MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008712	AGCGCG	2	12	1398	1409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952336
2	NC_008712	CAGGCC	2	12	2084	2095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952477
3	NC_008712	CACGAT	2	12	3516	3527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952489
4	NC_008712	CGACCG	2	12	5398	5409	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952398
5	NC_008712	ACGTCG	2	12	5964	5975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952398
6	NC_008712	CGCGGC	2	12	6019	6030	0 %	0 %	50 %	50 %	119952398
7	NC_008712	ACAGCA	2	12	7243	7254	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119952530
8	NC_008712	GAAGCC	2	12	8860	8871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952428
9	NC_008712	TGGCTG	2	12	9460	9471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119952502
10	NC_008712	TGCAGG	2	12	11610	11621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952524
11	NC_008712	CGAGGA	2	12	11686	11697	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119952524
12	NC_008712	CGCTGG	2	12	13678	13689	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952374
13	NC_008712	GGCCTC	2	12	16898	16909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952508
14	NC_008712	GCCACG	2	12	17275	17286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952508
15	NC_008712	GCCGCA	2	12	19602	19613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952508
16	NC_008712	TCGCGG	2	12	20353	20364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952272
17	NC_008712	TCGCCG	2	12	20852	20863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952272
18	NC_008712	AGCACC	2	12	21249	21260	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119952362
19	NC_008712	GGCCGC	2	12	21290	21301	0 %	0 %	50 %	50 %	119952372
20	NC_008712	GACCAG	2	12	22734	22745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952287
21	NC_008712	ACGATC	2	12	23076	23087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952287
22	NC_008712	AAGGGC	2	12	24317	24328	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119952431
23	NC_008712	ACGGCG	2	12	24651	24662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952431
24	NC_008712	CGACCT	2	12	25011	25022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952505
25	NC_008712	CATCTT	2	12	26907	26918	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119952289
26	NC_008712	CTCGAA	2	12	28406	28417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952344
27	NC_008712	CTCAAC	2	12	29225	29236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008712	GTGGGC	2	12	31405	31416	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952454
29	NC_008712	TCGGGG	2	12	31564	31575	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952454
30	NC_008712	GTTCTT	2	12	31647	31658	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	119952454
31	NC_008712	TCGCAG	2	12	32567	32578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952451
32	NC_008712	CCGCGG	2	12	33067	33078	0 %	0 %	50 %	50 %	119952366
33	NC_008712	GCGTCC	2	12	33493	33504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952366
34	NC_008712	AGGCCC	2	12	34553	34564	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952268
35	NC_008712	CGCGAA	2	12	34926	34937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952268
36	NC_008712	GGCCCA	2	12	36384	36395	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952268
37	NC_008712	AACGGA	2	12	39393	39404	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119952266
38	NC_008712	GCCCCG	2	12	39851	39862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952266
39	NC_008712	GCGCGA	2	12	39863	39874	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952266
40	NC_008712	CGGCTC	2	12	40049	40060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952293
41	NC_008712	GCGATC	2	12	40301	40312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952293
42	NC_008712	GACCTG	2	12	42399	42410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952546
43	NC_008712	GGAAGC	2	12	43041	43052	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119952269
44	NC_008712	GTCGAA	2	12	49194	49205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952443
45	NC_008712	GCCGTC	2	12	58558	58569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952547
46	NC_008712	GGCCAC	2	12	59222	59233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952402
47	NC_008712	CGCGAC	2	12	59553	59564	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952402
48	NC_008712	ACATCG	2	12	60178	60189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952402
49	NC_008712	CGGCTC	2	12	60389	60400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952316
50	NC_008712	CGTGAC	2	12	65556	65567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952500
51	NC_008712	TCGACT	2	12	66058	66069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952292
52	NC_008712	ATCGAC	2	12	66276	66287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952292
53	NC_008712	TTCGAC	2	12	67275	67286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952503
54	NC_008712	CGACGC	2	12	72425	72436	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952353
55	NC_008712	TCAAGG	2	12	72898	72909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952264
56	NC_008712	GACGTC	2	12	74240	74251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952469
57	NC_008712	GACGCG	2	12	78304	78315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008712	CTCGAC	2	12	80449	80460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952411
59	NC_008712	GGCTCG	2	12	83817	83828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952467
60	NC_008712	GGTGCA	2	12	84622	84633	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952467
61	NC_008712	GAGCCA	2	12	90256	90267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952531
62	NC_008712	GCGGTC	2	12	94053	94064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952478
63	NC_008712	GGTCCG	2	12	95375	95386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952478
64	NC_008712	GTCCTC	2	12	96141	96152	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952478
65	NC_008712	CCGACG	2	12	96439	96450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952478
66	NC_008712	GGGTCG	2	12	98272	98283	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952478
67	NC_008712	ACAGGC	2	12	100056	100067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952478
68	NC_008712	CCGCAG	2	12	101166	101177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952370
69	NC_008712	TGATCC	2	12	101949	101960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952514
70	NC_008712	ATCGAT	2	12	103469	103480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008712	GAGCCA	2	12	106891	106902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952430
72	NC_008712	GCGGTC	2	12	110688	110699	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952294
73	NC_008712	GGTCCG	2	12	112010	112021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952294
74	NC_008712	GTCCTC	2	12	112776	112787	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952294
75	NC_008712	CCGACG	2	12	113074	113085	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952294
76	NC_008712	GGGTCG	2	12	114907	114918	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952294
77	NC_008712	ATCCAG	2	12	118017	118028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119952413
78	NC_008712	AGTCGA	2	12	119951	119962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952314
79	NC_008712	TACTGC	2	12	120615	120626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952550
80	NC_008712	GATCCT	2	12	122154	122165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952301
81	NC_008712	ATGGAT	2	12	125033	125044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119952311
82	NC_008712	AGGCTG	2	12	130240	130251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952540
83	NC_008712	CGCTGC	2	12	131501	131512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952540
84	NC_008712	AAGCGG	2	12	134532	134543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119952527
85	NC_008712	GGGACG	2	12	136052	136063	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119952495
86	NC_008712	TGGCCA	2	12	139738	139749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952545
87	NC_008712	GGCGCG	2	12	142495	142506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119952375
88	NC_008712	TGCCGG	2	12	144375	144386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952375
89	NC_008712	CGCGGA	2	12	145806	145817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952375
90	NC_008712	GGTCCG	2	12	152165	152176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008712	CGGGCC	2	12	152194	152205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008712	CGATCG	2	12	153848	153859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952421
93	NC_008712	GCAGTG	2	12	155569	155580	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952380
94	NC_008712	CTGGCC	2	12	156512	156523	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952409
95	NC_008712	TCGCCG	2	12	157221	157232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952409
96	NC_008712	GCACCG	2	12	158103	158114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952409
97	NC_008712	GCTGCG	2	12	158481	158492	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952419
98	NC_008712	AGGACA	2	12	163239	163250	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119952342
99	NC_008712	GCCTGG	2	12	167347	167358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952259
100	NC_008712	TCCGGA	2	12	170514	170525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952358
101	NC_008712	CCGGAG	2	12	171741	171752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952521
102	NC_008712	CGGCGT	2	12	178693	178704	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952361
103	NC_008712	CGGGCC	2	12	181472	181483	0 %	0 %	50 %	50 %	119952414
104	NC_008712	CAGCGG	2	12	186473	186484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952343
105	NC_008712	ACGCCG	2	12	188610	188621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952532
106	NC_008712	AGACCG	2	12	191459	191470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952407
107	NC_008712	GTTCAG	2	12	191508	191519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952407
108	NC_008712	CGCCGG	2	12	192961	192972	0 %	0 %	50 %	50 %	119952449
109	NC_008712	AAAAAG	2	12	195013	195024	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008712	CGTTGC	2	12	195638	195649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952436
111	NC_008712	GCCGTG	2	12	202524	202535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952386
112	NC_008712	CGGCTG	2	12	202888	202899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952386
113	NC_008712	ACCCGG	2	12	204196	204207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952355
114	NC_008712	GCTGGT	2	12	205532	205543	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119952482
115	NC_008712	TGCCTC	2	12	206156	206167	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119952482
116	NC_008712	CACGAC	2	12	207092	207103	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008712	CCTTGA	2	12	207730	207741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952447
118	NC_008712	GAGCAC	2	12	208029	208040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008712	GCCCGC	2	12	212157	212168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119952376
120	NC_008712	AAGGCC	2	12	213047	213058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952412
121	NC_008712	CCTGGT	2	12	213481	213492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952322
122	NC_008712	GCCTGG	2	12	213690	213701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952322
123	NC_008712	TCCTGG	2	12	214959	214970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952450
124	NC_008712	CTCAGG	2	12	217023	217034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952397
125	NC_008712	CAGTGC	2	12	219131	219142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952284
126	NC_008712	ATCTAC	2	12	226721	226732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119952479
127	NC_008712	GGGTGT	2	12	229186	229197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008712	GGGGGA	2	12	233118	233129	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	119952368
129	NC_008712	ATGGCG	2	12	234871	234882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952507
130	NC_008712	ATCAGG	2	12	234931	234942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952507
131	NC_008712	CTGTGG	2	12	235460	235471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119952507
132	NC_008712	GGTGAG	2	12	235749	235760	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119952507
133	NC_008712	GGGTGT	2	12	236988	236999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119952504
134	NC_008712	TCGCCC	2	12	237592	237603	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119952504
135	NC_008712	GCTTGG	2	12	238193	238204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119952504
136	NC_008712	CGAAGG	2	12	243549	243560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119952339
137	NC_008712	CAGCGG	2	12	243638	243649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008712	CGACGG	2	12	244324	244335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952324
139	NC_008712	CGGCCG	2	12	245610	245621	0 %	0 %	50 %	50 %	119952473
140	NC_008712	GACCGG	2	12	246298	246309	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952473
141	NC_008712	CGTGGC	2	12	246366	246377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952473
142	NC_008712	CGTGCA	2	12	246507	246518	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119952473
143	NC_008712	TCCAGC	2	12	246671	246682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119952473
144	NC_008712	CCCGGG	2	12	246938	246949	0 %	0 %	50 %	50 %	119952405
145	NC_008712	GCCAAA	2	12	256640	256651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119952320
146	NC_008712	GGCTCT	2	12	257295	257306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952529
147	NC_008712	CAGCCG	2	12	258510	258521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008712	CTCACC	2	12	259145	259156	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119952327
149	NC_008712	GCCGGA	2	12	261415	261426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952296
150	NC_008712	GCCGGG	2	12	261572	261583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008712	TCCGGT	2	12	264034	264045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952282
152	NC_008712	GTATCG	2	12	268214	268225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119952349
153	NC_008712	TGCGGC	2	12	268439	268450	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952379
154	NC_008712	CCCGCT	2	12	270919	270930	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119952399
155	NC_008712	TGCTGG	2	12	272272	272283	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_008712	GAGCTG	2	12	273772	273783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_008712	CGTTAC	2	12	273930	273941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119952273
158	NC_008712	CGATGA	2	12	281318	281329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119952417
159	NC_008712	GAGACC	2	12	282720	282731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952417
160	NC_008712	ACGGAC	2	12	290385	290396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952263
161	NC_008712	TCATCT	2	12	292765	292776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119952300
162	NC_008712	TCGGCC	2	12	296162	296173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952441
163	NC_008712	TCGGCC	2	12	296369	296380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119952441
164	NC_008712	CGGGCC	2	12	300230	300241	0 %	0 %	50 %	50 %	119952458
165	NC_008712	GGATCG	2	12	300671	300682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952458
166	NC_008712	GGCCGC	2	12	301280	301291	0 %	0 %	50 %	50 %	119952535
167	NC_008712	AGGCCG	2	12	303359	303370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952509
168	NC_008712	CTCGAA	2	12	305845	305856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_008712	GCGAGC	2	12	307342	307353	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119952340
170	NC_008712	GGCCTG	2	12	308628	308639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119952340
171	NC_008712	GGTCGG	2	12	312634	312645	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119952384
172	NC_008712	TGCGAG	2	12	312905	312916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119952384
173	NC_008712	CGACGC	2	12	313186	313197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119952384
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178	NC_008712	GGTCCT	2	12	323133	323144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119952511
179	NC_008712	GCCGCG	2	12	325192	325203	0 %	0 %	50 %	50 %	119952335
180	NC_008712	AACCCG	2	12	327426	327437	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119952461
181	NC_008712	CGAGCA	2	12	327620	327631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119952461

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.