MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	TA	3	6	543	548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008739	TA	3	6	986	991	50 %	50 %	0 %	0 %	120537038
3	NC_008739	GA	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	120537038
4	NC_008739	AG	3	6	1612	1617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008739	CT	3	6	1816	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	120537039
6	NC_008739	TA	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	120537039
7	NC_008739	GA	3	6	2989	2994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008739	CT	3	6	3353	3358	0 %	50 %	0 %	50 %	120537040
9	NC_008739	AT	3	6	3895	3900	50 %	50 %	0 %	0 %	120537040
10	NC_008739	TG	3	6	4024	4029	0 %	50 %	50 %	0 %	120537040
11	NC_008739	CA	3	6	6098	6103	50 %	0 %	0 %	50 %	120537043
12	NC_008739	GT	3	6	6297	6302	0 %	50 %	50 %	0 %	120537044
13	NC_008739	CG	3	6	7217	7222	0 %	0 %	50 %	50 %	120537045
14	NC_008739	AC	4	8	7929	7936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008739	AT	3	6	8113	8118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008739	AG	3	6	8337	8342	50 %	0 %	50 %	0 %	120537046
17	NC_008739	CA	3	6	8423	8428	50 %	0 %	0 %	50 %	120537046
18	NC_008739	AT	3	6	8493	8498	50 %	50 %	0 %	0 %	120537046
19	NC_008739	GA	3	6	8703	8708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008739	GC	3	6	8927	8932	0 %	0 %	50 %	50 %	120537047
21	NC_008739	GA	3	6	9071	9076	50 %	0 %	50 %	0 %	120537047
22	NC_008739	GA	3	6	9145	9150	50 %	0 %	50 %	0 %	120537047
23	NC_008739	GA	3	6	9222	9227	50 %	0 %	50 %	0 %	120537047
24	NC_008739	GC	3	6	9581	9586	0 %	0 %	50 %	50 %	120537048
25	NC_008739	CG	3	6	9963	9968	0 %	0 %	50 %	50 %	120537049
26	NC_008739	CT	3	6	10035	10040	0 %	50 %	0 %	50 %	120537049
27	NC_008739	CT	3	6	10138	10143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008739	AG	3	6	10196	10201	50 %	0 %	50 %	0 %	120537050
29	NC_008739	TG	3	6	10219	10224	0 %	50 %	50 %	0 %	120537050
30	NC_008739	TG	3	6	10603	10608	0 %	50 %	50 %	0 %	120537050
31	NC_008739	GA	3	6	10947	10952	50 %	0 %	50 %	0 %	120537050
32	NC_008739	TC	3	6	11861	11866	0 %	50 %	0 %	50 %	120537051
33	NC_008739	TA	3	6	11985	11990	50 %	50 %	0 %	0 %	120537051
34	NC_008739	TG	3	6	12414	12419	0 %	50 %	50 %	0 %	120537051
35	NC_008739	GA	3	6	12811	12816	50 %	0 %	50 %	0 %	120537052
36	NC_008739	AT	3	6	13189	13194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008739	TG	3	6	14016	14021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008739	GT	3	6	14694	14699	0 %	50 %	50 %	0 %	120537054
39	NC_008739	TC	3	6	15119	15124	0 %	50 %	0 %	50 %	120537054
40	NC_008739	GC	3	6	16093	16098	0 %	0 %	50 %	50 %	120537055
41	NC_008739	GA	3	6	17107	17112	50 %	0 %	50 %	0 %	120537055
42	NC_008739	CT	3	6	17703	17708	0 %	50 %	0 %	50 %	120537056
43	NC_008739	AG	3	6	18964	18969	50 %	0 %	50 %	0 %	120537057
44	NC_008739	TG	3	6	21318	21323	0 %	50 %	50 %	0 %	120537058
45	NC_008739	TG	3	6	21674	21679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008739	GA	3	6	22375	22380	50 %	0 %	50 %	0 %	120537059
47	NC_008739	AC	3	6	23363	23368	50 %	0 %	0 %	50 %	120537059
48	NC_008739	CA	3	6	26520	26525	50 %	0 %	0 %	50 %	120537062
49	NC_008739	GC	3	6	27027	27032	0 %	0 %	50 %	50 %	120537063
50	NC_008739	AG	3	6	28972	28977	50 %	0 %	50 %	0 %	120537064
51	NC_008739	CT	4	8	30355	30362	0 %	50 %	0 %	50 %	120537064
52	NC_008739	GA	3	6	32143	32148	50 %	0 %	50 %	0 %	120537066
53	NC_008739	AC	3	6	33099	33104	50 %	0 %	0 %	50 %	120537067
54	NC_008739	AG	3	6	34991	34996	50 %	0 %	50 %	0 %	120537071
55	NC_008739	AT	3	6	35508	35513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008739	TG	3	6	35553	35558	0 %	50 %	50 %	0 %	120537072
57	NC_008739	GC	3	6	36276	36281	0 %	0 %	50 %	50 %	120537072
58	NC_008739	CA	3	6	37201	37206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008739	TA	3	6	39340	39345	50 %	50 %	0 %	0 %	120537074
60	NC_008739	TC	3	6	40303	40308	0 %	50 %	0 %	50 %	120537074
61	NC_008739	TG	3	6	41030	41035	0 %	50 %	50 %	0 %	120537075
62	NC_008739	CT	4	8	41272	41279	0 %	50 %	0 %	50 %	120537076
63	NC_008739	GA	3	6	43894	43899	50 %	0 %	50 %	0 %	120537079
64	NC_008739	GT	4	8	44190	44197	0 %	50 %	50 %	0 %	120537079
65	NC_008739	CT	3	6	46045	46050	0 %	50 %	0 %	50 %	120537081
66	NC_008739	TC	3	6	48002	48007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008739	TC	3	6	48071	48076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008739	GA	4	8	48375	48382	50 %	0 %	50 %	0 %	120537084
69	NC_008739	TC	3	6	48658	48663	0 %	50 %	0 %	50 %	120537084
70	NC_008739	AG	4	8	48668	48675	50 %	0 %	50 %	0 %	120537084
71	NC_008739	AC	3	6	48726	48731	50 %	0 %	0 %	50 %	120537084
72	NC_008739	TC	3	6	49056	49061	0 %	50 %	0 %	50 %	120537084
73	NC_008739	CT	3	6	49497	49502	0 %	50 %	0 %	50 %	120537085
74	NC_008739	CT	3	6	49764	49769	0 %	50 %	0 %	50 %	120537085
75	NC_008739	CG	3	6	50784	50789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008739	AG	3	6	51387	51392	50 %	0 %	50 %	0 %	120537086
77	NC_008739	AC	3	6	51758	51763	50 %	0 %	0 %	50 %	120537086
78	NC_008739	TG	3	6	52949	52954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008739	AG	3	6	53056	53061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008739	CT	3	6	54216	54221	0 %	50 %	0 %	50 %	120537087
81	NC_008739	AC	3	6	54361	54366	50 %	0 %	0 %	50 %	120537087
82	NC_008739	CA	3	6	54594	54599	50 %	0 %	0 %	50 %	120537087
83	NC_008739	GA	3	6	55313	55318	50 %	0 %	50 %	0 %	120537087
84	NC_008739	AG	3	6	55486	55491	50 %	0 %	50 %	0 %	120537087
85	NC_008739	GA	3	6	56313	56318	50 %	0 %	50 %	0 %	120537088
86	NC_008739	TC	3	6	56377	56382	0 %	50 %	0 %	50 %	120537088
87	NC_008739	GA	3	6	56659	56664	50 %	0 %	50 %	0 %	120537089
88	NC_008739	TC	3	6	56671	56676	0 %	50 %	0 %	50 %	120537089
89	NC_008739	TC	3	6	59483	59488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008739	CT	3	6	59910	59915	0 %	50 %	0 %	50 %	120537094
91	NC_008739	AG	3	6	59961	59966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008739	GC	3	6	60346	60351	0 %	0 %	50 %	50 %	120537095
93	NC_008739	AT	3	6	61525	61530	50 %	50 %	0 %	0 %	120537097
94	NC_008739	CG	4	8	62101	62108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008739	AG	3	6	62446	62451	50 %	0 %	50 %	0 %	120537098
96	NC_008739	CT	3	6	62476	62481	0 %	50 %	0 %	50 %	120537098
97	NC_008739	GC	3	6	62713	62718	0 %	0 %	50 %	50 %	120537098
98	NC_008739	CA	3	6	63305	63310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008739	GC	3	6	65073	65078	0 %	0 %	50 %	50 %	120537100
100	NC_008739	AG	3	6	65234	65239	50 %	0 %	50 %	0 %	120537100
101	NC_008739	TA	3	6	66099	66104	50 %	50 %	0 %	0 %	120537101
102	NC_008739	TA	3	6	68505	68510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008739	CT	3	6	70235	70240	0 %	50 %	0 %	50 %	120537105
104	NC_008739	AG	3	6	70286	70291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008739	GC	3	6	70671	70676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008739	CT	3	6	71488	71493	0 %	50 %	0 %	50 %	120537106
107	NC_008739	AG	3	6	72667	72672	50 %	0 %	50 %	0 %	120537107
108	NC_008739	AG	3	6	73950	73955	50 %	0 %	50 %	0 %	120537107
109	NC_008739	AT	3	6	76201	76206	50 %	50 %	0 %	0 %	120537108
110	NC_008739	GT	3	6	76295	76300	0 %	50 %	50 %	0 %	120537108
111	NC_008739	TC	3	6	76747	76752	0 %	50 %	0 %	50 %	120537109
112	NC_008739	TC	3	6	78095	78100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008739	GC	3	6	78215	78220	0 %	0 %	50 %	50 %	120537111
114	NC_008739	AG	3	6	78537	78542	50 %	0 %	50 %	0 %	120537111
115	NC_008739	GC	3	6	79256	79261	0 %	0 %	50 %	50 %	120537112
116	NC_008739	CG	3	6	80860	80865	0 %	0 %	50 %	50 %	120537113
117	NC_008739	GC	3	6	81604	81609	0 %	0 %	50 %	50 %	120537114
118	NC_008739	CT	3	6	81989	81994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008739	AG	3	6	82040	82045	50 %	0 %	50 %	0 %	120537115
120	NC_008739	GC	3	6	83004	83009	0 %	0 %	50 %	50 %	120537116
121	NC_008739	GC	3	6	84420	84425	0 %	0 %	50 %	50 %	120537117
122	NC_008739	CT	3	6	85704	85709	0 %	50 %	0 %	50 %	120537117
123	NC_008739	GC	3	6	85864	85869	0 %	0 %	50 %	50 %	120537117
124	NC_008739	TA	3	6	88584	88589	50 %	50 %	0 %	0 %	120537121
125	NC_008739	CG	3	6	91345	91350	0 %	0 %	50 %	50 %	120537123
126	NC_008739	GC	3	6	91976	91981	0 %	0 %	50 %	50 %	120537124
127	NC_008739	TC	3	6	93193	93198	0 %	50 %	0 %	50 %	120537126
128	NC_008739	GA	3	6	94092	94097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008739	GA	3	6	95627	95632	50 %	0 %	50 %	0 %	120537129
130	NC_008739	TG	3	6	95846	95851	0 %	50 %	50 %	0 %	120537129
131	NC_008739	TC	3	6	96218	96223	0 %	50 %	0 %	50 %	120537130
132	NC_008739	CA	3	6	96864	96869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008739	GA	3	6	96881	96886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008739	CA	4	8	97279	97286	50 %	0 %	0 %	50 %	120537131
135	NC_008739	CG	3	6	97444	97449	0 %	0 %	50 %	50 %	120537131
136	NC_008739	TC	3	6	98101	98106	0 %	50 %	0 %	50 %	120537131
137	NC_008739	CA	3	6	100380	100385	50 %	0 %	0 %	50 %	120537133
138	NC_008739	GA	3	6	101241	101246	50 %	0 %	50 %	0 %	120537134
139	NC_008739	TC	3	6	102821	102826	0 %	50 %	0 %	50 %	120537136
140	NC_008739	GA	3	6	104379	104384	50 %	0 %	50 %	0 %	120537137
141	NC_008739	AT	3	6	105045	105050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008739	CA	3	6	105087	105092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008739	GC	3	6	105320	105325	0 %	0 %	50 %	50 %	120537138
144	NC_008739	GT	4	8	106231	106238	0 %	50 %	50 %	0 %	120537139
145	NC_008739	CT	3	6	106506	106511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008739	GA	3	6	107459	107464	50 %	0 %	50 %	0 %	120537141
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.