MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC2

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008713	TCAGCC	2	12	4265	4276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952794
2	NC_008713	GAAGCC	2	12	4279	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952794
3	NC_008713	GACGGA	2	12	4936	4947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119952794
4	NC_008713	AAGCCA	2	12	5741	5752	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119952794
5	NC_008713	GCAGCT	2	12	12202	12213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952761
6	NC_008713	CGGTTT	2	12	16424	16435	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119952726
7	NC_008713	CTGGCG	2	12	20237	20248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952688
8	NC_008713	CCATGA	2	12	20811	20822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952688
9	NC_008713	GCCGGG	2	12	21009	21020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952618
10	NC_008713	GTGGGC	2	12	22170	22181	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952745
11	NC_008713	TGACGG	2	12	22756	22767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952745
12	NC_008713	GTGACG	2	12	25251	25262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952745
13	NC_008713	GCCGAA	2	12	27921	27932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952759
14	NC_008713	GACGGC	2	12	27975	27986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952759
15	NC_008713	CGGCCG	2	12	31199	31210	0 %	0 %	50 %	50 %	119952602
16	NC_008713	CTTGTC	2	12	32045	32056	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119952691
17	NC_008713	GGGCCT	2	12	32860	32871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952691
18	NC_008713	TGACCC	2	12	32944	32955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952691
19	NC_008713	TTGAGG	2	12	35411	35422	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119952630
20	NC_008713	GCCTGG	2	12	37767	37778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952740
21	NC_008713	GGCCGG	2	12	39957	39968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952752
22	NC_008713	CGGAGC	2	12	40961	40972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952616
23	NC_008713	GTTCAG	2	12	42220	42231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952564
24	NC_008713	GGGTCG	2	12	42245	42256	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952564
25	NC_008713	TCCTCG	2	12	46482	46493	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952638
26	NC_008713	CGGAGC	2	12	50467	50478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952606
27	NC_008713	GCCACC	2	12	50970	50981	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119952736
28	NC_008713	CCGACG	2	12	53945	53956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952674
29	NC_008713	GACGGC	2	12	55534	55545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952689
30	NC_008713	CTGGTG	2	12	55685	55696	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119952689
31	NC_008713	TCTCAC	2	12	56043	56054	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119952689
32	NC_008713	CCTGGA	2	12	61982	61993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952799
33	NC_008713	TACACT	2	12	73637	73648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119952675
34	NC_008713	GCCAGT	2	12	74840	74851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952619
35	NC_008713	CAGGTA	2	12	80579	80590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952625
36	NC_008713	CGTAGT	2	12	80602	80613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952625
37	NC_008713	GAAGTC	2	12	82323	82334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952772
38	NC_008713	TCCCTG	2	12	91099	91110	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952692
39	NC_008713	CGCCAC	2	12	91767	91778	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119952692
40	NC_008713	GCACCG	2	12	92006	92017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952692
41	NC_008713	CCGCGC	2	12	92965	92976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952650
42	NC_008713	TCGCCG	2	12	93311	93322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952767
43	NC_008713	CGCCGA	2	12	93954	93965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952767
44	NC_008713	CAACGG	2	12	102750	102761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952795
45	NC_008713	CCAGGA	2	12	103842	103853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952795
46	NC_008713	TCGGGC	2	12	106063	106074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952779
47	NC_008713	CCCGGC	2	12	107079	107090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952779
48	NC_008713	GCTCAA	2	12	110221	110232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952673
49	NC_008713	GGGCGC	2	12	111361	111372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952739
50	NC_008713	TGACGG	2	12	114616	114627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952723
51	NC_008713	AAGCTC	2	12	114725	114736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952723
52	NC_008713	TGGGCA	2	12	117214	117225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952700
53	NC_008713	GAGTCC	2	12	122969	122980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952793
54	NC_008713	GGTGCG	4	24	124458	124481	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952648
55	NC_008713	GGCGCC	2	12	135222	135233	0 %	0 %	50 %	50 %	119952588
56	NC_008713	CCGTAG	2	12	137941	137952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952588
57	NC_008713	CGCCGT	2	12	138107	138118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952588
58	NC_008713	GTTGCT	2	12	141516	141527	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119952786
59	NC_008713	CAGGTC	2	12	143178	143189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952725
60	NC_008713	GTAGAG	2	12	144864	144875	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119952662
61	NC_008713	TCGACC	2	12	148058	148069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952609
62	NC_008713	GACTCG	2	12	150746	150757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952778
63	NC_008713	AGGTCA	2	12	153639	153650	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952579
64	NC_008713	GGCCAG	2	12	154053	154064	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952629
65	NC_008713	GCCGCT	2	12	157645	157656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952614
66	NC_008713	TGGCCT	2	12	160126	160137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952649
67	NC_008713	GGCCTG	2	12	162680	162691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952642
68	NC_008713	CTTGTG	2	12	163067	163078	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119952642
69	NC_008713	GCTGCC	2	12	165731	165742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952710
70	NC_008713	CTTCGC	2	12	168222	168233	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952647
71	NC_008713	ATGTTC	2	12	168265	168276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119952647
72	NC_008713	ACCTGC	2	12	168308	168319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952647
73	NC_008713	ACGAAG	2	12	168812	168823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119952591
74	NC_008713	TCGATG	2	12	180136	180147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952667
75	NC_008713	GTCGAC	2	12	186273	186284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952569
76	NC_008713	TTGCAG	2	12	191385	191396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952666
77	NC_008713	ATGCTG	2	12	192444	192455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952727
78	NC_008713	CCTTAC	2	12	192539	192550	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119952727
79	NC_008713	CTACGT	2	12	200650	200661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952693
80	NC_008713	CGTCCT	2	12	201492	201503	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952782
81	NC_008713	CCCGAA	2	12	204124	204135	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119952590
82	NC_008713	CGTTGC	2	12	209693	209704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952641
83	NC_008713	CGATGT	2	12	209939	209950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952641
84	NC_008713	GGTGTC	2	12	210000	210011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119952641
85	NC_008713	GTGGTA	2	12	210558	210569	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119952641
86	NC_008713	CGCAGT	2	12	212741	212752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952694
87	NC_008713	ACATCA	2	12	218283	218294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119952558
88	NC_008713	GTACCT	2	12	223386	223397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952712
89	NC_008713	GAACTC	2	12	228327	228338	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952577
90	NC_008713	TGAGTT	2	12	230869	230880	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119952653
91	NC_008713	TTCTGT	2	12	232745	232756	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	119952604
92	NC_008713	GCCTAC	2	12	234706	234717	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952607
93	NC_008713	CTGGCG	2	12	240769	240780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952592
94	NC_008713	GGACTC	2	12	247945	247956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952640
95	NC_008713	CCGAAG	2	12	249638	249649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952729
96	NC_008713	TCCCCC	2	12	254373	254384	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	119952796
97	NC_008713	AACCGC	2	12	258486	258497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119952754
98	NC_008713	TTCCGC	2	12	262325	262336	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952568
99	NC_008713	TGCCCT	2	12	263092	263103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952594
100	NC_008713	AGGGAA	2	12	268564	268575	50 %	0 %	50 %	0 %	119952562
101	NC_008713	GCCCAA	2	12	269866	269877	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119952703
102	NC_008713	GTCTCC	2	12	275104	275115	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952788
103	NC_008713	CCACAA	2	12	277892	277903	50 %	0 %	0 %	50 %	119952676
104	NC_008713	CGTCGA	2	12	282464	282475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952610
105	NC_008713	CCAGTT	2	12	282551	282562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952610
106	NC_008713	GGTGAA	2	12	283937	283948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119952685
107	NC_008713	TCGACG	2	12	287338	287349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952733
108	NC_008713	CTGCCG	2	12	290617	290628	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952600
109	NC_008713	AGCGTC	2	12	291211	291222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952600
110	NC_008713	GCTGGA	2	12	292426	292437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952732
111	NC_008713	CTGCCG	2	12	294359	294370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952686
112	NC_008713	AGGGCG	2	12	294625	294636	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119952686
113	NC_008713	GACGCC	2	12	297820	297831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952680
114	NC_008713	GCTTGA	2	12	298688	298699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.