MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS chromosome

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008705	CGGGTC	2	12	45346	45357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008705	CGCATG	2	12	47157	47168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008705	TAGCGG	2	12	75345	75356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008705	ACGTCA	2	12	131153	131164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008705	CAGCGC	2	12	249774	249785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008705	CCGGAT	2	12	290554	290565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008705	TTTCAC	2	12	395951	395962	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008705	CGGGCG	2	12	396050	396061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008705	ACGGTG	2	12	470319	470330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008705	CCCGAG	2	12	483152	483163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008705	CCGGGC	4	24	515512	515535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008705	GTGCTT	2	12	622754	622765	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008705	CAGCCG	2	12	736931	736942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008705	TTTTGG	2	12	783792	783803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008705	TCGCGC	2	12	831757	831768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008705	CTTGAC	2	12	861035	861046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008705	GGGCCA	2	12	938581	938592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008705	GTGATC	2	12	979174	979185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008705	CGATCA	2	12	980784	980795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008705	GGCCGC	2	12	1027672	1027683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008705	GATGAC	2	12	1138003	1138014	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008705	AGCTGC	2	12	1138067	1138078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008705	TGCACG	2	12	1193582	1193593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008705	AGACCG	2	12	1193979	1193990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008705	TCGAAG	2	12	1235963	1235974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008705	AGCGTG	2	12	1249688	1249699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008705	GAAGTA	2	12	1258120	1258131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008705	GACGCC	2	12	1259042	1259053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008705	GTCGCC	2	12	1416519	1416530	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008705	TACCGC	2	12	1531708	1531719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008705	GACGCG	2	12	1551910	1551921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008705	TGACGG	2	12	1552240	1552251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008705	TCGCGT	3	18	1597509	1597526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008705	GGCGAA	2	12	1615677	1615688	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008705	GGCCCG	2	12	1663166	1663177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008705	AGGGCG	2	12	1666819	1666830	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008705	CGAAGT	2	12	1759744	1759755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008705	AAGGGC	2	12	1760407	1760418	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008705	CCGGTC	2	12	1775140	1775151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008705	CTCGCC	4	24	1775656	1775679	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008705	CTCGAT	2	12	1776046	1776057	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008705	AGATCG	2	12	1781627	1781638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008705	TCCACT	2	12	1814275	1814286	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008705	GTGCGG	2	12	1835824	1835835	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008705	ACCGCG	2	12	1965215	1965226	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008705	CCGGGT	2	12	1993653	1993664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008705	CGGTGA	2	12	2029229	2029240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008705	GGTGAT	2	12	2029257	2029268	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008705	TCCGGT	2	12	2029962	2029973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008705	GGGTTG	2	12	2029976	2029987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008705	ACGCGA	2	12	2131226	2131237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008705	TCTGGC	2	12	2194764	2194775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008705	TTCGAC	2	12	2195171	2195182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008705	CAGTGA	2	12	2201939	2201950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008705	CGGCCG	2	12	2267461	2267472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008705	GACGGC	2	12	2496535	2496546	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008705	GTGGCG	2	12	2534344	2534355	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008705	GGTGAT	2	12	2568560	2568571	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008705	CCGGAA	2	12	2742482	2742493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008705	CGCGAC	2	12	2765580	2765591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008705	TCGACA	2	12	2770356	2770367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008705	CGCCCT	2	12	2780943	2780954	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008705	GGCGCC	2	12	2792518	2792529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008705	CATCAG	2	12	2803771	2803782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008705	CGAACA	2	12	2854481	2854492	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008705	GTTTCA	2	12	2880735	2880746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008705	TCCCTC	2	12	3025017	3025028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008705	GTGGGA	2	12	3165073	3165084	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008705	ACGCTC	2	12	3212961	3212972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008705	CCCGGG	2	12	3402720	3402731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008705	GATGCC	2	12	3443297	3443308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008705	AATTTC	2	12	3472475	3472486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008705	CTCAAC	2	12	3476402	3476413	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008705	GTACCG	2	12	3631409	3631420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008705	ACGCGG	2	12	3749073	3749084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008705	CGCGGT	2	12	3815433	3815444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008705	CACCGG	2	12	3829785	3829796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008705	ACCGGA	2	12	3834257	3834268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008705	GCCGGG	2	12	3882627	3882638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008705	TGCCAC	2	12	3927483	3927494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008705	GGTCAC	2	12	3992919	3992930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008705	GAACCG	2	12	4175118	4175129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008705	GATCAT	2	12	4324590	4324601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008705	GACGCG	2	12	4356543	4356554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008705	CGGCGC	2	12	4398236	4398247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008705	GGGCCG	2	12	4432554	4432565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008705	CGTCTC	2	12	4475503	4475514	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008705	GTCAGG	2	12	4506123	4506134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008705	ACCACA	2	12	4526487	4526498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008705	ACGGGT	2	12	4608961	4608972	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008705	CACCGA	2	12	4682013	4682024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008705	ACCCGA	2	12	4796839	4796850	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008705	ACTGGC	2	12	4863965	4863976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008705	AGAACG	2	12	4880459	4880470	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008705	CGCGCC	2	12	4909014	4909025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008705	ATCGTC	2	12	4987475	4987486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008705	GTCATC	3	18	4987505	4987522	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008705	TCGTCA	2	12	4987536	4987547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008705	TCATCG	4	24	4987554	4987577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008705	TCGTCA	4	24	4987587	4987610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008705	TCATCG	4	24	4987710	4987733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008705	TCATCG	2	12	4987743	4987754	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008705	TCATCG	8	48	4987782	4987829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008705	TGCGAG	2	12	5120371	5120382	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008705	CACCGA	2	12	5120479	5120490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008705	CGGCCA	2	12	5124453	5124464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008705	GCAGCG	2	12	5158180	5158191	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008705	TGGCGG	2	12	5289378	5289389	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008705	GACGGC	2	12	5352204	5352215	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008705	GGGCGC	2	12	5386289	5386300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008705	TGCCCG	2	12	5460316	5460327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008705	TCCGCC	2	12	5539578	5539589	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008705	CGGTGG	2	12	5568289	5568300	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008705	CCTCGT	2	12	5569285	5569296	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008705	GGCCAG	2	12	5569601	5569612	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008705	CACGAC	4	24	5582084	5582107	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008705	AAGGAG	2	12	5619213	5619224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008705	CGACGG	2	12	5639441	5639452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008705	GGAGAG	2	12	5700422	5700433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008705	CCCGCC	2	12	5729138	5729149	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.