MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008726	CGGGGC	2	12	36794	36805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008726	CGGCTG	2	12	51436	51447	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008726	CATCGA	2	12	137971	137982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008726	GCCGAG	2	12	138606	138617	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008726	CGGCGT	2	12	189504	189515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008726	TCCACG	2	12	227728	227739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008726	GTGGCG	2	12	271811	271822	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008726	CCCGGC	2	12	330186	330197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008726	CCGCGG	2	12	347054	347065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008726	TTGCTG	2	12	347167	347178	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008726	CGTCGA	2	12	392995	393006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008726	TCACAC	2	12	548839	548850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008726	TCCACT	2	12	574593	574604	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008726	GGTTCG	2	12	596065	596076	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008726	TCGGGG	2	12	598001	598012	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008726	TGATCT	2	12	613840	613851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008726	ATTCGG	2	12	706117	706128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008726	CCGTGT	2	12	891308	891319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008726	CTCCGA	2	12	1059896	1059907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008726	ACCCCG	2	12	1096101	1096112	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008726	GTCGGG	2	12	1118844	1118855	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008726	ATCGTT	2	12	1171543	1171554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008726	GTGATC	2	12	1227858	1227869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008726	AGGTCA	2	12	1227883	1227894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008726	TCTCGC	2	12	1371434	1371445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008726	ATCAGA	2	12	1388282	1388293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008726	CGTGAG	2	12	1483219	1483230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008726	CGCGGC	2	12	1536726	1536737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008726	AATGAC	2	12	1539877	1539888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008726	CCGGTG	2	12	1556243	1556254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008726	CAGGCG	2	12	1587409	1587420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008726	TCGGGC	2	12	1587447	1587458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008726	GGGCCG	2	12	1587582	1587593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008726	CGCAGC	2	12	1617826	1617837	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008726	TTGCGT	2	12	1631291	1631302	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008726	ACCATG	2	12	1661862	1661873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008726	GCCGGC	2	12	1676681	1676692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008726	GATCCT	2	12	1810938	1810949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008726	TGGCTC	3	18	1863783	1863800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008726	TGCCAA	2	12	1867665	1867676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008726	CTCCGG	2	12	1868196	1868207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008726	TCCGGT	3	18	1868251	1868268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008726	CCGGTC	2	12	1868492	1868503	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008726	GCCCCC	2	12	1869117	1869128	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_008726	GACGGA	2	12	1871322	1871333	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008726	GATGCT	2	12	1909267	1909278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008726	CCCAGG	2	12	2023472	2023483	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008726	GTCGAC	2	12	2023546	2023557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008726	GCCCTC	2	12	2033843	2033854	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008726	TCGACA	2	12	2127587	2127598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008726	CCTCGA	2	12	2140998	2141009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008726	GACGTG	2	12	2180309	2180320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008726	GACGCT	2	12	2186460	2186471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008726	GGCCAA	2	12	2203855	2203866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008726	GCACGG	2	12	2203887	2203898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008726	TCGCGG	2	12	2206292	2206303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008726	GGTGCG	2	12	2206348	2206359	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008726	GGGGCC	2	12	2206557	2206568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008726	CGACGC	2	12	2225514	2225525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008726	CGTGAC	2	12	2233934	2233945	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008726	ACCGGC	2	12	2255831	2255842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008726	CGGTAG	2	12	2294424	2294435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008726	TGGCGC	2	12	2303692	2303703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008726	CGGTGG	2	12	2339879	2339890	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008726	GGTAGG	2	12	2348779	2348790	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008726	TGAGTG	2	12	2348938	2348949	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008726	GAAGGT	2	12	2349020	2349031	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008726	ACAGCA	2	12	2352561	2352572	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008726	CCGGCG	2	12	2377198	2377209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008726	GGTCAG	2	12	2413780	2413791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008726	TGCGCC	2	12	2417112	2417123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008726	CGGTCC	3	18	2440144	2440161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008726	CTGGCG	2	12	2468471	2468482	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008726	GCTGCG	2	12	2673337	2673348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008726	CACCCG	2	12	2709180	2709191	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008726	GACGGT	2	12	2720622	2720633	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008726	CGTGAT	2	12	2806927	2806938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008726	GTCGAG	2	12	2819641	2819652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008726	TGTCGC	2	12	2869392	2869403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008726	TGTCGC	2	12	2869418	2869429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008726	TGTCGC	2	12	2869444	2869455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008726	TGTCGC	2	12	2869470	2869481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008726	TGGGCG	2	12	2886674	2886685	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008726	CGGGTT	2	12	2988283	2988294	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008726	TTCGGT	2	12	3028941	3028952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008726	GTGTGC	2	12	3079512	3079523	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008726	CTGACT	2	12	3084099	3084110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008726	TGTCGG	2	12	3103222	3103233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008726	ACTCCG	2	12	3121050	3121061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008726	ACCAGA	2	12	3183466	3183477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008726	CGCGGG	2	12	3209160	3209171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008726	GCCGCA	2	12	3227149	3227160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008726	CATCAG	2	12	3243624	3243635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008726	GCCGCG	2	12	3286907	3286918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008726	GCGCGA	2	12	3410796	3410807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008726	TGGCGG	2	12	3423452	3423463	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008726	GCGCCG	2	12	3440973	3440984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008726	AGGGGC	2	12	3443403	3443414	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008726	GACCTC	2	12	3444590	3444601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008726	GCCCCG	2	12	3456007	3456018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008726	TGTGGT	2	12	3501144	3501155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008726	GTGGGA	2	12	3541310	3541321	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008726	ACCCCC	2	12	3584685	3584696	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
104	NC_008726	CCCCCG	2	12	3596524	3596535	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_008726	GCGTCG	2	12	3626027	3626038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008726	GGCGCG	2	12	3629478	3629489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008726	TCAGCA	2	12	3639038	3639049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008726	TCGGCG	6	36	3639056	3639091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008726	TGGGCG	2	12	3639092	3639103	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008726	CACCGG	2	12	3639229	3639240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008726	GCGGCC	2	12	3639848	3639859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008726	CATCGA	2	12	3639921	3639932	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008726	GCCGCG	2	12	3660039	3660050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008726	CTCAAC	2	12	3743702	3743713	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008726	CCGGTC	2	12	3781663	3781674	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008726	TGCGTG	2	12	3791306	3791317	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008726	GACGTG	2	12	3806573	3806584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008726	TCGCCG	2	12	3878967	3878978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008726	CCGCGA	2	12	3879050	3879061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008726	GCTACG	2	12	3882656	3882667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008726	CTGATC	2	12	3883146	3883157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008726	CTGGCG	2	12	3883185	3883196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008726	CCTACG	2	12	3883366	3883377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008726	GGCACC	2	12	3889058	3889069	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008726	GCCGAC	2	12	3894674	3894685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008726	CCATCC	2	12	3910623	3910634	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008726	CGGCGC	2	12	3946465	3946476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008726	CCGAAA	2	12	3952519	3952530	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008726	CCACGG	2	12	3954820	3954831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008726	CGTGTA	2	12	3963355	3963366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008726	GTCGCC	2	12	3984004	3984015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008726	TCGCCG	2	12	4045716	4045727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008726	GCGCCC	2	12	4121932	4121943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008726	CACCGA	2	12	4146583	4146594	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008726	AGGCCG	2	12	4169281	4169292	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008726	TCATCG	2	12	4175352	4175363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008726	GCTCAG	2	12	4182642	4182653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008726	GGCCGC	2	12	4186012	4186023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008726	GTGTGG	2	12	4280967	4280978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008726	ACGTCC	2	12	4288895	4288906	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008726	TCAGCG	2	12	4420235	4420246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008726	AGAGGG	2	12	4425486	4425497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008726	CATCGA	2	12	4519309	4519320	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008726	GCACAG	2	12	4525325	4525336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008726	GCACAC	3	18	4525337	4525354	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008726	TGTGGT	2	12	4634248	4634259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008726	GAACCG	2	12	4654658	4654669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008726	CGATCG	2	12	4683819	4683830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008726	GCTGAA	2	12	4686658	4686669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_008726	GGCGTC	2	12	4701896	4701907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008726	CCCCAT	2	12	4776992	4777003	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_008726	CCGCGC	2	12	4807893	4807904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_008726	TCGACT	2	12	4896561	4896572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008726	GGCGCC	2	12	4923479	4923490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_008726	CGCCCC	2	12	5003336	5003347	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
156	NC_008726	CGGTCG	2	12	5013161	5013172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_008726	TTGCGC	2	12	5033695	5033706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_008726	GGGTCG	2	12	5035000	5035011	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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164	NC_008726	TCACCG	2	12	5409311	5409322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
165	NC_008726	GTCGAT	2	12	5410476	5410487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.