MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Psychromonas ingrahamii 37 chromosome

Total Repeats: 1339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008709	ACCGGC	2	12	15280	15291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119943802
2	NC_008709	CAAGTG	2	12	18764	18775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119943806
3	NC_008709	AAATGA	2	12	22633	22644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	119943810
4	NC_008709	AAAATC	2	12	23559	23570	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	119943811
5	NC_008709	AAACAC	2	12	26066	26077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119943811
6	NC_008709	GTCAAA	2	12	30217	30228	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119943815
7	NC_008709	ACCAAA	2	12	31042	31053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119943816
8	NC_008709	ATATTA	2	12	31240	31251	50 %	50 %	0 %	0 %	119943816
9	NC_008709	ATGAAT	2	12	33768	33779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119943817
10	NC_008709	TTTAAA	2	12	34670	34681	50 %	50 %	0 %	0 %	119943817
11	NC_008709	AATACT	2	12	42105	42116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119943822
12	NC_008709	TTACTT	2	12	50367	50378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119943827
13	NC_008709	CTGTTA	2	12	64779	64790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119943837
14	NC_008709	CAGAAA	2	12	66525	66536	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119943839
15	NC_008709	CAATAA	2	12	66898	66909	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	119943839
16	NC_008709	CATTAA	2	12	72148	72159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119943843
17	NC_008709	TTTTTA	2	12	77231	77242	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	119943847
18	NC_008709	TCTGAT	2	12	78159	78170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119943849
19	NC_008709	AAGTTG	2	12	81428	81439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229358030
20	NC_008709	CAGCGC	2	12	87801	87812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119943857
21	NC_008709	GATTTA	2	12	88113	88124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119943858
22	NC_008709	GTTATA	2	12	89918	89929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119943860
23	NC_008709	TGTTTC	2	12	90237	90248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	119943860
24	NC_008709	TGGTAA	2	12	103124	103135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119943869
25	NC_008709	TTGGTG	2	12	104437	104448	0 %	50 %	50 %	0 %	119943870
26	NC_008709	TTTTTA	2	12	109456	109467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	119943875
27	NC_008709	AAAGAA	2	12	109473	109484	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119943875
28	NC_008709	ATATTT	2	12	112210	112221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119943876
29	NC_008709	AACCAC	2	12	112454	112465	50 %	0 %	0 %	50 %	119943877
30	NC_008709	TTGGTG	2	12	113992	114003	0 %	50 %	50 %	0 %	119943878
31	NC_008709	AAAGAA	2	12	114432	114443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119943878
32	NC_008709	TGGCAA	2	12	116707	116718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119943880
33	NC_008709	TTGGCC	2	12	117197	117208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119943880
34	NC_008709	TGAAGA	2	12	119930	119941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119943881
35	NC_008709	TGATAT	2	12	121422	121433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119943883
36	NC_008709	TGCGCT	2	12	125418	125429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119943886
37	NC_008709	ATCGCG	2	12	130151	130162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119943890
38	NC_008709	GAAACA	2	12	143814	143825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119943905
39	NC_008709	TTGAAG	2	12	151361	151372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119943907
40	NC_008709	ATAAAT	2	12	154281	154292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119943908
41	NC_008709	TAAAGT	2	12	160677	160688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119943914
42	NC_008709	TTTATA	2	12	163461	163472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119943915
43	NC_008709	GTGCTT	2	12	173933	173944	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119943922
44	NC_008709	CATAAT	2	12	177266	177277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119943925
45	NC_008709	AGGACA	2	12	183515	183526	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119943929
46	NC_008709	TTCGGT	2	12	184375	184386	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119943929
47	NC_008709	GAAGAC	2	12	195650	195661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119943937
48	NC_008709	GTAATT	2	12	195690	195701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119943937
49	NC_008709	GATGTG	2	12	204930	204941	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119943942
50	NC_008709	AAAAAG	2	12	210040	210051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119943946
51	NC_008709	TTAGAT	2	12	221825	221836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119943960
52	NC_008709	TATTAC	2	12	222580	222591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119943961
53	NC_008709	GCAAAA	2	12	226912	226923	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119943965
54	NC_008709	GATTAA	2	12	227563	227574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119943965
55	NC_008709	CTACTC	2	12	229645	229656	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119943967
56	NC_008709	TAAAGC	2	12	231532	231543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119943969
57	NC_008709	AAACTC	2	12	233017	233028	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119943971
58	NC_008709	TGCGCC	2	12	237672	237683	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119943974
59	NC_008709	CCGCTT	2	12	248823	248834	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119943984
60	NC_008709	GCCGTT	2	12	248966	248977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119943984
61	NC_008709	TTTTAT	2	12	249364	249375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	119943984
62	NC_008709	GAATTT	2	12	256526	256537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119943990
63	NC_008709	GGATAT	2	12	261662	261673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119943993
64	NC_008709	TTTACC	2	12	267609	267620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119943999
65	NC_008709	GGAAGG	2	12	274667	274678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119944005
66	NC_008709	CACTTC	2	12	277741	277752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119944007
67	NC_008709	AAAGCA	2	12	277769	277780	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119944007
68	NC_008709	TAAACC	2	12	286969	286980	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119944012
69	NC_008709	GTTTTG	2	12	290463	290474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119944014
70	NC_008709	GTCGTA	2	12	293920	293931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119944018
71	NC_008709	AAAGAA	2	12	303094	303105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119944020
72	NC_008709	CCCATT	2	12	304558	304569	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119944021
73	NC_008709	AACCTG	2	12	318944	318955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119944034
74	NC_008709	ACCAAG	2	12	318980	318991	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119944034
75	NC_008709	ACAGAC	2	12	320072	320083	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119944034
76	NC_008709	ATACTG	2	12	320595	320606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119944034
77	NC_008709	GTTGAT	2	12	321203	321214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119944034
78	NC_008709	TGAAAA	2	12	321658	321669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	119944034
79	NC_008709	GACAAT	2	12	324239	324250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119944034
80	NC_008709	TTAAGT	2	12	324386	324397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119944034
81	NC_008709	GGTGCA	3	18	325481	325498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119944034
82	NC_008709	CAGAAA	2	12	335929	335940	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119944043
83	NC_008709	GGCAAA	2	12	336266	336277	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119944043
84	NC_008709	ATGAAG	4	24	336523	336546	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119944043
85	NC_008709	AAAAGA	2	12	336563	336574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119944043
86	NC_008709	TGAAAA	4	24	336848	336871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	119944043
87	NC_008709	ACCAAG	2	12	336919	336930	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119944043
88	NC_008709	TAAAAA	2	12	337124	337135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	119944043
89	NC_008709	GATCGA	2	12	340064	340075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119944046
90	NC_008709	AAACAA	2	12	342366	342377	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	119944047
91	NC_008709	CTTTGG	2	12	343277	343288	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119944048
92	NC_008709	AGCAAA	2	12	343403	343414	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119944048
93	NC_008709	CATTGG	2	12	348741	348752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119944052
94	NC_008709	ATGGTG	2	12	353756	353767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119944057
95	NC_008709	CTGATG	2	12	355934	355945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119944058
96	NC_008709	AAAACC	2	12	365545	365556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119944064
97	NC_008709	TTCAAT	2	12	375343	375354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119944073
98	NC_008709	TGTGCA	2	12	375515	375526	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119944073
99	NC_008709	AAAGTG	2	12	376357	376368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119944074
100	NC_008709	ATTTTG	2	12	377471	377482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	119944074
101	NC_008709	GCGTTA	2	12	379387	379398	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119944076
102	NC_008709	TGATAT	2	12	385294	385305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119944081
103	NC_008709	TAAAAT	2	12	389833	389844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119944084
104	NC_008709	GACTGT	2	12	391419	391430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119944085
105	NC_008709	AATCCA	2	12	392210	392221	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119944085
106	NC_008709	CTCTGT	2	12	394236	394247	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119944085
107	NC_008709	GATAAA	2	12	395660	395671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	119944086
108	NC_008709	CCAGCG	2	12	396187	396198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119944087
109	NC_008709	AAGGGT	2	12	404750	404761	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119944091
110	NC_008709	GGGAAT	2	12	405645	405656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119944092
111	NC_008709	ATCTTC	2	12	410710	410721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119944095
112	NC_008709	GGTTGA	2	12	414761	414772	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119944099
113	NC_008709	TTTTAG	2	12	414959	414970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	119944099
114	NC_008709	AACAGT	2	12	415743	415754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119944100
115	NC_008709	TTTTAT	2	12	421709	421720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	119944106
116	NC_008709	TTTTAA	2	12	425994	426005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119944110
117	NC_008709	TTTGAT	2	12	426370	426381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	119944111
118	NC_008709	CTGAAT	2	12	427429	427440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119944112
119	NC_008709	AATGTT	2	12	431811	431822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119944117
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229	NC_008709	TGGAAT	2	12	771635	771646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119944362
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231	NC_008709	ACCTAA	6	36	777503	777538	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119944369
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454	NC_008709	AAGCTA	2	12	1565645	1565656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119945002
455	NC_008709	TTGCCA	2	12	1566554	1566565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119945003
456	NC_008709	TGGAGA	2	12	1567046	1567057	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119945004
457	NC_008709	GATAAA	2	12	1568796	1568807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	119945007
458	NC_008709	TTGAAG	2	12	1569463	1569474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119945009
459	NC_008709	CCATAA	2	12	1570717	1570728	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119945011
460	NC_008709	TAATGT	2	12	1572509	1572520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119945012
461	NC_008709	TTAAAT	2	12	1572907	1572918	50 %	50 %	0 %	0 %	119945013
462	NC_008709	GTATGA	2	12	1574512	1574523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119945015
463	NC_008709	TCTTTT	2	12	1576298	1576309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	119945016
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465	NC_008709	GTAAAT	2	12	1583145	1583156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119945021
466	NC_008709	ATATTA	2	12	1590096	1590107	50 %	50 %	0 %	0 %	119945030
467	NC_008709	TCAAAT	2	12	1598884	1598895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119945040
468	NC_008709	AGGTGT	2	12	1604363	1604374	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119945043
469	NC_008709	TAAAGG	2	12	1606249	1606260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119945044
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471	NC_008709	TTTGAT	2	12	1610075	1610086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	119945047
472	NC_008709	ATATTA	2	12	1613999	1614010	50 %	50 %	0 %	0 %	119945048
473	NC_008709	TCAAGC	2	12	1614164	1614175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119945048
474	NC_008709	CGTTTA	2	12	1624400	1624411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119945053
475	NC_008709	TGCCAT	2	12	1630095	1630106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119945056
476	NC_008709	TTCGGG	2	12	1631711	1631722	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119945057
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478	NC_008709	TAATAC	2	12	1645815	1645826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119945071
479	NC_008709	AGATTG	2	12	1650120	1650131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119945076
480	NC_008709	AGGTGG	2	12	1652499	1652510	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119945078
481	NC_008709	GCTATT	2	12	1655236	1655247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119945079
482	NC_008709	GCAAAA	2	12	1655401	1655412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119945079
483	NC_008709	GAAGCT	2	12	1659744	1659755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119945082
484	NC_008709	CCAATA	2	12	1671791	1671802	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119945095
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486	NC_008709	ACCGCC	2	12	1675324	1675335	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119945101
487	NC_008709	CGATGC	2	12	1676377	1676388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119945101
488	NC_008709	GCTGAA	2	12	1686440	1686451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119945109
489	NC_008709	GTTGAA	2	12	1686770	1686781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119945109
490	NC_008709	TGAAGA	2	12	1687591	1687602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119945109
491	NC_008709	GGTGAA	2	12	1688527	1688538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119945110
492	NC_008709	CGTGAT	2	12	1688550	1688561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119945110
493	NC_008709	GGTTTA	2	12	1701204	1701215	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119945120
494	NC_008709	GTTCGC	2	12	1701672	1701683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119945120
495	NC_008709	CAAATG	2	12	1703490	1703501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119945121
496	NC_008709	CAATGG	2	12	1710574	1710585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119945129
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499	NC_008709	TAAAAA	2	12	1717220	1717231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	119945134
500	NC_008709	TATTGC	2	12	1718274	1718285	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119945135

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