MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	AG	3	6	525	530	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
2	NC_008738	AG	3	6	789	794	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
3	NC_008738	GC	4	8	2427	2434	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
4	NC_008738	AG	3	6	2642	2647	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
5	NC_008738	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
6	NC_008738	AC	3	6	3851	3856	50 %	0 %	0 %	50 %	120536825
7	NC_008738	AT	3	6	4619	4624	50 %	50 %	0 %	0 %	120536826
8	NC_008738	GA	3	6	5262	5267	50 %	0 %	50 %	0 %	120536827
9	NC_008738	CG	3	6	5567	5572	0 %	0 %	50 %	50 %	120536828
10	NC_008738	CT	3	6	5657	5662	0 %	50 %	0 %	50 %	120536828
11	NC_008738	AC	3	6	6307	6312	50 %	0 %	0 %	50 %	120536829
12	NC_008738	AT	3	6	7353	7358	50 %	50 %	0 %	0 %	120536830
13	NC_008738	CT	3	6	7375	7380	0 %	50 %	0 %	50 %	120536830
14	NC_008738	CG	3	6	7512	7517	0 %	0 %	50 %	50 %	120536831
15	NC_008738	TG	3	6	8627	8632	0 %	50 %	50 %	0 %	120536831
16	NC_008738	GA	3	6	9325	9330	50 %	0 %	50 %	0 %	120536832
17	NC_008738	AT	3	6	9984	9989	50 %	50 %	0 %	0 %	120536832
18	NC_008738	TG	3	6	10537	10542	0 %	50 %	50 %	0 %	120536833
19	NC_008738	TA	3	6	11141	11146	50 %	50 %	0 %	0 %	120536833
20	NC_008738	AG	3	6	12945	12950	50 %	0 %	50 %	0 %	120536835
21	NC_008738	AT	3	6	13563	13568	50 %	50 %	0 %	0 %	120536835
22	NC_008738	GA	3	6	13828	13833	50 %	0 %	50 %	0 %	120536835
23	NC_008738	AG	3	6	14713	14718	50 %	0 %	50 %	0 %	120536836
24	NC_008738	GC	3	6	15477	15482	0 %	0 %	50 %	50 %	120536837
25	NC_008738	AC	4	8	17802	17809	50 %	0 %	0 %	50 %	120536838
26	NC_008738	CA	3	6	18212	18217	50 %	0 %	0 %	50 %	120536839
27	NC_008738	GA	3	6	18821	18826	50 %	0 %	50 %	0 %	120536840
28	NC_008738	GC	3	6	19261	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	120536841
29	NC_008738	GA	3	6	20017	20022	50 %	0 %	50 %	0 %	120536842
30	NC_008738	AG	3	6	20105	20110	50 %	0 %	50 %	0 %	120536842
31	NC_008738	CG	3	6	20622	20627	0 %	0 %	50 %	50 %	120536843
32	NC_008738	CG	4	8	21957	21964	0 %	0 %	50 %	50 %	120536843
33	NC_008738	GC	3	6	27842	27847	0 %	0 %	50 %	50 %	120536849
34	NC_008738	GC	3	6	31748	31753	0 %	0 %	50 %	50 %	120536853
35	NC_008738	GC	3	6	33065	33070	0 %	0 %	50 %	50 %	120536855
36	NC_008738	GC	3	6	33978	33983	0 %	0 %	50 %	50 %	120536856
37	NC_008738	TG	4	8	34445	34452	0 %	50 %	50 %	0 %	120536857
38	NC_008738	GT	3	6	35655	35660	0 %	50 %	50 %	0 %	120536858
39	NC_008738	GC	3	6	37179	37184	0 %	0 %	50 %	50 %	120536860
40	NC_008738	GC	3	6	38100	38105	0 %	0 %	50 %	50 %	120536861
41	NC_008738	CT	3	6	38718	38723	0 %	50 %	0 %	50 %	120536862
42	NC_008738	GA	3	6	39939	39944	50 %	0 %	50 %	0 %	120536863
43	NC_008738	GA	3	6	40148	40153	50 %	0 %	50 %	0 %	120536863
44	NC_008738	AG	3	6	40308	40313	50 %	0 %	50 %	0 %	120536863
45	NC_008738	GC	3	6	41031	41036	0 %	0 %	50 %	50 %	120536864
46	NC_008738	GA	4	8	41358	41365	50 %	0 %	50 %	0 %	120536864
47	NC_008738	AC	3	6	41455	41460	50 %	0 %	0 %	50 %	120536864
48	NC_008738	GC	3	6	45665	45670	0 %	0 %	50 %	50 %	120536866
49	NC_008738	AC	3	6	51107	51112	50 %	0 %	0 %	50 %	120536872
50	NC_008738	CG	3	6	52252	52257	0 %	0 %	50 %	50 %	120536873
51	NC_008738	CA	3	6	53197	53202	50 %	0 %	0 %	50 %	120536874
52	NC_008738	TG	3	6	54027	54032	0 %	50 %	50 %	0 %	120536875
53	NC_008738	AC	3	6	54511	54516	50 %	0 %	0 %	50 %	120536876
54	NC_008738	CG	3	6	54867	54872	0 %	0 %	50 %	50 %	120536876
55	NC_008738	GC	3	6	55549	55554	0 %	0 %	50 %	50 %	120536877
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60	NC_008738	TG	3	6	59295	59300	0 %	50 %	50 %	0 %	120536881
61	NC_008738	CA	3	6	59908	59913	50 %	0 %	0 %	50 %	120536881
62	NC_008738	GC	3	6	60169	60174	0 %	0 %	50 %	50 %	120536882
63	NC_008738	AC	3	6	60271	60276	50 %	0 %	0 %	50 %	120536882
64	NC_008738	GC	3	6	61154	61159	0 %	0 %	50 %	50 %	120536883
65	NC_008738	CA	3	6	61549	61554	50 %	0 %	0 %	50 %	120536883
66	NC_008738	CG	3	6	63858	63863	0 %	0 %	50 %	50 %	120536884
67	NC_008738	CG	3	6	63972	63977	0 %	0 %	50 %	50 %	120536885
68	NC_008738	CA	3	6	67625	67630	50 %	0 %	0 %	50 %	120536887
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70	NC_008738	AG	3	6	73167	73172	50 %	0 %	50 %	0 %	120536891
71	NC_008738	AG	3	6	73294	73299	50 %	0 %	50 %	0 %	120536891
72	NC_008738	GC	3	6	73512	73517	0 %	0 %	50 %	50 %	120536891
73	NC_008738	CA	3	6	73701	73706	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
74	NC_008738	GC	3	6	75485	75490	0 %	0 %	50 %	50 %	120536892
75	NC_008738	AC	3	6	76367	76372	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
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78	NC_008738	CG	3	6	78195	78200	0 %	0 %	50 %	50 %	120536892
79	NC_008738	AG	3	6	78363	78368	50 %	0 %	50 %	0 %	120536892
80	NC_008738	AG	3	6	78418	78423	50 %	0 %	50 %	0 %	120536892
81	NC_008738	GT	3	6	78698	78703	0 %	50 %	50 %	0 %	120536892
82	NC_008738	CA	3	6	79266	79271	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
83	NC_008738	AG	3	6	80187	80192	50 %	0 %	50 %	0 %	120536893
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87	NC_008738	GC	3	6	82451	82456	0 %	0 %	50 %	50 %	120536894
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91	NC_008738	CG	3	6	84344	84349	0 %	0 %	50 %	50 %	120536896
92	NC_008738	AG	3	6	86278	86283	50 %	0 %	50 %	0 %	120536898
93	NC_008738	AC	3	6	86361	86366	50 %	0 %	0 %	50 %	120536898
94	NC_008738	GC	3	6	86517	86522	0 %	0 %	50 %	50 %	120536898
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103	NC_008738	CT	3	6	93167	93172	0 %	50 %	0 %	50 %	120536905
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107	NC_008738	GC	3	6	99988	99993	0 %	0 %	50 %	50 %	120536910
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110	NC_008738	GT	3	6	104554	104559	0 %	50 %	50 %	0 %	120536914
111	NC_008738	AG	4	8	105171	105178	50 %	0 %	50 %	0 %	120536914
112	NC_008738	GC	3	6	106366	106371	0 %	0 %	50 %	50 %	120536915
113	NC_008738	AC	3	6	108599	108604	50 %	0 %	0 %	50 %	120536918
114	NC_008738	TA	3	6	110987	110992	50 %	50 %	0 %	0 %	120536921
115	NC_008738	AG	3	6	111539	111544	50 %	0 %	50 %	0 %	120536921
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122	NC_008738	GA	3	6	115972	115977	50 %	0 %	50 %	0 %	120536925
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124	NC_008738	GC	3	6	117101	117106	0 %	0 %	50 %	50 %	120536926
125	NC_008738	TC	3	6	117565	117570	0 %	50 %	0 %	50 %	120536927
126	NC_008738	TC	3	6	117647	117652	0 %	50 %	0 %	50 %	120536927
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.