MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 5493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008726	ATCGG	2	10	34	43	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008726	ATCTC	2	10	1411	1420	20 %	40 %	0 %	40 %	120401029
3	NC_008726	ACCAC	2	10	1615	1624	40 %	0 %	0 %	60 %	120401029
4	NC_008726	CACCC	2	10	1743	1752	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_008726	CGCGG	2	10	3668	3677	0 %	0 %	60 %	40 %	120401031
6	NC_008726	CATCT	2	10	6519	6528	20 %	40 %	0 %	40 %	120401034
7	NC_008726	AAGTC	2	10	7525	7534	40 %	20 %	20 %	20 %	120401034
8	NC_008726	GCAGC	2	10	8108	8117	20 %	0 %	40 %	40 %	120401034
9	NC_008726	GCCGC	2	10	8170	8179	0 %	0 %	40 %	60 %	120401034
10	NC_008726	GCAGC	2	10	8523	8532	20 %	0 %	40 %	40 %	120401035
11	NC_008726	GCTGT	2	10	11698	11707	0 %	40 %	40 %	20 %	120401035
12	NC_008726	CGGGC	2	10	12389	12398	0 %	0 %	60 %	40 %	120401036
13	NC_008726	CCGAA	2	10	12567	12576	40 %	0 %	20 %	40 %	120401036
14	NC_008726	CGTGC	2	10	12745	12754	0 %	20 %	40 %	40 %	120401036
15	NC_008726	GTCGC	2	10	15260	15269	0 %	20 %	40 %	40 %	120401039
16	NC_008726	CTCGT	2	10	15290	15299	0 %	40 %	20 %	40 %	120401039
17	NC_008726	CGGCA	2	10	15588	15597	20 %	0 %	40 %	40 %	120401039
18	NC_008726	CCGTG	2	10	16127	16136	0 %	20 %	40 %	40 %	120401040
19	NC_008726	GCTGG	2	10	16569	16578	0 %	20 %	60 %	20 %	120401040
20	NC_008726	GCTGT	2	10	17321	17330	0 %	40 %	40 %	20 %	120401041
21	NC_008726	GCGTG	2	10	18527	18536	0 %	20 %	60 %	20 %	120401042
22	NC_008726	TCCAG	2	10	18861	18870	20 %	20 %	20 %	40 %	120401042
23	NC_008726	GCCTC	2	10	19455	19464	0 %	20 %	20 %	60 %	120401042
24	NC_008726	ACCGA	2	10	19916	19925	40 %	0 %	20 %	40 %	120401042
25	NC_008726	CGTTG	2	10	20649	20658	0 %	40 %	40 %	20 %	120401043
26	NC_008726	CGACT	2	10	21988	21997	20 %	20 %	20 %	40 %	120401044
27	NC_008726	CGGGC	2	10	22797	22806	0 %	0 %	60 %	40 %	120401046
28	NC_008726	GTCCG	2	10	23474	23483	0 %	20 %	40 %	40 %	120401047
29	NC_008726	GCGCC	2	10	23670	23679	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_008726	GCTGG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	60 %	20 %	120401049
31	NC_008726	GGCGT	2	10	26229	26238	0 %	20 %	60 %	20 %	120401050
32	NC_008726	TTCTG	2	10	28489	28498	0 %	60 %	20 %	20 %	120401052
33	NC_008726	CCGTG	2	10	30054	30063	0 %	20 %	40 %	40 %	120401053
34	NC_008726	CGGTG	2	10	32879	32888	0 %	20 %	60 %	20 %	120401055
35	NC_008726	TGGCG	2	10	34458	34467	0 %	20 %	60 %	20 %	120401056
36	NC_008726	CACCG	2	10	34657	34666	20 %	0 %	20 %	60 %	120401056
37	NC_008726	GCGGG	2	10	35729	35738	0 %	0 %	80 %	20 %	120401057
38	NC_008726	GACGT	2	10	35931	35940	20 %	20 %	40 %	20 %	120401057
39	NC_008726	GCCTG	2	10	36743	36752	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008726	GCCGT	2	10	37821	37830	0 %	20 %	40 %	40 %	120401059
41	NC_008726	TGCAG	2	10	38318	38327	20 %	20 %	40 %	20 %	120401060
42	NC_008726	ACCTG	2	10	40829	40838	20 %	20 %	20 %	40 %	120401061
43	NC_008726	CCACG	2	10	41174	41183	20 %	0 %	20 %	60 %	120401061
44	NC_008726	GGAAG	2	10	42269	42278	40 %	0 %	60 %	0 %	120401062
45	NC_008726	ATCTC	2	10	43328	43337	20 %	40 %	0 %	40 %	120401063
46	NC_008726	ATGAC	2	10	44549	44558	40 %	20 %	20 %	20 %	120401064
47	NC_008726	GCTGC	2	10	45321	45330	0 %	20 %	40 %	40 %	120401064
48	NC_008726	CCGGA	2	10	45783	45792	20 %	0 %	40 %	40 %	120401065
49	NC_008726	AGGCG	2	10	47969	47978	20 %	0 %	60 %	20 %	120401065
50	NC_008726	TGCGC	2	10	48059	48068	0 %	20 %	40 %	40 %	120401065
51	NC_008726	CGCTT	2	10	50882	50891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008726	CGGCA	2	10	51199	51208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008726	CCCGA	2	10	51939	51948	20 %	0 %	20 %	60 %	120401068
54	NC_008726	TCTGC	2	10	52375	52384	0 %	40 %	20 %	40 %	120401068
55	NC_008726	ACCAC	2	10	52724	52733	40 %	0 %	0 %	60 %	120401068
56	NC_008726	TCGTG	2	10	52857	52866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008726	CGCTG	2	10	52997	53006	0 %	20 %	40 %	40 %	120401069
58	NC_008726	CCCGA	2	10	53473	53482	20 %	0 %	20 %	60 %	120401069
59	NC_008726	GCGCG	2	10	55421	55430	0 %	0 %	60 %	40 %	120401070
60	NC_008726	CGCCC	2	10	55475	55484	0 %	0 %	20 %	80 %	120401070
61	NC_008726	GCCGT	2	10	56005	56014	0 %	20 %	40 %	40 %	120401070
62	NC_008726	CCTGG	2	10	56640	56649	0 %	20 %	40 %	40 %	120401071
63	NC_008726	CCGGG	2	10	56944	56953	0 %	0 %	60 %	40 %	120401071
64	NC_008726	TCCGA	2	10	58552	58561	20 %	20 %	20 %	40 %	120401073
65	NC_008726	CACCC	2	10	60953	60962	20 %	0 %	0 %	80 %	120401075
66	NC_008726	CGCGG	2	10	62422	62431	0 %	0 %	60 %	40 %	120401077
67	NC_008726	CGATG	2	10	63968	63977	20 %	20 %	40 %	20 %	120401079
68	NC_008726	TCGGC	2	10	65061	65070	0 %	20 %	40 %	40 %	120401079
69	NC_008726	CAGCG	2	10	65572	65581	20 %	0 %	40 %	40 %	120401080
70	NC_008726	GGGCA	2	10	66455	66464	20 %	0 %	60 %	20 %	120401080
71	NC_008726	CCAGC	2	10	66926	66935	20 %	0 %	20 %	60 %	120401081
72	NC_008726	CCAGC	2	10	67475	67484	20 %	0 %	20 %	60 %	120401082
73	NC_008726	GCAGC	2	10	68043	68052	20 %	0 %	40 %	40 %	120401082
74	NC_008726	CGCTG	2	10	68709	68718	0 %	20 %	40 %	40 %	120401083
75	NC_008726	TCGGC	2	10	69577	69586	0 %	20 %	40 %	40 %	120401084
76	NC_008726	GCTGC	2	10	70546	70555	0 %	20 %	40 %	40 %	120401086
77	NC_008726	CCGGG	2	10	72628	72637	0 %	0 %	60 %	40 %	120401090
78	NC_008726	TGCAC	2	10	73666	73675	20 %	20 %	20 %	40 %	120401091
79	NC_008726	TGGCC	2	10	75907	75916	0 %	20 %	40 %	40 %	120401094
80	NC_008726	CGTCG	2	10	77476	77485	0 %	20 %	40 %	40 %	120401096
81	NC_008726	CGCAC	2	10	77581	77590	20 %	0 %	20 %	60 %	120401096
82	NC_008726	TCGCC	2	10	78233	78242	0 %	20 %	20 %	60 %	120401097
83	NC_008726	CCGAT	2	10	78437	78446	20 %	20 %	20 %	40 %	120401097
84	NC_008726	TTCCA	2	10	79098	79107	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008726	GAAGG	2	10	79223	79232	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008726	GCAGA	2	10	79857	79866	40 %	0 %	40 %	20 %	120401098
87	NC_008726	TCGGC	2	10	80355	80364	0 %	20 %	40 %	40 %	120401099
88	NC_008726	CGATG	2	10	81060	81069	20 %	20 %	40 %	20 %	120401100
89	NC_008726	CCGAA	2	10	81785	81794	40 %	0 %	20 %	40 %	120401100
90	NC_008726	ACGCC	2	10	82850	82859	20 %	0 %	20 %	60 %	120401101
91	NC_008726	ACACG	2	10	83835	83844	40 %	0 %	20 %	40 %	120401101
92	NC_008726	GGCTC	2	10	84403	84412	0 %	20 %	40 %	40 %	120401102
93	NC_008726	TGTCG	2	10	85770	85779	0 %	40 %	40 %	20 %	120401102
94	NC_008726	GGCTG	2	10	86134	86143	0 %	20 %	60 %	20 %	120401102
95	NC_008726	ACCGG	2	10	86563	86572	20 %	0 %	40 %	40 %	120401103
96	NC_008726	TCGGG	2	10	86638	86647	0 %	20 %	60 %	20 %	120401103
97	NC_008726	CGGGC	2	10	86961	86970	0 %	0 %	60 %	40 %	120401103
98	NC_008726	CGGCA	2	10	88153	88162	20 %	0 %	40 %	40 %	120401104
99	NC_008726	TCCCA	2	10	88416	88425	20 %	20 %	0 %	60 %	120401105
100	NC_008726	GGTGC	2	10	88483	88492	0 %	20 %	60 %	20 %	120401105
101	NC_008726	GCGCC	2	10	90887	90896	0 %	0 %	40 %	60 %	120401108
102	NC_008726	GTCCG	2	10	91022	91031	0 %	20 %	40 %	40 %	120401108
103	NC_008726	CGGCG	2	10	93726	93735	0 %	0 %	60 %	40 %	120401110
104	NC_008726	TGGAT	2	10	94955	94964	20 %	40 %	40 %	0 %	120401112
105	NC_008726	CGCTG	2	10	95741	95750	0 %	20 %	40 %	40 %	120401113
106	NC_008726	GATTG	2	10	97919	97928	20 %	40 %	40 %	0 %	120401114
107	NC_008726	CTGCT	2	10	97929	97938	0 %	40 %	20 %	40 %	120401114
108	NC_008726	GTGGA	2	10	98641	98650	20 %	20 %	60 %	0 %	120401114
109	NC_008726	CCGCC	2	10	100186	100195	0 %	0 %	20 %	80 %	120401116
110	NC_008726	GACCA	2	10	101019	101028	40 %	0 %	20 %	40 %	120401116
111	NC_008726	CAGCG	2	10	104272	104281	20 %	0 %	40 %	40 %	120401119
112	NC_008726	CTCAC	2	10	110307	110316	20 %	20 %	0 %	60 %	120401125
113	NC_008726	CCGGC	2	10	110384	110393	0 %	0 %	40 %	60 %	120401125
114	NC_008726	GCGCG	2	10	113002	113011	0 %	0 %	60 %	40 %	120401127
115	NC_008726	TCCGG	2	10	113029	113038	0 %	20 %	40 %	40 %	120401127
116	NC_008726	GCCGA	2	10	114012	114021	20 %	0 %	40 %	40 %	120401128
117	NC_008726	CGCGC	2	10	114891	114900	0 %	0 %	40 %	60 %	120401128
118	NC_008726	TGCAA	2	10	117413	117422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008726	GGACT	2	10	117790	117799	20 %	20 %	40 %	20 %	120401132
120	NC_008726	CCGAC	3	15	119920	119934	20 %	0 %	20 %	60 %	120401133
121	NC_008726	GGCCA	2	10	120514	120523	20 %	0 %	40 %	40 %	120401134
122	NC_008726	AGCGA	2	10	120917	120926	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008726	CGATC	2	10	121571	121580	20 %	20 %	20 %	40 %	120401135
124	NC_008726	GGGTG	2	10	121719	121728	0 %	20 %	80 %	0 %	120401135
125	NC_008726	CGTGC	2	10	123075	123084	0 %	20 %	40 %	40 %	120401137
126	NC_008726	GCGTG	2	10	123569	123578	0 %	20 %	60 %	20 %	120401138
127	NC_008726	GCGCC	2	10	124532	124541	0 %	0 %	40 %	60 %	120401139
128	NC_008726	CCGGC	2	10	125691	125700	0 %	0 %	40 %	60 %	120401141
129	NC_008726	GTCCG	2	10	125889	125898	0 %	20 %	40 %	40 %	120401141
130	NC_008726	AGGTC	2	10	126031	126040	20 %	20 %	40 %	20 %	120401141
131	NC_008726	GCACG	2	10	127476	127485	20 %	0 %	40 %	40 %	120401143
132	NC_008726	CCGAG	2	10	127488	127497	20 %	0 %	40 %	40 %	120401143
133	NC_008726	GCACG	2	10	127515	127524	20 %	0 %	40 %	40 %	120401143
134	NC_008726	CGGTG	2	10	127534	127543	0 %	20 %	60 %	20 %	120401143
135	NC_008726	GGCCT	2	10	129674	129683	0 %	20 %	40 %	40 %	120401145
136	NC_008726	TCCGG	2	10	129952	129961	0 %	20 %	40 %	40 %	120401145
137	NC_008726	GACCC	2	10	131485	131494	20 %	0 %	20 %	60 %	120401146
138	NC_008726	CGGCG	2	10	131620	131629	0 %	0 %	60 %	40 %	120401146
139	NC_008726	CGGGG	2	10	134376	134385	0 %	0 %	80 %	20 %	120401148
140	NC_008726	GGCAC	2	10	135072	135081	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_008726	GTGGC	2	10	135302	135311	0 %	20 %	60 %	20 %	120401149
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150	NC_008726	CCGAT	2	10	147903	147912	20 %	20 %	20 %	40 %	120401163
151	NC_008726	GTCCC	2	10	149462	149471	0 %	20 %	20 %	60 %	120401164
152	NC_008726	CCCGG	2	10	149725	149734	0 %	0 %	40 %	60 %	120401164
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157	NC_008726	GGACG	2	10	154630	154639	20 %	0 %	60 %	20 %	120401168
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161	NC_008726	GGGTG	2	10	158414	158423	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_008726	CGCGC	2	10	170691	170700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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176	NC_008726	ATCCG	2	10	177553	177562	20 %	20 %	20 %	40 %	120401195
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179	NC_008726	GAGCG	2	10	180563	180572	20 %	0 %	60 %	20 %	120401199
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216	NC_008726	GTTGC	2	10	227210	227219	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
217	NC_008726	CGGGG	2	10	229387	229396	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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227	NC_008726	CTGTC	2	10	236509	236518	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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231	NC_008726	TCGTT	2	10	242221	242230	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
232	NC_008726	GCACC	2	10	242649	242658	20 %	0 %	20 %	60 %	120401253
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234	NC_008726	CGTAG	2	10	245421	245430	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
235	NC_008726	CGGGA	2	10	246228	246237	20 %	0 %	60 %	20 %	120401257
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240	NC_008726	GCTGC	2	10	252312	252321	0 %	20 %	40 %	40 %	120401262
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247	NC_008726	GTCGG	2	10	260879	260888	0 %	20 %	60 %	20 %	120401269
248	NC_008726	ATTGG	2	10	260967	260976	20 %	40 %	40 %	0 %	120401269
249	NC_008726	GGCTC	2	10	261926	261935	0 %	20 %	40 %	40 %	120401269
250	NC_008726	CAGTG	2	10	262716	262725	20 %	20 %	40 %	20 %	120401270
251	NC_008726	GTCAC	2	10	264085	264094	20 %	20 %	20 %	40 %	120401270
252	NC_008726	GCGAT	2	10	264146	264155	20 %	20 %	40 %	20 %	120401270
253	NC_008726	GATCC	2	10	266009	266018	20 %	20 %	20 %	40 %	120401271
254	NC_008726	CGGCC	2	10	266191	266200	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
255	NC_008726	GCGTG	2	10	268858	268867	0 %	20 %	60 %	20 %	120401274
256	NC_008726	CAGCG	2	10	268908	268917	20 %	0 %	40 %	40 %	120401275
257	NC_008726	TGCGC	2	10	271000	271009	0 %	20 %	40 %	40 %	120401276
258	NC_008726	ACAGC	2	10	271843	271852	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
259	NC_008726	GGTGG	2	10	272092	272101	0 %	20 %	80 %	0 %	120401277
260	NC_008726	TGGGC	2	10	272633	272642	0 %	20 %	60 %	20 %	120401277
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264	NC_008726	CGTCG	2	10	275613	275622	0 %	20 %	40 %	40 %	120401279
265	NC_008726	GTGCG	2	10	275702	275711	0 %	20 %	60 %	20 %	120401279
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