	8158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008739	GCTT	2	8	8195	8202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008739	TCAA	2	8	9375	9382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008739	GAAT	2	8	17486	17493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008739	ATGG	2	8	21586	21593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008739	GATG	2	8	22143	22150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008739	AGGT	2	8	22197	22204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008739	GGTT	2	8	34611	34618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008739	AGCG	2	8	35232	35239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008739	TAAA	2	8	35453	35460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008739	TGCA	2	8	36826	36833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008739	GCTG	2	8	37532	37539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008739	CCTT	2	8	37717	37724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008739	ATCA	2	8	44395	44402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008739	GCTT	2	8	44585	44592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008739	GGTC	2	8	47436	47443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008739	GCTT	2	8	52581	52588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008739	GCTT	2	8	52634	52641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008739	TCTA	2	8	52748	52755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008739	ATCC	2	8	59020	59027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008739	GTTG	2	8	59031	59038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008739	CAAC	2	8	59055	59062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008739	CAAT	2	8	59345	59352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008739	GGTC	2	8	59440	59447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008739	GCAA	2	8	59525	59532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008739	TCAC	2	8	59613	59620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008739	ACGA	2	8	61050	61057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008739	TGAG	2	8	65401	65408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008739	AATC	2	8	68565	68572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008739	TCAC	2	8	69938	69945	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008739	ACGA	2	8	70445	70452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008739	CAAC	2	8	77258	77265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008739	GGAT	2	8	77269	77276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008739	CCGT	2	8	89024	89031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008739	AATA	2	8	94045	94052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008739	TTGG	2	8	96827	96834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008739	TAAA	2	8	97130	97137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008739	TTTG	2	8	98948	98955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008739	TTTG	2	8	105075	105082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008739	TGGT	2	8	107907	107914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008739	CTTT	2	8	111259	111266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008739	ATGA	2	8	112178	112185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008739	GCCG	2	8	112371	112378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008739	ACCC	2	8	113847	113854	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_008739	GCGT	2	8	119166	119173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008739	TTAG	2	8	119586	119593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008739	ATTT	2	8	119676	119683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008739	TAGC	2	8	119841	119848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008739	AGGC	2	8	122391	122398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008739	CCTT	2	8	123973	123980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008739	ACTA	2	8	125245	125252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008739	GGTA	2	8	125455	125462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008739	ACGG	2	8	134012	134019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008739	GCCC	2	8	134026	134033	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_008739	AAAC	2	8	135932	135939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008739	TTTC	2	8	144330	144337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008739	TCAC	2	8	144392	144399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008739	TCCG	2	8	145217	145224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008739	CTGG	2	8	145500	145507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008739	CTTT	2	8	146022	146029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008739	CGCT	2	8	146647	146654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008739	GGTT	2	8	149119	149126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008739	GTTT	2	8	153671	153678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008739	TGAG	2	8	160765	160772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008739	CTGG	2	8	160825	160832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008739	CCAG	2	8	163983	163990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008739	AGAC	2	8	165324	165331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008739	ATGG	2	8	167132	167139	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008739	GGCT	2	8	167503	167510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008739	GGGC	2	8	175374	175381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008739	GCCG	2	8	182315	182322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008739	CCAT	2	8	182645	182652	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008739	TCGT	2	8	183484	183491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008739	GATT	2	8	189093	189100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008739	TTGA	2	8	190501	190508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008739	CTTG	2	8	196974	196981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008739	AAAC	2	8	197233	197240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008739	TGTT	2	8	200297	200304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008739	CAGG	2	8	201259	201266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008739	CAAC	2	8	202713	202720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008739	CCGA	2	8	203671	203678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008739	CTCA	2	8	206062	206069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008739	TTGC	2	8	212113	212120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008739	GCAT	2	8	212126	212133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008739	CCGT	2	8	212956	212963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.