MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	CCCATC	2	12	5077	5088	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	120536827
2	NC_008738	CCGAGT	2	12	5573	5584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536828
3	NC_008738	AACGAA	2	12	7210	7221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	120536830
4	NC_008738	GACGAG	2	12	14901	14912	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120536836
5	NC_008738	CTGGTT	2	12	24000	24011	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120536846
6	NC_008738	TGCCGC	2	12	24645	24656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120536847
7	NC_008738	CCAACA	2	12	28436	28447	50 %	0 %	0 %	50 %	120536849
8	NC_008738	CAGCAA	2	12	32932	32943	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120536855
9	NC_008738	GCCAGC	2	12	34887	34898	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120536857
10	NC_008738	GCCGGG	2	12	35275	35286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536857
11	NC_008738	AGGTGA	2	12	42631	42642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	120536866
12	NC_008738	ACCGTT	2	12	52558	52569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120536873
13	NC_008738	CGACAA	2	12	60247	60258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120536882
14	NC_008738	TTCCTG	2	12	63367	63378	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	120536884
15	NC_008738	CGAGAG	2	12	71224	71235	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120536890
16	NC_008738	TTAAGG	2	12	74660	74671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536892
17	NC_008738	GCATCC	2	12	76966	76977	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120536892
18	NC_008738	GCCTAT	2	12	79015	79026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120536892
19	NC_008738	CGGGAG	2	12	79189	79200	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120536892
20	NC_008738	AACAGA	2	12	79202	79213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	120536892
21	NC_008738	CGATCA	2	12	83145	83156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120536895
22	NC_008738	TTTTTG	2	12	83248	83259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	120536895
23	NC_008738	TTGTCG	2	12	84984	84995	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120536897
24	NC_008738	CCATAA	2	12	85461	85472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120536898
25	NC_008738	GGCGCC	2	12	87714	87725	0 %	0 %	50 %	50 %	120536900
26	NC_008738	CGGCAG	2	12	87867	87878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120536900
27	NC_008738	GCCCAG	2	12	91458	91469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120536902
28	NC_008738	CTTGAA	2	12	95509	95520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120536906
29	NC_008738	TGGCAT	2	12	96069	96080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120536907
30	NC_008738	GAAATG	2	12	96181	96192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120536907
31	NC_008738	TAAAGC	2	12	97116	97127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120536908
32	NC_008738	CCCTTG	2	12	101190	101201	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120536911
33	NC_008738	AGCAAT	2	12	102279	102290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120536912
34	NC_008738	CAGCGA	2	12	104456	104467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536914
35	NC_008738	TGGGCG	2	12	105363	105374	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	120536914
36	NC_008738	CCGACA	2	12	108385	108396	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120536917
37	NC_008738	ACCTGG	2	12	111750	111761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536921
38	NC_008738	GCCGAA	2	12	112265	112276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536921
39	NC_008738	CGCTTC	2	12	117269	117280	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120536926
40	NC_008738	CGGTAC	2	12	128171	128182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536938
41	NC_008738	ATGGCC	2	12	128762	128773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536939
42	NC_008738	TGGCTT	2	12	128863	128874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120536939
43	NC_008738	GTCGGT	2	12	137155	137166	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	120536947
44	NC_008738	ACCAGA	2	12	138006	138017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120536947
45	NC_008738	GTGCCA	2	12	140383	140394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536949
46	NC_008738	GTGAAA	2	12	145844	145855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120536955
47	NC_008738	GTCATC	2	12	145974	145985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120536955
48	NC_008738	GGGTTT	2	12	153566	153577	0 %	50 %	50 %	0 %	120536959
49	NC_008738	GCCCAG	2	12	158950	158961	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120536961
50	NC_008738	CCGGCG	2	12	178383	178394	0 %	0 %	50 %	50 %	120536973
51	NC_008738	GACTGA	2	12	178424	178435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120536973
52	NC_008738	AAACCC	2	12	179805	179816	50 %	0 %	0 %	50 %	120536974
53	NC_008738	GCGCCA	2	12	184904	184915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120536979
54	NC_008738	TCCGAA	2	12	188495	188506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120536983
55	NC_008738	CAGGCT	2	12	190769	190780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536984
56	NC_008738	ATACCT	2	12	196030	196041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536989
57	NC_008738	CCAACA	2	12	201988	201999	50 %	0 %	0 %	50 %	120536993
58	NC_008738	GATGAA	2	12	204178	204189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120536994
59	NC_008738	TCCAGC	2	12	206206	206217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120536998
60	NC_008738	GAGGCC	2	12	207210	207221	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120536999
61	NC_008738	ACTGGC	2	12	207845	207856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536999
62	NC_008738	GAGCTG	2	12	209014	209025	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120537001
63	NC_008738	ACGATG	2	12	211475	211486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120537004
64	NC_008738	CGTGAC	2	12	213368	213379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120537007
65	NC_008738	ACCGCG	2	12	213909	213920	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120537007
66	NC_008738	TTCGCC	2	12	214532	214543	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120537008
67	NC_008738	TGCGAT	2	12	218565	218576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120537014
68	NC_008738	AAGCCC	2	12	220045	220056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120537016
69	NC_008738	AAAACC	2	12	220807	220818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120537016
70	NC_008738	CTGCCG	2	12	221293	221304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120537016
71	NC_008738	GACACA	2	12	222539	222550	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120537018
72	NC_008738	ACTTCA	2	12	231433	231444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120537029
73	NC_008738	TGGCCA	2	12	232684	232695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120537031
74	NC_008738	CTGAAA	2	12	234057	234068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120537032
75	NC_008738	CCGCAT	2	12	237164	237175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120537035
76	NC_008738	ATGGAA	2	12	237753	237764	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120537035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.