MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008711	TCGGCG	2	12	18188	18199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008711	AGGTCC	2	12	37117	37128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008711	GAAGTT	2	12	94203	94214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008711	CCGGTT	2	12	150217	150228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008711	GTTCTG	2	12	152994	153005	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008711	CCCACC	2	12	155897	155908	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_008711	GTTCTG	2	12	160278	160289	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008711	CCCACC	2	12	163180	163191	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
9	NC_008711	GCTGGA	2	12	195947	195958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008711	AGTTTT	2	12	208845	208856	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008711	ACGCCC	3	18	226743	226760	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008711	CCTGAG	2	12	227453	227464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008711	TGGCCA	2	12	245213	245224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008711	GCTGCC	2	12	245412	245423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008711	CCGTTC	2	12	291467	291478	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008711	CACGCC	2	12	297464	297475	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008711	GGTGCG	2	12	312569	312580	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008711	CTTGCG	2	12	318544	318555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008711	CTACGG	2	12	324818	324829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008711	GCGAGC	2	12	324838	324849	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008711	GGACGG	2	12	414620	414631	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008711	GAGTGG	4	24	416063	416086	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008711	ATCCGA	2	12	421324	421335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008711	AAAGGT	2	12	432075	432086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008711	GCATCC	2	12	464063	464074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008711	CTAAGC	2	12	505204	505215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008711	GCTTGA	2	12	508812	508823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008711	GGAGAG	2	12	515171	515182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008711	GTCAAG	2	12	533914	533925	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008711	ACCGTG	2	12	579665	579676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008711	TTCGAG	2	12	580243	580254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008711	GGCTCG	2	12	621718	621729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008711	ATTGAG	2	12	678549	678560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008711	CGGCCA	2	12	679034	679045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008711	GCCGTC	2	12	760050	760061	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008711	TCCAAA	2	12	869097	869108	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008711	TATATT	2	12	872438	872449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008711	TTGCTA	2	12	878947	878958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008711	TGCTCG	2	12	906673	906684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008711	GTTCTG	2	12	965288	965299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008711	CCCACC	2	12	968190	968201	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_008711	TCCTTG	2	12	997102	997113	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008711	AGGCCG	2	12	1061744	1061755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008711	GCCCAC	2	12	1062562	1062573	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008711	ATCCGA	2	12	1079426	1079437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008711	AGCGCG	2	12	1229226	1229237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008711	TCCCGT	2	12	1244128	1244139	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008711	CCTCGG	2	12	1262965	1262976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008711	CCACGT	2	12	1289982	1289993	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008711	GAAAGC	2	12	1292738	1292749	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008711	TGACGG	2	12	1411538	1411549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008711	CCGATG	2	12	1434879	1434890	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008711	GTTCGG	2	12	1476513	1476524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008711	AGGGTG	2	12	1489272	1489283	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008711	GACCCG	2	12	1490201	1490212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008711	CTCCCC	2	12	1530233	1530244	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_008711	AAGCCA	2	12	1537082	1537093	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008711	CAGCGC	2	12	1554621	1554632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008711	GAGCGG	2	12	1609806	1609817	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008711	GTCCGG	2	12	1624189	1624200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008711	CAGCTC	2	12	1646151	1646162	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008711	CCCGGA	2	12	1672365	1672376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008711	TCCGAT	2	12	1672583	1672594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008711	CCGGGG	2	12	1706149	1706160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008711	GGGGCA	2	12	1764360	1764371	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008711	CCGGTT	2	12	1795630	1795641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008711	GTTCTG	2	12	1798405	1798416	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008711	CCCACC	2	12	1801307	1801318	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_008711	GCCATC	2	12	1834386	1834397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008711	CGGCTT	2	12	1834802	1834813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008711	GTACTT	2	12	1835605	1835616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008711	TTGTTC	2	12	1899997	1900008	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008711	TGCTTG	2	12	1904201	1904212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008711	CCGTGG	2	12	1938509	1938520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008711	GCTTTT	2	12	2017095	2017106	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008711	GGGTCA	2	12	2023976	2023987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008711	AACGGG	2	12	2027686	2027697	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008711	AGTTCG	2	12	2027765	2027776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008711	ACTGGG	2	12	2031887	2031898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008711	GCGCAG	2	12	2040625	2040636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008711	GCGAAA	2	12	2110801	2110812	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008711	GTTCCG	2	12	2128182	2128193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008711	GCCGGG	2	12	2208073	2208084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008711	ATAAAC	2	12	2259651	2259662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008711	ACCCCC	2	12	2359737	2359748	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_008711	TCGGAA	2	12	2433917	2433928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008711	ACTCGG	2	12	2485184	2485195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008711	CACCTC	2	12	2488631	2488642	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008711	CGGCCT	2	12	2539455	2539466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008711	GTCCGA	2	12	2539929	2539940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008711	CCTGGC	2	12	2593941	2593952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008711	TGTTGC	2	12	2601496	2601507	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008711	TGCCGG	2	12	2614578	2614589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008711	GCCTCC	2	12	2641844	2641855	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008711	GCCTCC	2	12	2641861	2641872	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008711	CGGCTT	2	12	2704827	2704838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008711	GGACCC	2	12	2891683	2891694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008711	CAGGCA	2	12	2906613	2906624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008711	TCAGCG	2	12	2953121	2953132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008711	ATCGCC	2	12	2954206	2954217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008711	ATGACC	2	12	2958685	2958696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008711	CTCGGG	2	12	3092788	3092799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008711	GACAAT	2	12	3092916	3092927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008711	GTTCCG	2	12	3241163	3241174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008711	CTAAAA	2	12	3244353	3244364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008711	AGGACC	2	12	3312418	3312429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008711	TCGACG	2	12	3312587	3312598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008711	TCAACG	2	12	3312881	3312892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008711	AACTGG	2	12	3313946	3313957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008711	ACGCCG	2	12	3334690	3334701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008711	GCTGGT	6	36	3339686	3339721	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008711	GCGCTG	2	12	3452828	3452839	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008711	GACGGC	2	12	3457768	3457779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008711	CGAGGC	2	12	3458343	3458354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008711	ATTTCG	2	12	3481662	3481673	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008711	GCATCT	2	12	3502495	3502506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008711	GAAATC	2	12	3503170	3503181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008711	CCGGCC	2	12	3503726	3503737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008711	AGCGGC	2	12	3548356	3548367	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008711	GCACCC	2	12	3557342	3557353	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008711	ATTGTC	2	12	3612106	3612117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008711	ATGCAT	2	12	3617068	3617079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008711	GCCCGC	3	18	3677632	3677649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008711	GCACCA	2	12	3677754	3677765	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008711	AGCGGC	2	12	3700154	3700165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008711	CGGAAT	2	12	3733706	3733717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008711	TCAGCG	2	12	3796147	3796158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008711	TCCTGG	2	12	3796510	3796521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008711	CTGGTG	2	12	3796696	3796707	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008711	CCCCAA	2	12	3843162	3843173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008711	CCCACC	2	12	3856887	3856898	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
132	NC_008711	CGTTGC	2	12	3940194	3940205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008711	CCCGGC	2	12	3940456	3940467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008711	CTGGTG	2	12	3968526	3968537	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_008711	CGTAGT	2	12	3975579	3975590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_008711	CCACGT	2	12	3976188	3976199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008711	ACACCC	2	12	4041852	4041863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008711	TTACGG	2	12	4110268	4110279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_008711	CAGAAC	2	12	4110350	4110361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008711	TTACGG	2	12	4119215	4119226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_008711	CAGAAC	2	12	4119297	4119308	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008711	GGTCAT	2	12	4179661	4179672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_008711	GGACGT	2	12	4330290	4330301	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_008711	CGTGTT	2	12	4345280	4345291	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_008711	GGAGCT	2	12	4368018	4368029	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_008711	GGGATG	2	12	4393124	4393135	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008711	AAGCGA	2	12	4395181	4395192	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_008711	CTCGCG	2	12	4400245	4400256	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008711	GCCAGC	2	12	4403522	4403533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008711	TGGGAT	2	12	4451834	4451845	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008711	CAACGT	2	12	4473433	4473444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008711	ACCCCC	2	12	4546235	4546246	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
153	NC_008711	AGTATC	2	12	4572630	4572641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_008711	CACTCT	2	12	4593922	4593933	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.