MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC2

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008713	GGAGC	2	10	699	708	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008713	TTGAT	2	10	998	1007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008713	GCAAA	2	10	15740	15749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008713	AGGAA	2	10	38002	38011	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008713	CGTCC	2	10	39472	39481	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_008713	AGGCC	2	10	58242	58251	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008713	GCTGT	2	10	58364	58373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008713	ACCAA	2	10	62419	62428	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008713	GTGTT	2	10	65757	65766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008713	TGTTT	2	10	70125	70134	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008713	GACAA	2	10	70165	70174	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008713	ACGAA	2	10	72300	72309	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008713	CCCGA	2	10	72336	72345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_008713	AACTA	2	10	85700	85709	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008713	TCACT	2	10	90756	90765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_008713	TTGAA	2	10	110408	110417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008713	ATGCG	2	10	113595	113604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008713	TTTCC	2	10	143738	143747	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008713	AGGTC	2	10	151534	151543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008713	GCCTA	2	10	152739	152748	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008713	TCCTG	2	10	159689	159698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008713	CTGCG	2	10	166702	166711	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008713	CAGAT	2	10	166898	166907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008713	CCGGA	2	10	166984	166993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008713	CGGTC	2	10	172674	172683	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008713	GCGCT	2	10	177394	177403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008713	GGCCG	2	10	177620	177629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008713	CCGCT	2	10	181014	181023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_008713	GCAGC	2	10	181592	181601	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008713	GAGAT	2	10	184717	184726	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008713	CCCGG	2	10	187360	187369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008713	ACACG	2	10	188509	188518	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_008713	CTCAC	2	10	188678	188687	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_008713	CAGCA	2	10	193795	193804	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008713	ACCCT	2	10	200204	200213	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_008713	GCACG	2	10	208507	208516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008713	CAATT	2	10	211284	211293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008713	CCGCG	2	10	216662	216671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008713	ACCAT	2	10	216897	216906	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008713	CCACG	2	10	216917	216926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_008713	GCCGA	2	10	240564	240573	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008713	CTCCG	2	10	247783	247792	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008713	GTGCC	2	10	260098	260107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008713	CCCGG	2	10	263726	263735	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_008713	GCCGT	2	10	264265	264274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008713	GCCAT	2	10	264676	264685	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008713	TCAAC	2	10	276071	276080	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008713	GGCGA	2	10	276183	276192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008713	CCGCC	2	10	281998	282007	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
50	NC_008713	ACTCG	2	10	284646	284655	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008713	GTGCT	2	10	288700	288709	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008713	ATCAG	2	10	300523	300532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.