MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia turicatae 91E135 chromosome

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008710	TATAC	2	10	25027	25036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008710	TATAT	2	10	45958	45967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008710	AAAAT	2	10	46694	46703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008710	ATTTT	2	10	48845	48854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008710	ATATA	2	10	48857	48866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008710	AAAAT	2	10	79027	79036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008710	TAAAA	2	10	79058	79067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008710	TTAAA	2	10	80477	80486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008710	TTTAA	2	10	80946	80955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008710	TAAAA	2	10	85470	85479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008710	AAAAC	2	10	101006	101015	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008710	CTAAA	2	10	101202	101211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008710	TAATA	2	10	134402	134411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008710	TAACA	2	10	144287	144296	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008710	AAAAT	2	10	177337	177346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008710	ATACA	2	10	181326	181335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008710	TAAAA	2	10	192193	192202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008710	ATTGT	2	10	204531	204540	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008710	AAATA	2	10	230106	230115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008710	GATAT	2	10	251284	251293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008710	AAAGA	2	10	251345	251354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008710	AGTCC	2	10	257578	257587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008710	GTTAA	2	10	257625	257634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008710	TTCTT	2	10	342020	342029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008710	TAAAA	2	10	358935	358944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008710	TAGTT	2	10	360466	360475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008710	TAAAA	2	10	392479	392488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008710	ATAAA	2	10	394709	394718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008710	TTAAC	2	10	405933	405942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008710	TAAAA	2	10	415986	415995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008710	CAAAT	2	10	416192	416201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008710	CTCCC	2	10	438136	438145	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_008710	AATGC	2	10	438409	438418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008710	AAATA	2	10	438931	438940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008710	AATTA	2	10	439916	439925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008710	ATTAA	2	10	449907	449916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008710	AATAT	2	10	457461	457470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008710	TAAAG	2	10	459195	459204	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008710	AATAT	2	10	461900	461909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008710	ATTTA	2	10	464927	464936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008710	CTTTT	2	10	473030	473039	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008710	TTATT	2	10	483085	483094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008710	ATTTT	2	10	495179	495188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008710	TTATT	2	10	497312	497321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008710	TTGGT	2	10	511896	511905	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008710	AGTTT	2	10	535166	535175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008710	ATATA	2	10	544729	544738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008710	ATTAA	2	10	556112	556121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008710	TAAAT	2	10	571639	571648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008710	TATTT	2	10	571740	571749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008710	ATGAA	2	10	582453	582462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008710	ATTTT	2	10	582574	582583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008710	TTTAT	2	10	591502	591511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008710	ACTAT	2	10	592492	592501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008710	ATTTT	2	10	597300	597309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008710	AATTT	2	10	598042	598051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008710	ATTAA	2	10	598117	598126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008710	ATTAT	2	10	606417	606426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008710	AATGA	2	10	652690	652699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008710	TATAA	2	10	658221	658230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008710	TTTTA	2	10	661407	661416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008710	CTATA	2	10	665896	665905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008710	GTTAA	2	10	678836	678845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008710	AAAAT	2	10	679072	679081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008710	ATTTA	2	10	691981	691990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008710	GTATT	2	10	701140	701149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008710	TATTT	2	10	702059	702068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008710	AATAA	2	10	734043	734052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008710	TGATA	2	10	735225	735234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008710	TTTTA	2	10	743499	743508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008710	TATTT	2	10	755346	755355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008710	TATTG	2	10	762266	762275	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008710	TAATG	2	10	774020	774029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008710	AGTTT	2	10	790141	790150	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008710	ATATA	2	10	801290	801299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008710	TGAAT	2	10	801506	801515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008710	TTAGT	2	10	801526	801535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008710	ATATT	2	10	807053	807062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008710	TGATG	2	10	821201	821210	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008710	GTATT	2	10	831044	831053	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008710	TTAGG	2	10	831169	831178	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008710	TTGAT	2	10	858349	858358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008710	TAAAG	2	10	892492	892501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008710	TTTTA	2	10	892536	892545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008710	TTTAT	2	10	900478	900487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008710	AATTA	2	10	900503	900512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008710	TTAGA	2	10	914026	914035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.