MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	GCGG	2	8	3358	3365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008738	AAGC	2	8	4724	4731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008738	GCCC	2	8	6440	6447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008738	GGCT	2	8	10138	10145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008738	TCGG	2	8	10168	10175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008738	CAAT	2	8	10434	10441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008738	CTAT	2	8	11648	11655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008738	GCCG	2	8	14015	14022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008738	CGGC	2	8	16091	16098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008738	GCGA	2	8	16110	16117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008738	TAAC	2	8	16259	16266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008738	AAGA	2	8	26593	26600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008738	GCCT	2	8	26865	26872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008738	AGGG	2	8	29276	29283	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008738	GAGC	2	8	40866	40873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008738	CAGA	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008738	GAAA	2	8	47296	47303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008738	TCCG	2	8	47971	47978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008738	CCGC	2	8	49658	49665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_008738	CGAT	2	8	49747	49754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008738	CGCC	2	8	49793	49800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008738	CCGG	2	8	58655	58662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008738	GATC	2	8	58835	58842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008738	TACG	2	8	60841	60848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008738	ACGC	2	8	62424	62431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008738	AACT	2	8	62773	62780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008738	GCCA	2	8	65295	65302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008738	AATT	2	8	70585	70592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008738	ATAC	2	8	73656	73663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008738	GTCA	2	8	84007	84014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008738	GTGA	2	8	90261	90268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008738	CCCA	2	8	98676	98683	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008738	GAAT	2	8	98705	98712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008738	AACG	2	8	98747	98754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008738	CAGT	2	8	110838	110845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008738	GGGT	2	8	116800	116807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008738	GGCA	2	8	119080	119087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008738	ACGA	2	8	119098	119105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008738	TGCC	2	8	120154	120161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008738	AAGC	2	8	120312	120319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008738	AAGA	2	8	121019	121026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008738	TTGC	2	8	121220	121227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008738	CTTC	2	8	123405	123412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008738	ATAA	2	8	123810	123817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008738	ATGA	2	8	123871	123878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008738	AAAC	2	8	123984	123991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008738	CAAT	2	8	124182	124189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008738	CCGG	2	8	125096	125103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008738	GGAA	2	8	127845	127852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008738	GCCC	2	8	129183	129190	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_008738	AGCA	2	8	129625	129632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008738	AGGG	2	8	129671	129678	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008738	GCTT	2	8	131831	131838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008738	CCAA	2	8	145461	145468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008738	AGCC	2	8	153280	153287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008738	AGAC	2	8	160917	160924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008738	AATA	2	8	161724	161731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008738	GCAC	2	8	173073	173080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008738	ACGG	2	8	178850	178857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008738	ACCC	2	8	178896	178903	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_008738	CTCG	2	8	179207	179214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008738	CAAC	2	8	183611	183618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008738	AAGG	2	8	187850	187857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008738	ATAG	2	8	190594	190601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008738	AGAA	2	8	193192	193199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008738	GAAA	2	8	193286	193293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008738	CCAC	2	8	193354	193361	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_008738	GACT	2	8	196763	196770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008738	GATA	2	8	197985	197992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008738	CAAC	2	8	199994	200001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008738	CATC	2	8	200078	200085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008738	GCCT	2	8	200179	200186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008738	CGCA	2	8	200256	200263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008738	GAAG	2	8	200485	200492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008738	CAAC	2	8	200528	200535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008738	TCAT	2	8	205088	205095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008738	CGCC	2	8	205193	205200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_008738	ATAC	2	8	205229	205236	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008738	CGCC	2	8	206674	206681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_008738	ATGA	2	8	212256	212263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008738	AGGG	2	8	215306	215313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008738	CGCC	2	8	215347	215354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008738	ACCA	2	8	215434	215441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008738	AGAT	2	8	218122	218129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008738	CAAA	2	8	218438	218445	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008738	TGGA	2	8	218507	218514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008738	TTCA	2	8	222756	222763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008738	CGAC	2	8	222829	222836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008738	GCTT	2	8	224602	224609	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008738	GCCC	2	8	227426	227433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_008738	CATG	2	8	230889	230896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008738	CCTT	2	8	230900	230907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008738	CAAC	2	8	234580	234587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008738	GCCA	3	12	238055	238066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008738	GCCA	2	8	238110	238117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.