MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC2

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008713	GGAGC	2	10	699	708	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008713	TTGAT	2	10	998	1007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008713	AGGGG	2	10	1366	1375	20 %	0 %	80 %	0 %	119952794
4	NC_008713	CGCGG	2	10	1402	1411	0 %	0 %	60 %	40 %	119952794
5	NC_008713	CCCGG	2	10	3316	3325	0 %	0 %	40 %	60 %	119952794
6	NC_008713	CGAGC	2	10	4321	4330	20 %	0 %	40 %	40 %	119952794
7	NC_008713	CCAAC	2	10	4953	4962	40 %	0 %	0 %	60 %	119952794
8	NC_008713	CGTGC	2	10	5488	5497	0 %	20 %	40 %	40 %	119952794
9	NC_008713	CCGGG	2	10	6130	6139	0 %	0 %	60 %	40 %	119952794
10	NC_008713	ACTCC	2	10	7128	7137	20 %	20 %	0 %	60 %	119952661
11	NC_008713	CGATC	2	10	7371	7380	20 %	20 %	20 %	40 %	119952661
12	NC_008713	AGCGC	2	10	9835	9844	20 %	0 %	40 %	40 %	119952611
13	NC_008713	CAGAG	2	10	11666	11675	40 %	0 %	40 %	20 %	119952702
14	NC_008713	GGCTT	2	10	13911	13920	0 %	40 %	40 %	20 %	119952669
15	NC_008713	TCACC	2	10	15172	15181	20 %	20 %	0 %	60 %	119952581
16	NC_008713	GGAAC	2	10	15690	15699	40 %	0 %	40 %	20 %	119952581
17	NC_008713	GCAAA	2	10	15740	15749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008713	CCGTC	2	10	16262	16271	0 %	20 %	20 %	60 %	119952726
19	NC_008713	CATGG	2	10	19383	19392	20 %	20 %	40 %	20 %	119952584
20	NC_008713	AGGGA	2	10	19989	19998	40 %	0 %	60 %	0 %	119952688
21	NC_008713	CCCGG	2	10	20494	20503	0 %	0 %	40 %	60 %	119952688
22	NC_008713	CGCTG	2	10	25307	25316	0 %	20 %	40 %	40 %	119952745
23	NC_008713	CGGTC	2	10	25321	25330	0 %	20 %	40 %	40 %	119952745
24	NC_008713	ACGTC	2	10	30725	30734	20 %	20 %	20 %	40 %	119952576
25	NC_008713	GTTCA	2	10	32090	32099	20 %	40 %	20 %	20 %	119952691
26	NC_008713	CGGAC	2	10	33100	33109	20 %	0 %	40 %	40 %	119952691
27	NC_008713	GCCGA	2	10	33225	33234	20 %	0 %	40 %	40 %	119952691
28	NC_008713	GCCGC	2	10	37002	37011	0 %	0 %	40 %	60 %	119952659
29	NC_008713	TGCCG	2	10	37202	37211	0 %	20 %	40 %	40 %	119952659
30	NC_008713	CCGAA	2	10	37389	37398	40 %	0 %	20 %	40 %	119952740
31	NC_008713	AGGAA	2	10	38002	38011	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008713	CGTCC	2	10	39472	39481	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_008713	CAGGA	2	10	41755	41764	40 %	0 %	40 %	20 %	119952616
34	NC_008713	CAGCG	2	10	42910	42919	20 %	0 %	40 %	40 %	119952564
35	NC_008713	GGGCC	2	10	43155	43164	0 %	0 %	60 %	40 %	119952564
36	NC_008713	CGGTC	2	10	43481	43490	0 %	20 %	40 %	40 %	119952687
37	NC_008713	GCTGC	2	10	45644	45653	0 %	20 %	40 %	40 %	119952638
38	NC_008713	CCTCG	2	10	48019	48028	0 %	20 %	20 %	60 %	119952652
39	NC_008713	CAGCC	2	10	48785	48794	20 %	0 %	20 %	60 %	119952615
40	NC_008713	GCCGT	2	10	50817	50826	0 %	20 %	40 %	40 %	119952736
41	NC_008713	TGGTT	2	10	51475	51484	0 %	60 %	40 %	0 %	119952751
42	NC_008713	GATCC	2	10	51825	51834	20 %	20 %	20 %	40 %	119952751
43	NC_008713	GCCGT	2	10	51867	51876	0 %	20 %	40 %	40 %	119952751
44	NC_008713	CACAC	2	10	56250	56259	40 %	0 %	0 %	60 %	119952689
45	NC_008713	TGGAT	2	10	57015	57024	20 %	40 %	40 %	0 %	119952718
46	NC_008713	GCGCT	2	10	57624	57633	0 %	20 %	40 %	40 %	119952750
47	NC_008713	AGGCC	2	10	58242	58251	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008713	GCTGT	2	10	58364	58373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008713	CAGCG	2	10	61550	61559	20 %	0 %	40 %	40 %	119952799
50	NC_008713	TCCGT	2	10	62176	62185	0 %	40 %	20 %	40 %	119952799
51	NC_008713	TCTGC	2	10	62254	62263	0 %	40 %	20 %	40 %	119952799
52	NC_008713	ACCAA	2	10	62419	62428	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008713	TCCGC	2	10	62791	62800	0 %	20 %	20 %	60 %	119952696
54	NC_008713	CCACG	2	10	64390	64399	20 %	0 %	20 %	60 %	119952585
55	NC_008713	CTGGG	2	10	65042	65051	0 %	20 %	60 %	20 %	119952699
56	NC_008713	GTGTT	2	10	65757	65766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008713	TTCCG	2	10	66845	66854	0 %	40 %	20 %	40 %	119952717
58	NC_008713	GGTGC	2	10	67019	67028	0 %	20 %	60 %	20 %	119952717
59	NC_008713	CTCAT	2	10	69668	69677	20 %	40 %	0 %	40 %	119952598
60	NC_008713	TGTTT	2	10	70125	70134	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008713	GACAA	2	10	70165	70174	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008713	ACGAA	2	10	72300	72309	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008713	CCCGA	2	10	72336	72345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_008713	CGCAG	2	10	73363	73372	20 %	0 %	40 %	40 %	119952781
65	NC_008713	CGCTG	2	10	73725	73734	0 %	20 %	40 %	40 %	119952675
66	NC_008713	AGGAC	2	10	79887	79896	40 %	0 %	40 %	20 %	119952625
67	NC_008713	CAGGA	2	10	81452	81461	40 %	0 %	40 %	20 %	119952625
68	NC_008713	GATGC	2	10	82971	82980	20 %	20 %	40 %	20 %	119952720
69	NC_008713	GAGGC	2	10	83568	83577	20 %	0 %	60 %	20 %	119952720
70	NC_008713	TGAGT	2	10	84852	84861	20 %	40 %	40 %	0 %	119952637
71	NC_008713	AACTA	2	10	85700	85709	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008713	CCTGG	2	10	90322	90331	0 %	20 %	40 %	40 %	119952643
73	NC_008713	TCACT	2	10	90756	90765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008713	TCCGG	2	10	92587	92596	0 %	20 %	40 %	40 %	119952650
75	NC_008713	CTCGA	2	10	96295	96304	20 %	20 %	20 %	40 %	119952792
76	NC_008713	GGACT	2	10	96762	96771	20 %	20 %	40 %	20 %	119952746
77	NC_008713	ACCGC	2	10	97729	97738	20 %	0 %	20 %	60 %	119952622
78	NC_008713	CGCAG	2	10	98265	98274	20 %	0 %	40 %	40 %	119952622
79	NC_008713	CGGCC	2	10	100271	100280	0 %	0 %	40 %	60 %	119952672
80	NC_008713	GCCCA	2	10	104179	104188	20 %	0 %	20 %	60 %	119952623
81	NC_008713	ACCGT	2	10	104782	104791	20 %	20 %	20 %	40 %	119952623
82	NC_008713	CGGGC	2	10	105382	105391	0 %	0 %	60 %	40 %	119952565
83	NC_008713	TCTGC	2	10	105834	105843	0 %	40 %	20 %	40 %	119952565
84	NC_008713	CAAGG	2	10	106093	106102	40 %	0 %	40 %	20 %	119952779
85	NC_008713	TCCTG	2	10	106497	106506	0 %	40 %	20 %	40 %	119952779
86	NC_008713	CAGCG	2	10	106996	107005	20 %	0 %	40 %	40 %	119952779
87	NC_008713	CCCTG	2	10	107924	107933	0 %	20 %	20 %	60 %	119952722
88	NC_008713	TTGAA	2	10	110408	110417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008713	AGGGC	2	10	110787	110796	20 %	0 %	60 %	20 %	119952739
90	NC_008713	ATGCG	2	10	113595	113604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008713	CAGCC	2	10	114703	114712	20 %	0 %	20 %	60 %	119952723
92	NC_008713	GTACC	2	10	115631	115640	20 %	20 %	20 %	40 %	119952723
93	NC_008713	TGACC	2	10	117377	117386	20 %	20 %	20 %	40 %	119952700
94	NC_008713	GCCCA	2	10	121017	121026	20 %	0 %	20 %	60 %	119952734
95	NC_008713	CCCAT	2	10	121192	121201	20 %	20 %	0 %	60 %	119952734
96	NC_008713	GTCGG	2	10	125215	125224	0 %	20 %	60 %	20 %	119952671
97	NC_008713	GTCCT	2	10	127193	127202	0 %	40 %	20 %	40 %	119952775
98	NC_008713	CTCAC	2	10	127694	127703	20 %	20 %	0 %	60 %	119952775
99	NC_008713	CGCGG	2	10	127732	127741	0 %	0 %	60 %	40 %	119952775
100	NC_008713	TCGGG	2	10	130119	130128	0 %	20 %	60 %	20 %	119952578
101	NC_008713	TTGGT	2	10	135611	135620	0 %	60 %	40 %	0 %	119952588
102	NC_008713	AGGAC	2	10	135689	135698	40 %	0 %	40 %	20 %	119952588
103	NC_008713	TCCGT	2	10	136750	136759	0 %	40 %	20 %	40 %	119952588
104	NC_008713	CGGTC	2	10	137721	137730	0 %	20 %	40 %	40 %	119952588
105	NC_008713	CCCGG	2	10	138276	138285	0 %	0 %	40 %	60 %	119952588
106	NC_008713	TCGCG	2	10	138473	138482	0 %	20 %	40 %	40 %	119952588
107	NC_008713	CGGGG	2	10	140252	140261	0 %	0 %	80 %	20 %	119952632
108	NC_008713	CGGGG	2	10	140410	140419	0 %	0 %	80 %	20 %	119952709
109	NC_008713	TGGTC	2	10	141482	141491	0 %	40 %	40 %	20 %	119952786
110	NC_008713	TTTCC	2	10	143738	143747	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008713	CCATG	2	10	144813	144822	20 %	20 %	20 %	40 %	119952662
112	NC_008713	GGTCC	2	10	146710	146719	0 %	20 %	40 %	40 %	119952804
113	NC_008713	AGGTC	2	10	151534	151543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008713	GCCTA	2	10	152739	152748	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008713	CCCGG	2	10	156500	156509	0 %	0 %	40 %	60 %	119952805
116	NC_008713	CCGGG	2	10	157701	157710	0 %	0 %	60 %	40 %	119952614
117	NC_008713	TCCTG	2	10	159689	159698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008713	GGCAG	2	10	161761	161770	20 %	0 %	60 %	20 %	119952719
119	NC_008713	CGGCC	2	10	162421	162430	0 %	0 %	40 %	60 %	119952642
120	NC_008713	GTGAT	2	10	165217	165226	20 %	40 %	40 %	0 %	119952710
121	NC_008713	CTGCG	2	10	166702	166711	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008713	CAGAT	2	10	166898	166907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008713	CCGGA	2	10	166984	166993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_008713	TCTCC	2	10	168910	168919	0 %	40 %	0 %	60 %	119952591
125	NC_008713	CGTCT	2	10	170825	170834	0 %	40 %	20 %	40 %	119952591
126	NC_008713	AGCGA	2	10	171770	171779	40 %	0 %	40 %	20 %	119952707
127	NC_008713	AGACC	2	10	172441	172450	40 %	0 %	20 %	40 %	119952658
128	NC_008713	CGGTC	2	10	172674	172683	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_008713	CGCTC	2	10	173541	173550	0 %	20 %	20 %	60 %	119952695
130	NC_008713	GCGCT	2	10	177394	177403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008713	GGCCG	2	10	177620	177629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_008713	GCCGT	2	10	179701	179710	0 %	20 %	40 %	40 %	119952667
133	NC_008713	CCGCT	2	10	181014	181023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_008713	GCAGC	2	10	181592	181601	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008713	GAGAT	2	10	184717	184726	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008713	CCCGG	2	10	187360	187369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_008713	ACACG	2	10	188509	188518	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_008713	CTCAC	2	10	188678	188687	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_008713	CTGGC	2	10	189120	189129	0 %	20 %	40 %	40 %	119952715
140	NC_008713	GCGCC	2	10	190271	190280	0 %	0 %	40 %	60 %	119952599
141	NC_008713	CAGCA	2	10	193795	193804	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008713	CTCCC	2	10	196066	196075	0 %	20 %	0 %	80 %	119952690
143	NC_008713	CAGCC	2	10	196478	196487	20 %	0 %	20 %	60 %	119952690
144	NC_008713	AGGGA	2	10	199471	199480	40 %	0 %	60 %	0 %	119952681
145	NC_008713	ACCCT	2	10	200204	200213	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_008713	ATGAC	2	10	200852	200861	40 %	20 %	20 %	20 %	119952693
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148	NC_008713	GTCAT	2	10	207581	207590	20 %	40 %	20 %	20 %	119952780
149	NC_008713	GCACG	2	10	208507	208516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_008713	GGCAG	2	10	209445	209454	20 %	0 %	60 %	20 %	119952570
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152	NC_008713	CAATT	2	10	211284	211293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_008713	ATGCA	2	10	213489	213498	40 %	20 %	20 %	20 %	119952735
155	NC_008713	CCGCG	2	10	216662	216671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_008713	ACCAT	2	10	216897	216906	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_008713	CCACG	2	10	216917	216926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
158	NC_008713	CCCGA	2	10	217890	217899	20 %	0 %	20 %	60 %	119952558
159	NC_008713	CCGCC	2	10	218188	218197	0 %	0 %	20 %	80 %	119952558
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161	NC_008713	GCGTT	2	10	223325	223334	0 %	40 %	40 %	20 %	119952712
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165	NC_008713	CCGCA	2	10	234534	234543	20 %	0 %	20 %	60 %	119952607
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167	NC_008713	CGGCC	2	10	237529	237538	0 %	0 %	40 %	60 %	119952803
168	NC_008713	TCAGC	2	10	237906	237915	20 %	20 %	20 %	40 %	119952803
169	NC_008713	CGGGG	2	10	238957	238966	0 %	0 %	80 %	20 %	119952566
170	NC_008713	TACTG	2	10	238995	239004	20 %	40 %	20 %	20 %	119952566
171	NC_008713	GCCGA	2	10	240564	240573	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
172	NC_008713	TTCCT	2	10	246327	246336	0 %	60 %	0 %	40 %	119952713
173	NC_008713	CCGCG	2	10	246382	246391	0 %	0 %	40 %	60 %	119952713
174	NC_008713	ACCAC	2	10	247421	247430	40 %	0 %	0 %	60 %	119952713
175	NC_008713	GCCAC	2	10	247617	247626	20 %	0 %	20 %	60 %	119952713
176	NC_008713	CTCCG	2	10	247783	247792	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
177	NC_008713	TGGTC	2	10	251574	251583	0 %	40 %	40 %	20 %	119952561
178	NC_008713	CTCAC	2	10	252512	252521	20 %	20 %	0 %	60 %	119952561
179	NC_008713	CCTTT	2	10	254401	254410	0 %	60 %	0 %	40 %	119952796
180	NC_008713	GCCCA	2	10	255110	255119	20 %	0 %	20 %	60 %	119952737
181	NC_008713	GCCGC	2	10	257612	257621	0 %	0 %	40 %	60 %	119952563
182	NC_008713	GGCCT	2	10	257746	257755	0 %	20 %	40 %	40 %	119952563
183	NC_008713	GCATT	2	10	258783	258792	20 %	40 %	20 %	20 %	119952754
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186	NC_008713	GCCGT	2	10	264265	264274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_008713	GCCAT	2	10	264676	264685	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_008713	CCAAC	2	10	267496	267505	40 %	0 %	0 %	60 %	119952711
189	NC_008713	CCACT	2	10	271748	271757	20 %	20 %	0 %	60 %	119952797
190	NC_008713	CTTCG	2	10	275013	275022	0 %	40 %	20 %	40 %	119952788
191	NC_008713	TCAAC	2	10	276071	276080	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_008713	GGCGA	2	10	276183	276192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
193	NC_008713	TTCAT	2	10	277565	277574	20 %	60 %	0 %	20 %	119952620
194	NC_008713	GGGCT	2	10	278472	278481	0 %	20 %	60 %	20 %	119952676
195	NC_008713	TGGAC	2	10	278905	278914	20 %	20 %	40 %	20 %	119952768
196	NC_008713	CCGCC	2	10	281998	282007	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
197	NC_008713	GGTTC	2	10	282699	282708	0 %	40 %	40 %	20 %	119952610
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199	NC_008713	ACTCG	2	10	284646	284655	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
200	NC_008713	GGCAG	2	10	285863	285872	20 %	0 %	60 %	20 %	119952758
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204	NC_008713	GGCGG	2	10	287009	287018	0 %	0 %	80 %	20 %	119952758
205	NC_008713	GTGCT	2	10	288700	288709	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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207	NC_008713	GCCGC	2	10	293941	293950	0 %	0 %	40 %	60 %	119952686
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209	NC_008713	GGTGT	2	10	295259	295268	0 %	40 %	60 %	0 %	119952664
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212	NC_008713	CTCAG	2	10	298209	298218	20 %	20 %	20 %	40 %	119952680
213	NC_008713	ATCAG	2	10	300266	300275	40 %	20 %	20 %	20 %	119952612
214	NC_008713	ATCAG	2	10	300523	300532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.