MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC1

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008712	CAGCG	2	10	888	897	20 %	0 %	40 %	40 %	119952388
2	NC_008712	TCGAG	2	10	1787	1796	20 %	20 %	40 %	20 %	119952477
3	NC_008712	GAGCC	2	10	2671	2680	20 %	0 %	40 %	40 %	119952489
4	NC_008712	ACCTG	2	10	2916	2925	20 %	20 %	20 %	40 %	119952489
5	NC_008712	GCTTC	2	10	3768	3777	0 %	40 %	20 %	40 %	119952489
6	NC_008712	TTGCC	2	10	3993	4002	0 %	40 %	20 %	40 %	119952398
7	NC_008712	GCCCG	2	10	4449	4458	0 %	0 %	40 %	60 %	119952398
8	NC_008712	CAGGG	2	10	5017	5026	20 %	0 %	60 %	20 %	119952398
9	NC_008712	CGGGC	2	10	5954	5963	0 %	0 %	60 %	40 %	119952398
10	NC_008712	CGACA	2	10	9792	9801	40 %	0 %	20 %	40 %	119952502
11	NC_008712	CGGGG	2	10	10721	10730	0 %	0 %	80 %	20 %	119952506
12	NC_008712	CGGTG	2	10	10928	10937	0 %	20 %	60 %	20 %	119952506
13	NC_008712	CTCGG	2	10	14219	14228	0 %	20 %	40 %	40 %	119952476
14	NC_008712	GCCGT	2	10	14913	14922	0 %	20 %	40 %	40 %	119952549
15	NC_008712	GCGCG	2	10	16111	16120	0 %	0 %	60 %	40 %	119952429
16	NC_008712	ACCGG	2	10	17401	17410	20 %	0 %	40 %	40 %	119952508
17	NC_008712	CGTGG	2	10	19583	19592	0 %	20 %	60 %	20 %	119952508
18	NC_008712	GCCCG	2	10	21485	21494	0 %	0 %	40 %	60 %	119952372
19	NC_008712	GCCCA	2	10	21740	21749	20 %	0 %	20 %	60 %	119952372
20	NC_008712	CCGGA	2	10	25632	25641	20 %	0 %	40 %	40 %	119952505
21	NC_008712	TCGAC	2	10	26136	26145	20 %	20 %	20 %	40 %	119952505
22	NC_008712	GGGCA	2	10	27589	27598	20 %	0 %	60 %	20 %	119952289
23	NC_008712	GTCAG	2	10	28336	28345	20 %	20 %	40 %	20 %	119952344
24	NC_008712	GGCGT	2	10	29730	29739	0 %	20 %	60 %	20 %	119952285
25	NC_008712	CGCGG	2	10	30619	30628	0 %	0 %	60 %	40 %	119952454
26	NC_008712	TGCGT	2	10	31452	31461	0 %	40 %	40 %	20 %	119952454
27	NC_008712	CGGGC	2	10	32175	32184	0 %	0 %	60 %	40 %	119952454
28	NC_008712	GGCGC	2	10	34130	34139	0 %	0 %	60 %	40 %	119952268
29	NC_008712	TCGGT	2	10	34466	34475	0 %	40 %	40 %	20 %	119952268
30	NC_008712	GGCCG	2	10	34818	34827	0 %	0 %	60 %	40 %	119952268
31	NC_008712	CAGGC	2	10	35105	35114	20 %	0 %	40 %	40 %	119952268
32	NC_008712	GTCGA	2	10	35854	35863	20 %	20 %	40 %	20 %	119952268
33	NC_008712	GGCCG	2	10	36765	36774	0 %	0 %	60 %	40 %	119952367
34	NC_008712	GATCG	2	10	38966	38975	20 %	20 %	40 %	20 %	119952525
35	NC_008712	CCCGG	2	10	39652	39661	0 %	0 %	40 %	60 %	119952266
36	NC_008712	TGGTG	2	10	41661	41670	0 %	40 %	60 %	0 %	119952326
37	NC_008712	GGAGC	2	10	44964	44973	20 %	0 %	60 %	20 %	119952424
38	NC_008712	GACTG	2	10	47428	47437	20 %	20 %	40 %	20 %	119952354
39	NC_008712	CGCGC	2	10	47663	47672	0 %	0 %	40 %	60 %	119952354
40	NC_008712	CTCAC	2	10	49405	49414	20 %	20 %	0 %	60 %	119952443
41	NC_008712	GCGGG	2	10	51408	51417	0 %	0 %	80 %	20 %	119952499
42	NC_008712	CCCAG	2	10	51971	51980	20 %	0 %	20 %	60 %	119952499
43	NC_008712	GAGGT	2	10	52189	52198	20 %	20 %	60 %	0 %	119952499
44	NC_008712	TTCGC	2	10	54738	54747	0 %	40 %	20 %	40 %	119952512
45	NC_008712	GTCGA	2	10	55577	55586	20 %	20 %	40 %	20 %	119952330
46	NC_008712	CCGGT	2	10	56589	56598	0 %	20 %	40 %	40 %	119952330
47	NC_008712	GCCCA	2	10	58614	58623	20 %	0 %	20 %	60 %	119952547
48	NC_008712	GAGGT	2	10	63180	63189	20 %	20 %	60 %	0 %	119952406
49	NC_008712	GGGTC	2	10	65176	65185	0 %	20 %	60 %	20 %	119952392
50	NC_008712	CCCGA	2	10	65529	65538	20 %	0 %	20 %	60 %	119952500
51	NC_008712	GCTCA	2	10	67469	67478	20 %	20 %	20 %	40 %	119952303
52	NC_008712	CCTGA	2	10	69010	69019	20 %	20 %	20 %	40 %	119952281
53	NC_008712	AACCG	2	10	69748	69757	40 %	0 %	20 %	40 %	119952281
54	NC_008712	GGTTG	2	10	70489	70498	0 %	40 %	60 %	0 %	119952437
55	NC_008712	GCTGA	2	10	71593	71602	20 %	20 %	40 %	20 %	119952437
56	NC_008712	CCGAC	2	10	73534	73543	20 %	0 %	20 %	60 %	119952264
57	NC_008712	GGCGT	2	10	73761	73770	0 %	20 %	60 %	20 %	119952264
58	NC_008712	CGTCA	2	10	75676	75685	20 %	20 %	20 %	40 %	119952469
59	NC_008712	ACTCC	2	10	79486	79495	20 %	20 %	0 %	60 %	119952526
60	NC_008712	TCGCC	2	10	81228	81237	0 %	20 %	20 %	60 %	119952351
61	NC_008712	TGGTC	2	10	83097	83106	0 %	40 %	40 %	20 %	119952467
62	NC_008712	TCGCG	2	10	84367	84376	0 %	20 %	40 %	40 %	119952467
63	NC_008712	GCCGC	2	10	84431	84440	0 %	0 %	40 %	60 %	119952467
64	NC_008712	CCGGT	2	10	85577	85586	0 %	20 %	40 %	40 %	119952467
65	NC_008712	GCCGC	2	10	93054	93063	0 %	0 %	40 %	60 %	119952435
66	NC_008712	TGCGG	2	10	94230	94239	0 %	20 %	60 %	20 %	119952478
67	NC_008712	GGTCG	2	10	95193	95202	0 %	20 %	60 %	20 %	119952478
68	NC_008712	TTGGT	2	10	96670	96679	0 %	60 %	40 %	0 %	119952478
69	NC_008712	GCAGT	2	10	96683	96692	20 %	20 %	40 %	20 %	119952478
70	NC_008712	GCGCT	2	10	98379	98388	0 %	20 %	40 %	40 %	119952478
71	NC_008712	CGCCT	2	10	98658	98667	0 %	20 %	20 %	60 %	119952478
72	NC_008712	GCGCC	2	10	98718	98727	0 %	0 %	40 %	60 %	119952478
73	NC_008712	TCCGA	2	10	99951	99960	20 %	20 %	20 %	40 %	119952478
74	NC_008712	GGGCT	2	10	100511	100520	0 %	20 %	60 %	20 %	119952370
75	NC_008712	GCCGC	2	10	109689	109698	0 %	0 %	40 %	60 %	119952288
76	NC_008712	TGCGG	2	10	110865	110874	0 %	20 %	60 %	20 %	119952294
77	NC_008712	GGTCG	2	10	111828	111837	0 %	20 %	60 %	20 %	119952294
78	NC_008712	TTGGT	2	10	113305	113314	0 %	60 %	40 %	0 %	119952294
79	NC_008712	GCAGT	2	10	113318	113327	20 %	20 %	40 %	20 %	119952294
80	NC_008712	GCGCT	2	10	115014	115023	0 %	20 %	40 %	40 %	119952294
81	NC_008712	CGCCT	2	10	115293	115302	0 %	20 %	20 %	60 %	119952294
82	NC_008712	GCGCC	2	10	115353	115362	0 %	0 %	40 %	60 %	119952294
83	NC_008712	GCGCT	2	10	124773	124782	0 %	20 %	40 %	40 %	119952311
84	NC_008712	GCGCC	2	10	125086	125095	0 %	0 %	40 %	60 %	119952311
85	NC_008712	GACCC	2	10	127287	127296	20 %	0 %	20 %	60 %	119952415
86	NC_008712	GCCCG	2	10	127574	127583	0 %	0 %	40 %	60 %	119952346
87	NC_008712	GGTGT	2	10	130285	130294	0 %	40 %	60 %	0 %	119952540
88	NC_008712	CGGCC	2	10	131019	131028	0 %	0 %	40 %	60 %	119952540
89	NC_008712	CGGCG	2	10	132200	132209	0 %	0 %	60 %	40 %	119952472
90	NC_008712	GGCCC	2	10	134467	134476	0 %	0 %	40 %	60 %	119952527
91	NC_008712	CGGCC	2	10	134782	134791	0 %	0 %	40 %	60 %	119952527
92	NC_008712	CGGCC	2	10	136083	136092	0 %	0 %	40 %	60 %	119952495
93	NC_008712	GCCTG	2	10	136103	136112	0 %	20 %	40 %	40 %	119952495
94	NC_008712	CAAAC	2	10	136969	136978	60 %	0 %	0 %	40 %	119952495
95	NC_008712	GTCCG	2	10	140265	140274	0 %	20 %	40 %	40 %	119952385
96	NC_008712	CATTT	2	10	141196	141205	20 %	60 %	0 %	20 %	119952444
97	NC_008712	GCCTG	2	10	141801	141810	0 %	20 %	40 %	40 %	119952375
98	NC_008712	TCTGC	2	10	141837	141846	0 %	40 %	20 %	40 %	119952375
99	NC_008712	CGTCC	2	10	143352	143361	0 %	20 %	20 %	60 %	119952375
100	NC_008712	CGCGG	2	10	144343	144352	0 %	0 %	60 %	40 %	119952375
101	NC_008712	CGGTG	2	10	144618	144627	0 %	20 %	60 %	20 %	119952375
102	NC_008712	AGGTC	2	10	145614	145623	20 %	20 %	40 %	20 %	119952375
103	NC_008712	GCCGT	2	10	148423	148432	0 %	20 %	40 %	40 %	119952332
104	NC_008712	GCACC	2	10	150646	150655	20 %	0 %	20 %	60 %	119952520
105	NC_008712	CGGAA	2	10	150820	150829	40 %	0 %	40 %	20 %	119952520
106	NC_008712	GATCG	2	10	153876	153885	20 %	20 %	40 %	20 %	119952421
107	NC_008712	CGAAG	2	10	155689	155698	40 %	0 %	40 %	20 %	119952380
108	NC_008712	CACCG	2	10	156274	156283	20 %	0 %	20 %	60 %	119952409
109	NC_008712	CGGCG	2	10	156724	156733	0 %	0 %	60 %	40 %	119952409
110	NC_008712	CCCGG	2	10	158698	158707	0 %	0 %	40 %	60 %	119952419
111	NC_008712	GGCCA	2	10	161606	161615	20 %	0 %	40 %	40 %	119952342
112	NC_008712	GGCCG	2	10	162233	162242	0 %	0 %	60 %	40 %	119952342
113	NC_008712	CAGTG	2	10	162331	162340	20 %	20 %	40 %	20 %	119952342
114	NC_008712	AGCTG	2	10	163195	163204	20 %	20 %	40 %	20 %	119952342
115	NC_008712	CCACG	2	10	163933	163942	20 %	0 %	20 %	60 %	119952393
116	NC_008712	TGATG	2	10	164525	164534	20 %	40 %	40 %	0 %	119952291
117	NC_008712	CCATG	2	10	164723	164732	20 %	20 %	20 %	40 %	119952291
118	NC_008712	CCTTG	2	10	166111	166120	0 %	40 %	20 %	40 %	119952280
119	NC_008712	GGCTG	2	10	166683	166692	0 %	20 %	60 %	20 %	119952280
120	NC_008712	GGCGC	2	10	167317	167326	0 %	0 %	60 %	40 %	119952259
121	NC_008712	GCGGT	2	10	170242	170251	0 %	20 %	60 %	20 %	119952358
122	NC_008712	CTGAG	2	10	171213	171222	20 %	20 %	40 %	20 %	119952516
123	NC_008712	TGCGG	2	10	171710	171719	0 %	20 %	60 %	20 %	119952521
124	NC_008712	CACGG	2	10	172649	172658	20 %	0 %	40 %	40 %	119952334
125	NC_008712	CGGGT	2	10	172711	172720	0 %	20 %	60 %	20 %	119952334
126	NC_008712	GTCCA	2	10	173907	173916	20 %	20 %	20 %	40 %	119952383
127	NC_008712	GGTCA	2	10	177923	177932	20 %	20 %	40 %	20 %	119952361
128	NC_008712	GCTCC	2	10	179975	179984	0 %	20 %	20 %	60 %	119952262
129	NC_008712	CCGAA	2	10	181286	181295	40 %	0 %	20 %	40 %	119952414
130	NC_008712	CAAGG	2	10	182021	182030	40 %	0 %	40 %	20 %	119952313
131	NC_008712	GGTCG	2	10	185089	185098	0 %	20 %	60 %	20 %	119952446
132	NC_008712	GACCG	2	10	185797	185806	20 %	0 %	40 %	40 %	119952343
133	NC_008712	ACGGC	2	10	186354	186363	20 %	0 %	40 %	40 %	119952343
134	NC_008712	ACCGG	2	10	188396	188405	20 %	0 %	40 %	40 %	119952532
135	NC_008712	GCGGG	2	10	189248	189257	0 %	0 %	80 %	20 %	119952532
136	NC_008712	GCCGA	2	10	191104	191113	20 %	0 %	40 %	40 %	119952407
137	NC_008712	CGTCG	2	10	191658	191667	0 %	20 %	40 %	40 %	119952407
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140	NC_008712	CCTGA	2	10	193301	193310	20 %	20 %	20 %	40 %	119952449
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142	NC_008712	TCGCA	2	10	200594	200603	20 %	20 %	20 %	40 %	119952310
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246	NC_008712	ACGGC	2	10	320858	320867	20 %	0 %	40 %	40 %	119952338
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249	NC_008712	ACGGC	2	10	324359	324368	20 %	0 %	40 %	40 %	119952433
250	NC_008712	GCGTC	2	10	325146	325155	0 %	20 %	40 %	40 %	119952335
251	NC_008712	ACGGC	2	10	327178	327187	20 %	0 %	40 %	40 %	119952461
252	NC_008712	ACCCG	2	10	327285	327294	20 %	0 %	20 %	60 %	119952461

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.