MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 123157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008726	CGT	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
2	NC_008726	CGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
3	NC_008726	GCA	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
4	NC_008726	CTG	2	6	405	410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
5	NC_008726	GGC	2	6	470	475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401029
6	NC_008726	CGA	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
7	NC_008726	GAC	2	6	597	602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
8	NC_008726	GTC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
9	NC_008726	GAC	3	9	609	617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
10	NC_008726	CGC	2	6	620	625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401029
11	NC_008726	CGT	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
12	NC_008726	CGC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401029
13	NC_008726	GAC	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
14	NC_008726	CGC	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401029
15	NC_008726	TCA	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401029
16	NC_008726	CGA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
17	NC_008726	CCG	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401029
18	NC_008726	CGT	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
19	NC_008726	TGC	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
20	NC_008726	CGA	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401029
21	NC_008726	TTC	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401029
22	NC_008726	TCC	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401029
23	NC_008726	GGA	2	6	1151	1156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401029
24	NC_008726	GCC	2	6	1202	1207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401029
25	NC_008726	AAG	2	6	1239	1244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401029
26	NC_008726	TGC	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401029
27	NC_008726	GGC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401029
28	NC_008726	CCG	2	6	1468	1473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401029
29	NC_008726	GAA	2	6	1640	1645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401029
30	NC_008726	CAC	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401029
31	NC_008726	TGC	2	6	2439	2444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401030
32	NC_008726	CGA	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401030
33	NC_008726	CGA	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401030
34	NC_008726	GTG	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401030
35	NC_008726	TCG	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401030
36	NC_008726	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401030
37	NC_008726	CGA	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401030
38	NC_008726	GGC	2	6	2839	2844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401030
39	NC_008726	GCC	2	6	2894	2899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401030
40	NC_008726	GGC	2	6	2944	2949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401030
41	NC_008726	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401030
42	NC_008726	GCA	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401030
43	NC_008726	GCT	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401030
44	NC_008726	GCT	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401030
45	NC_008726	CCA	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401030
46	NC_008726	TGG	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401030
47	NC_008726	TGC	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401030
48	NC_008726	CCG	2	6	3231	3236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401030
49	NC_008726	CGA	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401030
50	NC_008726	GAG	2	6	3260	3265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401030
51	NC_008726	CAC	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401030
52	NC_008726	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401030
53	NC_008726	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401030
54	NC_008726	GGT	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401031
55	NC_008726	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401031
56	NC_008726	TGG	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401031
57	NC_008726	GTG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401031
58	NC_008726	CGG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401031
59	NC_008726	CGG	2	6	3914	3919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401031
60	NC_008726	CCA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401031
61	NC_008726	TGA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401031
62	NC_008726	GCC	2	6	4098	4103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401031
63	NC_008726	GGT	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401031
64	NC_008726	GCA	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401031
65	NC_008726	GGA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401031
66	NC_008726	CGA	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401031
67	NC_008726	CGG	2	6	4391	4396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401031
68	NC_008726	CAC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401032
69	NC_008726	GGT	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401032
70	NC_008726	CCA	2	6	4655	4660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401032
71	NC_008726	TCG	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401032
72	NC_008726	ACG	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401032
73	NC_008726	TGT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401032
74	NC_008726	GGA	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401032
75	NC_008726	CGA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401032
76	NC_008726	CGG	2	6	4886	4891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401032
77	NC_008726	GGT	2	6	4911	4916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401032
78	NC_008726	CTG	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401032
79	NC_008726	GCG	2	6	5138	5143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401032
80	NC_008726	CGT	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401032
81	NC_008726	GCG	2	6	5164	5169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401032
82	NC_008726	GAG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401032
83	NC_008726	GGC	2	6	5199	5204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401032
84	NC_008726	CGA	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401032
85	NC_008726	GCC	2	6	5368	5373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401032
86	NC_008726	CTG	2	6	5380	5385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401032
87	NC_008726	CGA	2	6	5418	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401032
88	NC_008726	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401032
89	NC_008726	CCG	2	6	5501	5506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401032
90	NC_008726	GGA	3	9	5511	5519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401032
91	NC_008726	GGT	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401032
92	NC_008726	GAC	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401033
93	NC_008726	CCG	2	6	5669	5674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401033
94	NC_008726	GAG	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401033
95	NC_008726	GCG	2	6	5697	5702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401033
96	NC_008726	CAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401033
97	NC_008726	CGC	2	6	5924	5929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401033
98	NC_008726	CGC	2	6	5933	5938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401033
99	NC_008726	CGG	2	6	5974	5979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401033
100	NC_008726	CGC	2	6	6038	6043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401033
101	NC_008726	TCG	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401033
102	NC_008726	AGA	3	9	6400	6408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401034
103	NC_008726	GGT	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401034
104	NC_008726	CGA	2	6	6551	6556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401034
105	NC_008726	CCA	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401034
106	NC_008726	CGG	2	6	6605	6610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
107	NC_008726	CGA	2	6	6623	6628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401034
108	NC_008726	GTG	2	6	6681	6686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401034
109	NC_008726	CGG	2	6	6704	6709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
110	NC_008726	GAG	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401034
111	NC_008726	CGG	2	6	6740	6745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
112	NC_008726	GGT	2	6	6767	6772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401034
113	NC_008726	CAC	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401034
114	NC_008726	GAC	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401034
115	NC_008726	CGC	2	6	6963	6968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401034
116	NC_008726	CAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401034
117	NC_008726	CGA	2	6	7016	7021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401034
118	NC_008726	GTC	2	6	7041	7046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401034
119	NC_008726	GAC	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401034
120	NC_008726	GTC	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401034
121	NC_008726	CGG	2	6	7084	7089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
122	NC_008726	GCC	2	6	7098	7103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401034
123	NC_008726	GGC	2	6	7152	7157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
124	NC_008726	CAT	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401034
125	NC_008726	GGT	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401034
126	NC_008726	AAG	2	6	7392	7397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401034
127	NC_008726	CGA	2	6	7430	7435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401034
128	NC_008726	AGA	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401034
129	NC_008726	CAA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401034
130	NC_008726	TCG	2	6	7623	7628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401034
131	NC_008726	GGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
132	NC_008726	CGG	2	6	7694	7699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
133	NC_008726	TGG	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401034
134	NC_008726	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401034
135	NC_008726	ATC	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401034
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137	NC_008726	CAT	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401034
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139	NC_008726	GCT	3	9	8015	8023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401034
140	NC_008726	GCT	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401034
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150	NC_008726	ACC	2	6	8702	8707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401035
151	NC_008726	CGG	2	6	8822	8827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401035
152	NC_008726	ACC	2	6	9059	9064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401035
153	NC_008726	GCT	2	6	9066	9071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401035
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155	NC_008726	TTG	2	6	9103	9108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401035
156	NC_008726	GTC	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401035
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159	NC_008726	CAA	2	6	9267	9272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401035
160	NC_008726	TGG	2	6	9296	9301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401035
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162	NC_008726	CAG	2	6	9446	9451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401035
163	NC_008726	CAG	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401035
164	NC_008726	GGT	2	6	9675	9680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401035
165	NC_008726	CGG	2	6	9729	9734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401035
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252	NC_008726	CAG	2	6	13991	13996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401038
253	NC_008726	CCG	2	6	14014	14019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401038
254	NC_008726	CGA	2	6	14039	14044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401038
255	NC_008726	CGA	2	6	14131	14136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401038
256	NC_008726	GTC	2	6	14210	14215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401038
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258	NC_008726	CGA	2	6	14338	14343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401038
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376	NC_008726	GGC	2	6	19256	19261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401042
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378	NC_008726	TGA	2	6	19335	19340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401042
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