MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia turicatae 91E135 chromosome

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008710	TAAATT	2	12	8323	8334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008710	TAATTA	2	12	31122	31133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008710	TTTAAT	2	12	31812	31823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008710	AACATA	2	12	78916	78927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008710	TTAAAT	2	12	106653	106664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008710	TAAAAA	2	12	114811	114822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008710	ATAAAA	2	12	145533	145544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008710	AAATAA	2	12	147654	147665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008710	TAAACT	2	12	192153	192164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008710	AAAAAT	2	12	201037	201048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008710	CAATCA	2	12	201092	201103	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008710	TAAAAT	2	12	238853	238864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008710	CTATAT	2	12	321673	321684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008710	TCACAA	2	12	329970	329981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008710	GAATTA	2	12	340347	340358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008710	GAATAA	2	12	342055	342066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008710	ATTTAT	2	12	416212	416223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008710	ATTAGT	2	12	435792	435803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008710	TTCGCC	2	12	445470	445481	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008710	TTATTT	2	12	446197	446208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008710	TATATT	2	12	449026	449037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008710	TTGTAT	2	12	461888	461899	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008710	TTGTAT	2	12	473089	473100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008710	ATTTTT	2	12	479865	479876	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008710	ATTGGT	2	12	595636	595647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008710	GTTTAA	2	12	599398	599409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008710	TTATAT	2	12	617372	617383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008710	TTTGAT	2	12	640442	640453	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008710	TATTTG	2	12	677218	677229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008710	TAAAAA	2	12	709093	709104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008710	TGAAAT	2	12	749629	749640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008710	TTATAA	2	12	789225	789236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008710	TTTTAT	2	12	801196	801207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008710	GATTTA	2	12	801312	801323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008710	TGTTTT	2	12	801626	801637	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008710	TATTTT	2	12	898690	898701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008710	GTTAAT	2	12	917186	917197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008710	TTTGAT	2	12	917250	917261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.