MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	GCGAA	2	10	3293	3302	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008738	GGCTA	2	10	8942	8951	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008738	GCTGA	2	10	14196	14205	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008738	CAATA	2	10	14396	14405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008738	GACCA	2	10	16029	16038	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008738	GCCCA	2	10	26833	26842	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_008738	CCCGC	2	10	62689	62698	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8	NC_008738	AGGGG	3	15	65224	65238	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008738	AATTG	2	10	72125	72134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008738	ACCCA	2	10	96318	96327	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008738	TACAA	2	10	110775	110784	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008738	TCAAA	2	10	120114	120123	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008738	CAGGG	2	10	122147	122156	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008738	AGCCA	2	10	127926	127935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008738	AATGA	2	10	132009	132018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008738	CAATC	2	10	142169	142178	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008738	CCAAA	2	10	173218	173227	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008738	CCGTG	2	10	178976	178985	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008738	CCCCG	2	10	200431	200440	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_008738	ACCGC	2	10	227351	227360	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008738	CAACA	2	10	227472	227481	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.