MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC2

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008713	TTGC	2	8	711	718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008713	ATCG	2	8	735	742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008713	GTTG	2	8	842	849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008713	GGAA	2	8	879	886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008713	TGAG	2	8	947	954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008713	TCAA	2	8	10831	10838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008713	AGCC	2	8	10969	10976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008713	ATGG	2	8	12047	12054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008713	GCAA	2	8	14583	14590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008713	GTTG	2	8	17464	17471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008713	CGGA	2	8	21994	22001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008713	CCAG	2	8	27012	27019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008713	GCGG	2	8	27162	27169	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008713	GGCC	2	8	29252	29259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008713	GGCC	2	8	30256	30263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008713	GGGA	2	8	30284	30291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008713	CATT	2	8	34158	34165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008713	AGGC	2	8	40432	40439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008713	GGTT	2	8	40713	40720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008713	ATCC	2	8	40825	40832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008713	CCCG	2	8	44921	44928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008713	CCGG	2	8	52128	52135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008713	ACCC	2	8	56757	56764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_008713	CGGC	2	8	57827	57834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008713	CTTC	2	8	59325	59332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008713	TGGA	2	8	60868	60875	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008713	GATC	2	8	65593	65600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008713	GCCG	2	8	67707	67714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008713	CACC	2	8	68044	68051	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_008713	GCAC	2	8	71372	71379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008713	GGGT	2	8	73155	73162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008713	CTGA	2	8	73554	73561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008713	AGGC	2	8	77570	77577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008713	GCAC	2	8	79611	79618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008713	CCAG	2	8	79647	79654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008713	CAGG	2	8	79693	79700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008713	ACGA	2	8	90904	90911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008713	TCCG	2	8	95044	95051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008713	CACG	2	8	95355	95362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008713	GATT	2	8	102248	102255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008713	CCGG	2	8	102375	102382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008713	CACC	2	8	107327	107334	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_008713	ACTA	2	8	107427	107434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008713	TTCC	2	8	108940	108947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008713	GCAA	2	8	110506	110513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008713	TCGC	2	8	112646	112653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008713	TCCC	2	8	113424	113431	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008713	AATC	2	8	116122	116129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008713	CTCC	2	8	119182	119189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_008713	GCCG	2	8	123793	123800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008713	CCGG	2	8	124237	124244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008713	ATCG	2	8	130435	130442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008713	CAGC	2	8	130737	130744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008713	ACGA	2	8	130910	130917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008713	GTCA	2	8	132192	132199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008713	CCCT	2	8	132661	132668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008713	GATC	2	8	133206	133213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008713	CCGG	2	8	134127	134134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008713	AGTC	2	8	139432	139439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008713	GAAT	2	8	145907	145914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008713	AACT	2	8	150656	150663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008713	GCAT	2	8	151353	151360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008713	TCGC	2	8	151487	151494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008713	AACC	2	8	151544	151551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008713	ACCA	2	8	152757	152764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008713	TCTG	2	8	152974	152981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008713	CCGG	2	8	153125	153132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008713	TAGT	2	8	154743	154750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008713	ATAG	2	8	158247	158254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008713	GGCA	2	8	158328	158335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008713	ACGG	2	8	158462	158469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008713	CTTT	2	8	158602	158609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008713	GGAT	2	8	166568	166575	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008713	CGGC	2	8	166841	166848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008713	TCCT	2	8	166857	166864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008713	CGGG	2	8	166865	166872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008713	GCCG	2	8	166932	166939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008713	CTGC	2	8	167037	167044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008713	AAAG	2	8	167472	167479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008713	CCGG	2	8	171919	171926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008713	CGAT	2	8	172629	172636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008713	GGAG	2	8	172702	172709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008713	GCAA	2	8	172810	172817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008713	AAGG	2	8	173197	173204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008713	CGAC	2	8	177084	177091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008713	TCCC	2	8	177150	177157	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_008713	GCAC	2	8	177270	177277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008713	CATC	2	8	180829	180836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008713	CGCC	2	8	181359	181366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_008713	CCTG	2	8	181606	181613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008713	ATCA	2	8	181948	181955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008713	TACC	2	8	184394	184401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008713	CCAG	2	8	184556	184563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008713	GCCG	2	8	184677	184684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008713	CGAG	2	8	184835	184842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008713	CCTG	2	8	185112	185119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008713	GACG	2	8	186620	186627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008713	CGAA	2	8	187081	187088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008713	ACCC	2	8	187430	187437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_008713	GCCA	2	8	188574	188581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008713	AGGC	2	8	189559	189566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008713	GATG	2	8	189619	189626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008713	CTGC	2	8	199938	199945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008713	GCCG	2	8	200112	200119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008713	GCTG	2	8	203066	203073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008713	CTAA	2	8	205637	205644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008713	CTAA	2	8	211108	211115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008713	CCTT	2	8	211351	211358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008713	CGAC	2	8	211391	211398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008713	TCGT	2	8	213695	213702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008713	CCTC	2	8	213778	213785	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008713	TGTC	2	8	216634	216641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008713	GTCG	2	8	216648	216655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008713	TGCC	2	8	218821	218828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008713	AGGC	2	8	218836	218843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008713	CTGA	2	8	219384	219391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008713	GCCG	2	8	219632	219639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008713	AGGC	2	8	228965	228972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008713	ATGT	2	8	232352	232359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008713	GGCC	2	8	232432	232439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008713	CGGC	2	8	234102	234109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008713	ATGG	2	8	240060	240067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008713	GTCC	2	8	240113	240120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008713	AGGC	2	8	240139	240146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008713	AACC	2	8	245405	245412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008713	TTGT	2	8	245871	245878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008713	GCCC	2	8	246138	246145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_008713	GCCG	2	8	247798	247805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008713	TCAG	2	8	253819	253826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008713	TGGA	2	8	253856	253863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008713	CGGG	2	8	254559	254566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008713	CAGG	2	8	256911	256918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008713	AAGG	2	8	259435	259442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008713	GCCT	2	8	260343	260350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008713	CCGC	2	8	261306	261313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_008713	CCTA	2	8	261314	261321	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008713	AGGG	2	8	261823	261830	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008713	CCTC	2	8	261908	261915	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_008713	TGCC	2	8	268068	268075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008713	GTGA	2	8	275791	275798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008713	ACGA	2	8	276103	276110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008713	TCGG	2	8	280643	280650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008713	GCAT	2	8	281151	281158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008713	TACC	2	8	281293	281300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008713	CGAC	2	8	284514	284521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008713	AATA	2	8	284554	284561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008713	AGCA	2	8	284662	284669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008713	GGCG	2	8	284714	284721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008713	GCCA	2	8	288626	288633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008713	CCTT	2	8	291514	291521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008713	TTCC	2	8	293229	293236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008713	TCGA	2	8	296450	296457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008713	GCTA	2	8	300687	300694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.