MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC2

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008713	CG	3	6	425	430	0 %	0 %	50 %	50 %	119952760
2	NC_008713	GC	3	6	1837	1842	0 %	0 %	50 %	50 %	119952794
3	NC_008713	GC	3	6	2688	2693	0 %	0 %	50 %	50 %	119952794
4	NC_008713	GC	3	6	3948	3953	0 %	0 %	50 %	50 %	119952794
5	NC_008713	CG	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	119952794
6	NC_008713	GC	3	6	4144	4149	0 %	0 %	50 %	50 %	119952794
7	NC_008713	GC	3	6	6114	6119	0 %	0 %	50 %	50 %	119952794
8	NC_008713	GA	3	6	6708	6713	50 %	0 %	50 %	0 %	119952661
9	NC_008713	CA	3	6	7979	7984	50 %	0 %	0 %	50 %	119952769
10	NC_008713	AC	3	6	10168	10173	50 %	0 %	0 %	50 %	119952611
11	NC_008713	CG	3	6	13558	13563	0 %	0 %	50 %	50 %	119952669
12	NC_008713	CT	3	6	13738	13743	0 %	50 %	0 %	50 %	119952669
13	NC_008713	CT	3	6	15112	15117	0 %	50 %	0 %	50 %	119952581
14	NC_008713	CT	3	6	15282	15287	0 %	50 %	0 %	50 %	119952581
15	NC_008713	AC	3	6	18803	18808	50 %	0 %	0 %	50 %	119952584
16	NC_008713	GC	4	8	19132	19139	0 %	0 %	50 %	50 %	119952584
17	NC_008713	GC	3	6	19617	19622	0 %	0 %	50 %	50 %	119952567
18	NC_008713	CG	3	6	20663	20668	0 %	0 %	50 %	50 %	119952688
19	NC_008713	GC	3	6	21360	21365	0 %	0 %	50 %	50 %	119952618
20	NC_008713	GC	3	6	25435	25440	0 %	0 %	50 %	50 %	119952745
21	NC_008713	CG	4	8	26035	26042	0 %	0 %	50 %	50 %	119952745
22	NC_008713	GC	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	119952745
23	NC_008713	TG	4	8	27463	27470	0 %	50 %	50 %	0 %	119952684
24	NC_008713	GC	3	6	33237	33242	0 %	0 %	50 %	50 %	119952691
25	NC_008713	GC	3	6	33820	33825	0 %	0 %	50 %	50 %	119952749
26	NC_008713	TG	3	6	33836	33841	0 %	50 %	50 %	0 %	119952749
27	NC_008713	CT	3	6	35130	35135	0 %	50 %	0 %	50 %	119952630
28	NC_008713	GC	3	6	35878	35883	0 %	0 %	50 %	50 %	119952630
29	NC_008713	CG	3	6	38313	38318	0 %	0 %	50 %	50 %	119952557
30	NC_008713	CG	3	6	38505	38510	0 %	0 %	50 %	50 %	119952557
31	NC_008713	CA	3	6	42775	42780	50 %	0 %	0 %	50 %	119952564
32	NC_008713	CA	5	10	44624	44633	50 %	0 %	0 %	50 %	119952756
33	NC_008713	CT	3	6	45443	45448	0 %	50 %	0 %	50 %	119952638
34	NC_008713	GC	3	6	45519	45524	0 %	0 %	50 %	50 %	119952638
35	NC_008713	GC	3	6	46494	46499	0 %	0 %	50 %	50 %	119952638
36	NC_008713	GC	3	6	47557	47562	0 %	0 %	50 %	50 %	119952771
37	NC_008713	CA	3	6	50399	50404	50 %	0 %	0 %	50 %	119952606
38	NC_008713	GC	3	6	52096	52101	0 %	0 %	50 %	50 %	119952751
39	NC_008713	AG	3	6	53920	53925	50 %	0 %	50 %	0 %	119952674
40	NC_008713	AG	3	6	53927	53932	50 %	0 %	50 %	0 %	119952674
41	NC_008713	CG	3	6	55241	55246	0 %	0 %	50 %	50 %	119952689
42	NC_008713	AC	3	6	56488	56493	50 %	0 %	0 %	50 %	119952776
43	NC_008713	CT	3	6	59790	59795	0 %	50 %	0 %	50 %	119952597
44	NC_008713	GC	3	6	60427	60432	0 %	0 %	50 %	50 %	119952603
45	NC_008713	GC	3	6	62592	62597	0 %	0 %	50 %	50 %	119952696
46	NC_008713	CG	3	6	62910	62915	0 %	0 %	50 %	50 %	119952696
47	NC_008713	CG	3	6	64067	64072	0 %	0 %	50 %	50 %	119952585
48	NC_008713	CG	3	6	65088	65093	0 %	0 %	50 %	50 %	119952699
49	NC_008713	GT	3	6	66484	66489	0 %	50 %	50 %	0 %	119952717
50	NC_008713	GC	3	6	67158	67163	0 %	0 %	50 %	50 %	119952717
51	NC_008713	GT	4	8	67517	67524	0 %	50 %	50 %	0 %	119952717
52	NC_008713	GC	3	6	68371	68376	0 %	0 %	50 %	50 %	119952791
53	NC_008713	CA	3	6	69579	69584	50 %	0 %	0 %	50 %	119952598
54	NC_008713	GT	3	6	71591	71596	0 %	50 %	50 %	0 %	119952738
55	NC_008713	CG	3	6	71642	71647	0 %	0 %	50 %	50 %	119952738
56	NC_008713	TC	3	6	72592	72597	0 %	50 %	0 %	50 %	119952741
57	NC_008713	CG	3	6	73286	73291	0 %	0 %	50 %	50 %	119952781
58	NC_008713	AG	3	6	73768	73773	50 %	0 %	50 %	0 %	119952675
59	NC_008713	CG	3	6	74038	74043	0 %	0 %	50 %	50 %	119952675
60	NC_008713	CA	3	6	74238	74243	50 %	0 %	0 %	50 %	119952619
61	NC_008713	GA	3	6	75542	75547	50 %	0 %	50 %	0 %	119952619
62	NC_008713	GC	3	6	75968	75973	0 %	0 %	50 %	50 %	119952605
63	NC_008713	GC	3	6	76232	76237	0 %	0 %	50 %	50 %	119952605
64	NC_008713	CA	3	6	76827	76832	50 %	0 %	0 %	50 %	119952605
65	NC_008713	GC	3	6	77092	77097	0 %	0 %	50 %	50 %	119952605
66	NC_008713	CG	3	6	80153	80158	0 %	0 %	50 %	50 %	119952625
67	NC_008713	GC	3	6	80470	80475	0 %	0 %	50 %	50 %	119952625
68	NC_008713	TG	3	6	81477	81482	0 %	50 %	50 %	0 %	119952625
69	NC_008713	GC	3	6	82018	82023	0 %	0 %	50 %	50 %	119952772
70	NC_008713	GC	3	6	82142	82147	0 %	0 %	50 %	50 %	119952772
71	NC_008713	TA	3	6	83708	83713	50 %	50 %	0 %	0 %	119952720
72	NC_008713	GA	3	6	85125	85130	50 %	0 %	50 %	0 %	119952637
73	NC_008713	CG	4	8	87930	87937	0 %	0 %	50 %	50 %	119952716
74	NC_008713	AT	3	6	88384	88389	50 %	50 %	0 %	0 %	119952716
75	NC_008713	GC	4	8	90121	90128	0 %	0 %	50 %	50 %	119952643
76	NC_008713	GC	3	6	91192	91197	0 %	0 %	50 %	50 %	119952692
77	NC_008713	GC	3	6	91944	91949	0 %	0 %	50 %	50 %	119952692
78	NC_008713	GC	3	6	92037	92042	0 %	0 %	50 %	50 %	119952692
79	NC_008713	GC	3	6	94092	94097	0 %	0 %	50 %	50 %	119952767
80	NC_008713	CA	3	6	94439	94444	50 %	0 %	0 %	50 %	119952767
81	NC_008713	GC	3	6	97232	97237	0 %	0 %	50 %	50 %	119952746
82	NC_008713	AC	3	6	99661	99666	50 %	0 %	0 %	50 %	119952672
83	NC_008713	CG	3	6	104203	104208	0 %	0 %	50 %	50 %	119952623
84	NC_008713	CT	3	6	104704	104709	0 %	50 %	0 %	50 %	119952623
85	NC_008713	AC	3	6	104806	104811	50 %	0 %	0 %	50 %	119952623
86	NC_008713	TG	3	6	105179	105184	0 %	50 %	50 %	0 %	119952565
87	NC_008713	TC	3	6	105618	105623	0 %	50 %	0 %	50 %	119952565
88	NC_008713	CG	3	6	107741	107746	0 %	0 %	50 %	50 %	119952722
89	NC_008713	CG	3	6	109384	109389	0 %	0 %	50 %	50 %	119952673
90	NC_008713	CG	3	6	109517	109522	0 %	0 %	50 %	50 %	119952673
91	NC_008713	CG	4	8	109694	109701	0 %	0 %	50 %	50 %	119952673
92	NC_008713	CG	3	6	109823	109828	0 %	0 %	50 %	50 %	119952673
93	NC_008713	CA	3	6	111595	111600	50 %	0 %	0 %	50 %	119952704
94	NC_008713	GC	3	6	115269	115274	0 %	0 %	50 %	50 %	119952723
95	NC_008713	GC	3	6	115736	115741	0 %	0 %	50 %	50 %	119952723
96	NC_008713	CA	3	6	119844	119849	50 %	0 %	0 %	50 %	119952763
97	NC_008713	CG	3	6	121950	121955	0 %	0 %	50 %	50 %	119952668
98	NC_008713	CG	3	6	122002	122007	0 %	0 %	50 %	50 %	119952668
99	NC_008713	CG	3	6	122010	122015	0 %	0 %	50 %	50 %	119952668
100	NC_008713	CG	3	6	122020	122025	0 %	0 %	50 %	50 %	119952668
101	NC_008713	AG	3	6	122800	122805	50 %	0 %	50 %	0 %	119952793
102	NC_008713	TG	3	6	122925	122930	0 %	50 %	50 %	0 %	119952793
103	NC_008713	CA	3	6	124432	124437	50 %	0 %	0 %	50 %	119952648
104	NC_008713	TC	3	6	127127	127132	0 %	50 %	0 %	50 %	119952775
105	NC_008713	CA	3	6	127553	127558	50 %	0 %	0 %	50 %	119952775
106	NC_008713	CG	3	6	129138	129143	0 %	0 %	50 %	50 %	119952789
107	NC_008713	TC	3	6	129459	129464	0 %	50 %	0 %	50 %	119952578
108	NC_008713	GT	3	6	135469	135474	0 %	50 %	50 %	0 %	119952588
109	NC_008713	GT	4	8	136189	136196	0 %	50 %	50 %	0 %	119952588
110	NC_008713	CG	3	6	136737	136742	0 %	0 %	50 %	50 %	119952588
111	NC_008713	TC	3	6	139277	139282	0 %	50 %	0 %	50 %	119952588
112	NC_008713	TG	3	6	140838	140843	0 %	50 %	50 %	0 %	119952709
113	NC_008713	GT	3	6	141433	141438	0 %	50 %	50 %	0 %	119952786
114	NC_008713	GT	3	6	141848	141853	0 %	50 %	50 %	0 %	119952786
115	NC_008713	CG	3	6	144351	144356	0 %	0 %	50 %	50 %	119952583
116	NC_008713	CT	3	6	146902	146907	0 %	50 %	0 %	50 %	119952804
117	NC_008713	CT	3	6	146926	146931	0 %	50 %	0 %	50 %	119952804
118	NC_008713	GA	3	6	147963	147968	50 %	0 %	50 %	0 %	119952609
119	NC_008713	GT	3	6	149521	149526	0 %	50 %	50 %	0 %	119952742
120	NC_008713	CG	3	6	149822	149827	0 %	0 %	50 %	50 %	119952742
121	NC_008713	CG	3	6	149912	149917	0 %	0 %	50 %	50 %	119952742
122	NC_008713	AT	3	6	150210	150215	50 %	50 %	0 %	0 %	119952742
123	NC_008713	GC	3	6	150339	150344	0 %	0 %	50 %	50 %	119952742
124	NC_008713	TC	3	6	151578	151583	0 %	50 %	0 %	50 %	119952552
125	NC_008713	CT	3	6	153344	153349	0 %	50 %	0 %	50 %	119952579
126	NC_008713	TG	4	8	154270	154277	0 %	50 %	50 %	0 %	119952629
127	NC_008713	TC	3	6	154645	154650	0 %	50 %	0 %	50 %	119952654
128	NC_008713	TG	3	6	155172	155177	0 %	50 %	50 %	0 %	119952586
129	NC_008713	CG	4	8	155240	155247	0 %	0 %	50 %	50 %	119952586
130	NC_008713	CG	3	6	155531	155536	0 %	0 %	50 %	50 %	119952636
131	NC_008713	AG	3	6	155621	155626	50 %	0 %	50 %	0 %	119952636
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137	NC_008713	GC	3	6	160423	160428	0 %	0 %	50 %	50 %	119952649
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139	NC_008713	CG	3	6	161910	161915	0 %	0 %	50 %	50 %	119952719
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.