MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1 plasmid TC1

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008712	AAGA	2	8	16504	16511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008712	CTGG	2	8	23404	23411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008712	GCGA	2	8	26479	26486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008712	GATC	2	8	29125	29132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008712	ACCC	2	8	37813	37820	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008712	GGAA	2	8	37841	37848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008712	CGGC	2	8	42802	42809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008712	GCCC	2	8	43960	43967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008712	CGGC	2	8	43999	44006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008712	CCGA	2	8	44049	44056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008712	ACCG	2	8	51062	51069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008712	TGTT	2	8	56953	56960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008712	CCAC	2	8	57142	57149	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008712	ATTC	2	8	61944	61951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008712	CAGA	2	8	64379	64386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008712	CCCA	2	8	68590	68597	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_008712	CCGA	2	8	77924	77931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008712	GAAC	2	8	86563	86570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008712	GGCG	2	8	86635	86642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008712	CACG	2	8	103393	103400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008712	GGCC	2	8	103566	103573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008712	GCCA	2	8	103730	103737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008712	CAGC	2	8	103804	103811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008712	GAAC	2	8	103921	103928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008712	GGCG	2	8	103993	104000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008712	AATC	2	8	115763	115770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008712	GCCG	2	8	118272	118279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008712	GCAA	2	8	120332	120339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008712	GCCC	2	8	120693	120700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_008712	CAAG	2	8	121121	121128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008712	TACA	2	8	121137	121144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008712	CAAC	2	8	123712	123719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008712	GATC	2	8	124179	124186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008712	TTTG	2	8	125634	125641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008712	CGAG	2	8	127879	127886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008712	CAGG	2	8	132079	132086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008712	TGAC	2	8	140831	140838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008712	AGGC	2	8	141497	141504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008712	CGGC	2	8	149960	149967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008712	GATC	2	8	152074	152081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008712	CGCC	2	8	152082	152089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008712	GCCG	2	8	152211	152218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008712	GTTT	2	8	152920	152927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008712	AGAA	2	8	156098	156105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008712	GCCC	2	8	165035	165042	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_008712	CCTG	2	8	166005	166012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008712	GAAA	2	8	167592	167599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008712	CGTC	2	8	169185	169192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008712	TTCC	2	8	169283	169290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008712	CCTC	2	8	170722	170729	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_008712	GCCG	2	8	171226	171233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008712	GGCC	2	8	172404	172411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008712	GAAA	2	8	173270	173277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008712	CAGA	2	8	173631	173638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008712	CCAG	2	8	173694	173701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008712	CGGC	2	8	173854	173861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008712	CCTG	2	8	174879	174886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008712	TCCC	2	8	179151	179158	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_008712	CGGC	3	12	181155	181166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008712	AACC	2	8	181661	181668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008712	CTTG	2	8	185501	185508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008712	TGAC	2	8	185735	185742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008712	CCAT	2	8	187358	187365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008712	TGCA	2	8	193594	193601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008712	GGAC	2	8	193728	193735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008712	CATG	2	8	194258	194265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008712	GCAG	2	8	194330	194337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008712	GGAG	2	8	195093	195100	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008712	TTCG	2	8	195292	195299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008712	CCGG	2	8	195357	195364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008712	CCTC	2	8	199771	199778	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_008712	GGCC	2	8	201603	201610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008712	GGAC	2	8	201616	201623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008712	GGCT	2	8	201973	201980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008712	ATCG	2	8	206635	206642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008712	CTGT	2	8	208706	208713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008712	CCGG	2	8	214550	214557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008712	GGCA	2	8	214602	214609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008712	CAGG	2	8	219450	219457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008712	GTCT	2	8	221687	221694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008712	TTTG	2	8	223445	223452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008712	AACT	2	8	227180	227187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008712	AAGG	2	8	228749	228756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008712	CGCT	2	8	229159	229166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008712	GGTG	2	8	229350	229357	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008712	CCCA	2	8	229922	229929	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_008712	CAAT	2	8	231006	231013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008712	GAGC	2	8	231250	231257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008712	GATT	2	8	232005	232012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008712	ACTT	2	8	238324	238331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008712	CCCA	2	8	238699	238706	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008712	AAGG	2	8	242804	242811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008712	CCCT	2	8	244829	244836	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_008712	CTGA	2	8	245208	245215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008712	CCCG	2	8	245252	245259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_008712	GCTG	2	8	245341	245348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008712	CTTG	2	8	250220	250227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008712	GAGT	2	8	258530	258537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008712	GTTG	2	8	263188	263195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008712	CGAA	2	8	267545	267552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008712	TTGG	2	8	270045	270052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008712	GGCT	2	8	271053	271060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008712	CTCA	2	8	271936	271943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008712	GCAG	2	8	273471	273478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008712	TCGC	2	8	273671	273678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008712	TTGG	2	8	275814	275821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008712	CAAT	2	8	277066	277073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008712	CGTG	2	8	278527	278534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008712	AGGA	2	8	278608	278615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008712	GAAG	2	8	279492	279499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008712	CGCC	2	8	280018	280025	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008712	ATGA	2	8	280287	280294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008712	CAGC	2	8	286044	286051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008712	GAAG	2	8	286229	286236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008712	CTGG	2	8	288136	288143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008712	GCCT	2	8	288216	288223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008712	GGTC	2	8	293935	293942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008712	CCGG	2	8	295667	295674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008712	GCCC	2	8	300973	300980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008712	TCGA	2	8	305533	305540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008712	CGGC	2	8	305589	305596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008712	GGAC	2	8	305918	305925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008712	CTAC	2	8	314007	314014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008712	TCGA	2	8	314138	314145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008712	CGGT	2	8	315340	315347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008712	TGCC	2	8	324071	324078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008712	GACA	2	8	324119	324126	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008712	GCAA	2	8	328128	328135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.