MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia turicatae 91E135 chromosome

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008710	CAAA	2	8	62	69	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008710	ACAT	2	8	5149	5156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008710	ACAT	2	8	5161	5168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008710	ACTC	2	8	7418	7425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008710	AAAT	2	8	15757	15764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008710	AGTA	2	8	15836	15843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008710	AAAT	2	8	20001	20008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008710	TTAT	2	8	22786	22793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008710	TTAA	2	8	22825	22832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008710	TAAA	2	8	25051	25058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008710	TAAA	2	8	25116	25123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008710	AAAT	2	8	28860	28867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008710	ATCA	2	8	28938	28945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008710	TATT	2	8	28956	28963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008710	TTAC	2	8	31013	31020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008710	TAAA	2	8	39306	39313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008710	TAAA	2	8	44968	44975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008710	TACT	2	8	45995	46002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008710	TAAA	2	8	46177	46184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008710	AAGC	2	8	46372	46379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008710	TAAT	2	8	47453	47460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008710	AATT	2	8	53009	53016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008710	AATC	2	8	56691	56698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008710	TAAT	2	8	56727	56734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008710	AAAT	2	8	57503	57510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008710	AAGC	2	8	62587	62594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008710	TTTA	2	8	62618	62625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008710	CTTA	2	8	98160	98167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008710	AATT	2	8	98182	98189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008710	TTAG	2	8	101066	101073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008710	TTAA	2	8	102713	102720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008710	ATTA	2	8	108046	108053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008710	TAAA	2	8	112898	112905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008710	ATAA	2	8	114787	114794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008710	ATAA	2	8	119006	119013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008710	TATT	2	8	131655	131662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008710	AAAT	2	8	138241	138248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008710	ATTA	2	8	147617	147624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008710	AAAT	2	8	158576	158583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008710	ATAA	2	8	166273	166280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008710	TAAT	2	8	167870	167877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008710	AAAC	2	8	167884	167891	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008710	ATAA	2	8	169694	169701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008710	GATC	2	8	169970	169977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008710	ATTT	2	8	181382	181389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008710	ACTC	2	8	188373	188380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008710	ACAT	2	8	189967	189974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008710	ACAA	2	8	190001	190008	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008710	TATT	2	8	192165	192172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008710	ACTA	2	8	201150	201157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008710	ACTC	2	8	204739	204746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008710	ATTT	2	8	227770	227777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008710	AATA	2	8	235796	235803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008710	AATA	3	12	236850	236861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008710	CTAA	2	8	244002	244009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008710	CTAA	2	8	244016	244023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008710	TAAA	2	8	257704	257711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008710	TTTA	2	8	275750	275757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008710	AAAT	2	8	279064	279071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008710	TCCC	2	8	314701	314708	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_008710	ACTC	2	8	319979	319986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008710	TTTA	3	12	338266	338277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008710	AAAT	2	8	340285	340292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008710	AAAC	2	8	341975	341982	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008710	AGAT	2	8	341991	341998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008710	GTTT	2	8	341999	342006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008710	AAAT	2	8	342104	342111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008710	ACAA	2	8	348437	348444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008710	TAAA	2	8	360525	360532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008710	ATAA	2	8	370400	370407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008710	ATTT	2	8	373019	373026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008710	ATTT	2	8	388755	388762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008710	TATT	2	8	392250	392257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008710	AAAT	2	8	392343	392350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008710	TATG	2	8	396909	396916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008710	ATTT	2	8	397846	397853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008710	CTTT	2	8	412985	412992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008710	AATT	2	8	413049	413056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008710	ACTT	2	8	413132	413139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008710	TAAA	2	8	414450	414457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008710	ATTT	2	8	416271	416278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008710	AATT	2	8	421000	421007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008710	TAAT	2	8	425070	425077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008710	TATT	2	8	425105	425112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008710	CAAA	2	8	435629	435636	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008710	TTAA	2	8	436461	436468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008710	GTAT	2	8	436939	436946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008710	ACCT	2	8	437000	437007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008710	CTAC	2	8	437070	437077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008710	GTTT	2	8	437832	437839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008710	CTAA	2	8	437967	437974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008710	TAAA	2	8	439868	439875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008710	TAAA	2	8	443804	443811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008710	AATT	2	8	443979	443986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008710	TATT	2	8	444169	444176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008710	TAAA	2	8	444264	444271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008710	AGCT	2	8	444433	444440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008710	ATTC	2	8	444490	444497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008710	TTTC	2	8	444650	444657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008710	TTAT	2	8	446231	446238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008710	CTTA	2	8	446257	446264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008710	ATTA	2	8	447968	447975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008710	CAAT	2	8	448090	448097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008710	ATTA	2	8	448943	448950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008710	TATT	2	8	449011	449018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008710	TTAA	2	8	450502	450509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008710	TTAA	2	8	450524	450531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008710	TACA	2	8	457585	457592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008710	AAAT	2	8	459205	459212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008710	TTTG	2	8	466023	466030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008710	AGGA	2	8	466111	466118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008710	TATT	2	8	467271	467278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008710	TTTA	6	24	467345	467368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008710	TATT	2	8	472623	472630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008710	GATT	2	8	472664	472671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008710	TAGT	2	8	472765	472772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008710	TTTA	2	8	473195	473202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008710	GTTT	2	8	473240	473247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008710	ATCT	2	8	473451	473458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008710	TTGT	2	8	473508	473515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008710	TATT	2	8	482818	482825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008710	TGTT	2	8	483929	483936	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008710	GTAA	2	8	484176	484183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008710	TAAG	2	8	484343	484350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008710	TATT	2	8	486926	486933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008710	ATTT	2	8	487024	487031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008710	ATTT	2	8	487153	487160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008710	TATT	2	8	488750	488757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008710	TATT	2	8	495351	495358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008710	CGTT	2	8	496817	496824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008710	AGGT	2	8	505984	505991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008710	TATG	2	8	538449	538456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008710	TAAA	2	8	541752	541759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008710	TATT	2	8	544768	544775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008710	TAAT	2	8	544842	544849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008710	ATTT	2	8	551886	551893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008710	AATG	2	8	553070	553077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008710	CATT	2	8	553089	553096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008710	TTAT	2	8	556156	556163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008710	CTTG	2	8	556167	556174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008710	CTTT	2	8	556276	556283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008710	ATTG	2	8	557819	557826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008710	TTGA	2	8	557831	557838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008710	ATAA	2	8	567179	567186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008710	ATGA	2	8	567235	567242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008710	ATTC	2	8	571506	571513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008710	AATT	2	8	575000	575007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008710	ATTT	2	8	575035	575042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008710	TTTA	2	8	581703	581710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008710	AAAT	2	8	591585	591592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_008710	ATTT	2	8	595514	595521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.