MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter aurescens TC1

Total Repeats: 1866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008711	CGTTGG	2	12	3702567	3702578	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119963582
1502	NC_008711	GAACAC	2	12	3714294	3714305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119960921
1503	NC_008711	GGCGTC	2	12	3716358	3716369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119961869
1504	NC_008711	GCCAAG	2	12	3716619	3716630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119961869
1505	NC_008711	CGTGGC	2	12	3717149	3717160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119961869
1506	NC_008711	GGCACA	2	12	3717260	3717271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119961869
1507	NC_008711	GCTCCG	2	12	3719524	3719535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119964292
1508	NC_008711	GTTTCG	2	12	3722528	3722539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119962502
1509	NC_008711	GTCCTG	2	12	3724753	3724764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119961755
1510	NC_008711	GGCGAT	2	12	3729001	3729012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119962053
1511	NC_008711	ACCCGC	2	12	3731281	3731292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119961193
1512	NC_008711	CGGCAA	2	12	3731558	3731569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119961193
1513	NC_008711	GGGAAC	2	12	3732957	3732968	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119961193
1514	NC_008711	CGGCTT	2	12	3733283	3733294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119961193
1515	NC_008711	ACGCGG	2	12	3734827	3734838	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119964384
1516	NC_008711	CTCGGG	2	12	3736157	3736168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119963658
1517	NC_008711	ATGCCG	2	12	3736233	3736244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119963658
1518	NC_008711	CAGTGA	2	12	3738662	3738673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119963463
1519	NC_008711	GTCGGG	3	18	3745515	3745532	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119960608
1520	NC_008711	CCGTCG	3	18	3745537	3745554	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960608
1521	NC_008711	GTCGGG	2	12	3745575	3745586	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119960608
1522	NC_008711	CCGTCG	2	12	3745609	3745620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960608
1523	NC_008711	CCGTCG	2	12	3745627	3745638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960608
1524	NC_008711	CCGTCG	3	18	3745645	3745662	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960608
1525	NC_008711	ACCGTC	2	12	3745692	3745703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119960608
1526	NC_008711	CCGTCG	3	18	3745711	3745728	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960608
1527	NC_008711	GAAGCC	2	12	3748305	3748316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119964195
1528	NC_008711	GTGGGC	2	12	3751398	3751409	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119960892
1529	NC_008711	CGTCGC	2	12	3754944	3754955	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119962344
1530	NC_008711	TCGCCG	2	12	3756120	3756131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119963220
1531	NC_008711	ACGCCA	2	12	3761735	3761746	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119963554
1532	NC_008711	TGTTGG	2	12	3765314	3765325	0 %	50 %	50 %	0 %	119960865
1533	NC_008711	CGGCCT	2	12	3766704	3766715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119964006
1534	NC_008711	CATGAT	2	12	3766755	3766766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119964006
1535	NC_008711	GGCCTG	2	12	3767494	3767505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119964006
1536	NC_008711	TCGGCA	2	12	3769186	3769197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119962931
1537	NC_008711	GATGCC	2	12	3770718	3770729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119962931
1538	NC_008711	CGCGGA	2	12	3773604	3773615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119963421
1539	NC_008711	CCATCC	2	12	3778102	3778113	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119960616
1540	NC_008711	CATCAC	2	12	3778439	3778450	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119960616
1541	NC_008711	CGGCAG	2	12	3778927	3778938	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119960616
1542	NC_008711	CCACGT	2	12	3779642	3779653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119962895
1543	NC_008711	GTCGGC	2	12	3782859	3782870	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119960824
1544	NC_008711	CCGTCG	2	12	3783130	3783141	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960824
1545	NC_008711	CCTGCC	2	12	3783275	3783286	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119960824
1546	NC_008711	GCCGTT	2	12	3788281	3788292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119962247
1547	NC_008711	GCCGGA	2	12	3788512	3788523	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119962247
1548	NC_008711	GGCCGC	2	12	3794276	3794287	0 %	0 %	50 %	50 %	119963420
1549	NC_008711	TGGTCC	2	12	3804195	3804206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119961158
1550	NC_008711	CGGGCG	2	12	3807813	3807824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119963494
1551	NC_008711	TCTACC	2	12	3809087	3809098	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119963427
1552	NC_008711	ACAGCA	2	12	3810435	3810446	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119962973
1553	NC_008711	CCATCC	2	12	3813375	3813386	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119960925
1554	NC_008711	TCATCG	2	12	3821187	3821198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119961005
1555	NC_008711	GGAGAT	2	12	3822767	3822778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119961976
1556	NC_008711	GCCACG	2	12	3824381	3824392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119961738
1557	NC_008711	CATCGT	2	12	3828837	3828848	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119962915
1558	NC_008711	TCCCCG	2	12	3831772	3831783	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119962073
1559	NC_008711	CACCGC	2	12	3836171	3836182	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119964275
1560	NC_008711	TGAACA	2	12	3843432	3843443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119962161
1561	NC_008711	GTTCGC	2	12	3845817	3845828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119963942
1562	NC_008711	CGATGG	2	12	3847832	3847843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119963388
1563	NC_008711	CATGGA	2	12	3848405	3848416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119962837
1564	NC_008711	TCCGGC	2	12	3858400	3858411	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119962621
1565	NC_008711	GCCCGG	2	12	3859375	3859386	0 %	0 %	50 %	50 %	119961481
1566	NC_008711	ATCGGC	2	12	3859737	3859748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119961481
1567	NC_008711	CATCGA	2	12	3859814	3859825	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119961481
1568	NC_008711	CAAGGC	2	12	3860522	3860533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119961481
1569	NC_008711	CACGTC	2	12	3862073	3862084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119962385
1570	NC_008711	TGCCGC	2	12	3862132	3862143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119962385
1571	NC_008711	GCGCCC	2	12	3862578	3862589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119962385
1572	NC_008711	ATGCAG	2	12	3867876	3867887	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119960747
1573	NC_008711	GCTTTC	2	12	3873214	3873225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119964180
1574	NC_008711	CCGACG	2	12	3874167	3874178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119960851
1575	NC_008711	GCTCAA	2	12	3876016	3876027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119963114
1576	NC_008711	ACGCCT	2	12	3877715	3877726	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119964519
1577	NC_008711	CACCGG	3	18	3880079	3880096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119963715
1578	NC_008711	CTCATT	2	12	3880465	3880476	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119963715
1579	NC_008711	CAGGAA	2	12	3881758	3881769	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119961094
1580	NC_008711	GGCACG	2	12	3881803	3881814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119961094
1581	NC_008711	CGCCAC	2	12	3884996	3885007	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119963988
1582	NC_008711	GCCACC	2	12	3885500	3885511	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119964054
1583	NC_008711	GGCGTC	2	12	3894647	3894658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119962151
1584	NC_008711	CCAGCA	2	12	3900286	3900297	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119963073
1585	NC_008711	GTCGGC	2	12	3900743	3900754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119961624
1586	NC_008711	CGGCTG	2	12	3901034	3901045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119961624
1587	NC_008711	GGGAGC	2	12	3902391	3902402	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119962688
1588	NC_008711	GTGGCA	2	12	3904606	3904617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119960767
1589	NC_008711	CGACAC	2	12	3906110	3906121	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119961319
1590	NC_008711	TTGTGG	2	12	3911613	3911624	0 %	50 %	50 %	0 %	119961598
1591	NC_008711	TCGAGG	2	12	3914529	3914540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119962754
1592	NC_008711	CACGGT	2	12	3927962	3927973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119963393
1593	NC_008711	CCCCGG	2	12	3929498	3929509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119961456
1594	NC_008711	GATTGT	2	12	3932361	3932372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119964267
1595	NC_008711	GCACCG	2	12	3934605	3934616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119962699
1596	NC_008711	CAGCCA	2	12	3937562	3937573	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119960815
1597	NC_008711	ACGGCA	2	12	3938968	3938979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119962511
1598	NC_008711	CTTCGT	2	12	3941573	3941584	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119962235
1599	NC_008711	CCTTGA	2	12	3942755	3942766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119962235
1600	NC_008711	TTCCTG	2	12	3950617	3950628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119963124
1601	NC_008711	TCGCTG	2	12	3950726	3950737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119963124
1602	NC_008711	GGCCAG	2	12	3951351	3951362	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119962609
1603	NC_008711	CGTCGC	2	12	3955285	3955296	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119960928
1604	NC_008711	AGTCGT	2	12	3957912	3957923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119964417
1605	NC_008711	ACGCGG	2	12	3959890	3959901	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119961430
1606	NC_008711	GGGCCT	2	12	3960927	3960938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119962408
1607	NC_008711	GGCGAA	2	12	3963530	3963541	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119962814
1608	NC_008711	CATCAA	2	12	3964692	3964703	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119961213
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1610	NC_008711	CGCTGC	2	12	3968239	3968250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119962953
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1719	NC_008711	GCCGAC	2	12	4257523	4257534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119962490
1720	NC_008711	TCACGA	2	12	4264337	4264348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119963611
1721	NC_008711	GAAGGC	2	12	4264572	4264583	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119963611
1722	NC_008711	GGCCGC	2	12	4264590	4264601	0 %	0 %	50 %	50 %	119963611
1723	NC_008711	AGGCGT	2	12	4264946	4264957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119963611
1724	NC_008711	ATCCCG	2	12	4266782	4266793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119962613
1725	NC_008711	TCACCA	2	12	4266948	4266959	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119962613
1726	NC_008711	GGCCAA	2	12	4267568	4267579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119962336
1727	NC_008711	CATCCA	2	12	4267852	4267863	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119962336
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1729	NC_008711	CCCGGG	2	12	4276483	4276494	0 %	0 %	50 %	50 %	119962181
1730	NC_008711	GACCGC	2	12	4278179	4278190	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119961790
1731	NC_008711	GTTCCA	2	12	4281898	4281909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119961506
1732	NC_008711	GGTATT	2	12	4287358	4287369	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119962202
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1734	NC_008711	GCGGAT	2	12	4298797	4298808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119964142
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1745	NC_008711	TGCCCA	2	12	4317781	4317792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119961101
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1747	NC_008711	CCGTGG	2	12	4325499	4325510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119960602
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1749	NC_008711	ACGGCC	2	12	4329451	4329462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119961805
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1785	NC_008711	CCGTCA	2	12	4416634	4416645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119963834
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1813	NC_008711	TCGCCG	2	12	4496987	4496998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119963562
1814	NC_008711	TCCACT	2	12	4505811	4505822	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119962778
1815	NC_008711	TCCATC	2	12	4510258	4510269	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119961025
1816	NC_008711	GCTCAC	2	12	4514432	4514443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119963299
1817	NC_008711	CGGCAA	2	12	4516609	4516620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119961962
1818	NC_008711	CGCGGC	2	12	4516723	4516734	0 %	0 %	50 %	50 %	119961962
1819	NC_008711	TGGGCC	2	12	4518234	4518245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119961165
1820	NC_008711	CGCTGA	2	12	4518516	4518527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119961165
1821	NC_008711	CGGCGC	2	12	4518859	4518870	0 %	0 %	50 %	50 %	119961165
1822	NC_008711	AAGGTG	2	12	4519776	4519787	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119963540
1823	NC_008711	GCCCTG	2	12	4519933	4519944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119962771
1824	NC_008711	GGCCTG	2	12	4522282	4522293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119961825
1825	NC_008711	TTGGTA	2	12	4525494	4525505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119963486
1826	NC_008711	TCCGGG	2	12	4525952	4525963	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119963486
1827	NC_008711	ACCAGC	2	12	4529533	4529544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119961328
1828	NC_008711	TGAACC	2	12	4529598	4529609	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119961328
1829	NC_008711	CGAACG	2	12	4530677	4530688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119963708
1830	NC_008711	ATCCTC	2	12	4530924	4530935	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119963708
1831	NC_008711	ATCGCC	2	12	4534538	4534549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119963595
1832	NC_008711	TGACCG	2	12	4536728	4536739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119963533
1833	NC_008711	CCGCTG	2	12	4538576	4538587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119964414
1834	NC_008711	ACGCCG	2	12	4538657	4538668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119964414
1835	NC_008711	ATCAAG	2	12	4538937	4538948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119964414
1836	NC_008711	GCCTGG	3	18	4544012	4544029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119963887
1837	NC_008711	GACGGC	2	12	4545409	4545420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119962193
1838	NC_008711	AGGAAC	2	12	4546962	4546973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119961057
1839	NC_008711	CGGCCG	2	12	4547038	4547049	0 %	0 %	50 %	50 %	119961057
1840	NC_008711	GCGAGA	2	12	4547101	4547112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119961057
1841	NC_008711	GAACTC	2	12	4547588	4547599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119961057
1842	NC_008711	GGCGAT	2	12	4547972	4547983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119961057
1843	NC_008711	GCTTGA	2	12	4549282	4549293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119961581
1844	NC_008711	GTTCTC	2	12	4549956	4549967	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119962051
1845	NC_008711	TGACCA	2	12	4552997	4553008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119960691
1846	NC_008711	TTGCCC	2	12	4553706	4553717	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119964438
1847	NC_008711	TTGAGG	2	12	4558147	4558158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119962209
1848	NC_008711	CCGTGG	2	12	4558373	4558384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119962209
1849	NC_008711	AGGAGC	2	12	4559970	4559981	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119960996
1850	NC_008711	CGGTAT	2	12	4561757	4561768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119960582
1851	NC_008711	TGTCAG	2	12	4565064	4565075	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119963322
1852	NC_008711	CCCTTG	2	12	4565131	4565142	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119963322
1853	NC_008711	TGCCTG	2	12	4566023	4566034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119963322
1854	NC_008711	AGCCGT	2	12	4567076	4567087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119963322
1855	NC_008711	CGTTCA	2	12	4569598	4569609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119961288
1856	NC_008711	CTCATG	2	12	4571148	4571159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119960540
1857	NC_008711	GCTCCC	2	12	4573170	4573181	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119963122
1858	NC_008711	GCCGTA	2	12	4578149	4578160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119964423
1859	NC_008711	CTGCCG	2	12	4582678	4582689	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119961113
1860	NC_008711	CGCTGC	2	12	4582709	4582720	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119961113
1861	NC_008711	GATGAA	2	12	4593250	4593261	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119963412
1862	NC_008711	ATGGCG	2	12	4594460	4594471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119963842
1863	NC_008711	CTCGGA	2	12	4594702	4594713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119961218
1864	NC_008711	ATGTCG	2	12	4595039	4595050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119961218
1865	NC_008711	GCCCTG	2	12	4595775	4595786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119963653
1866	NC_008711	GAGAAT	2	12	4596514	4596525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119961135

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.