MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS chromosome

Total Repeats: 1105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008705	TTCG	2	8	5886	5893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008705	TCAC	2	8	7533	7540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008705	CCGC	2	8	7637	7644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008705	GTCC	2	8	7647	7654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008705	CGAT	2	8	7834	7841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008705	GATA	2	8	11966	11973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008705	GAAT	2	8	20837	20844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008705	TCGT	2	8	32346	32353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008705	AGCG	2	8	32654	32661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008705	CGCT	2	8	32817	32824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008705	CAGC	2	8	39298	39305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008705	TTCG	2	8	39358	39365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008705	TGGT	2	8	39454	39461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008705	CTCG	2	8	39627	39634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008705	GGCA	2	8	43419	43426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008705	TACC	2	8	44217	44224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008705	ATCC	2	8	45531	45538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008705	TCCG	2	8	45644	45651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008705	CCGC	2	8	52260	52267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_008705	GCTG	2	8	54389	54396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008705	CGGT	2	8	56425	56432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008705	ACGA	2	8	56594	56601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008705	CGGG	2	8	79463	79470	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008705	GCGG	2	8	79520	79527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008705	CGGT	2	8	79694	79701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008705	GACG	2	8	79731	79738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008705	GGTA	2	8	88935	88942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008705	CCAC	2	8	89335	89342	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_008705	GCCG	2	8	91417	91424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008705	CGGC	2	8	96739	96746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008705	TCGG	2	8	102001	102008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008705	GAAT	2	8	105551	105558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008705	GGGC	2	8	111981	111988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008705	GGTT	2	8	111994	112001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008705	AGGA	2	8	112022	112029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008705	GCCG	2	8	115986	115993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008705	CGGC	2	8	120359	120366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008705	TCCT	2	8	125275	125282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008705	GACC	2	8	130104	130111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008705	CTGA	2	8	134471	134478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008705	CCGG	2	8	152636	152643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008705	CCCG	2	8	152676	152683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_008705	GCCG	2	8	173773	173780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008705	CGGC	2	8	174865	174872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008705	AGGC	2	8	182824	182831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008705	TCCG	2	8	187201	187208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008705	GCGG	2	8	190174	190181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008705	ACGC	2	8	194055	194062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008705	CTTC	2	8	220983	220990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008705	CGCA	2	8	228156	228163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008705	CGGT	2	8	234645	234652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008705	GAGG	2	8	238723	238730	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008705	TCGC	2	8	244324	244331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008705	GCCC	2	8	244544	244551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008705	CGAC	2	8	246925	246932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008705	GAGG	2	8	254826	254833	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008705	CCAC	2	8	260578	260585	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008705	GATT	2	8	268268	268275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008705	CGGG	2	8	272204	272211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008705	CGCC	2	8	275945	275952	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_008705	CGTG	2	8	302256	302263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008705	GCGG	2	8	303168	303175	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008705	GACC	2	8	304927	304934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008705	GACG	2	8	318736	318743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008705	TTCA	2	8	345464	345471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008705	CGTC	2	8	345508	345515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008705	GTCA	2	8	350259	350266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008705	GGAC	2	8	365752	365759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008705	CCGG	2	8	372894	372901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008705	TCGC	2	8	374224	374231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008705	GATC	3	12	376073	376084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008705	GATC	3	12	376775	376786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008705	AGGC	2	8	385779	385786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008705	CAGC	2	8	407828	407835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008705	TTGG	2	8	416799	416806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008705	ACAG	2	8	428729	428736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008705	CGGG	2	8	429405	429412	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008705	GGGC	2	8	437421	437428	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008705	CCGA	2	8	438650	438657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008705	GCAG	2	8	445602	445609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008705	TGGG	2	8	449258	449265	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008705	CGTT	2	8	454788	454795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008705	AAGA	2	8	462349	462356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008705	GGGT	2	8	467278	467285	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008705	GTCA	2	8	467976	467983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008705	CGCA	2	8	468019	468026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008705	TCGC	2	8	471939	471946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008705	GTCG	2	8	472747	472754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008705	GCGT	2	8	474535	474542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008705	TCCT	2	8	479654	479661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008705	GTCG	2	8	479666	479673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008705	CCGA	2	8	483082	483089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008705	GCCC	2	8	483104	483111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_008705	GGCT	2	8	484124	484131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008705	ACGA	2	8	485626	485633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008705	GGCC	2	8	485641	485648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008705	GTGC	2	8	497551	497558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008705	GACT	2	8	505377	505384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008705	CACT	2	8	505968	505975	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008705	GGCG	2	8	512806	512813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008705	CCGA	2	8	512814	512821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008705	AGCG	2	8	526706	526713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008705	CCGC	2	8	527131	527138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_008705	GGTC	2	8	537416	537423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008705	CGGG	2	8	552107	552114	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008705	GGCG	2	8	587284	587291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008705	GTAA	2	8	601298	601305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008705	GTGC	2	8	601332	601339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008705	TAGT	2	8	601352	601359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008705	AGGG	2	8	611535	611542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008705	TCGC	2	8	616174	616181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008705	TCGG	2	8	616251	616258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008705	GGGC	2	8	622616	622623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008705	TCCG	2	8	624268	624275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008705	CCGA	2	8	632592	632599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008705	CGGA	2	8	646744	646751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008705	TTCA	2	8	655862	655869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008705	CGTG	2	8	662264	662271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008705	GGGC	2	8	671779	671786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008705	CGTG	2	8	671804	671811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008705	CGCT	2	8	675844	675851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008705	CCGT	2	8	676581	676588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008705	CGAC	2	8	676604	676611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008705	GGCG	2	8	678367	678374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008705	GCCG	2	8	685982	685989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008705	CATT	2	8	695171	695178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008705	GCTA	2	8	713301	713308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008705	CCCG	2	8	730365	730372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_008705	GTAG	2	8	736786	736793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008705	GCCG	2	8	736907	736914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008705	ACGC	2	8	749944	749951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008705	GTCC	2	8	761897	761904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008705	ACTG	2	8	764612	764619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008705	ATTG	2	8	780103	780110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008705	GCGG	2	8	793713	793720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008705	CCCG	2	8	800537	800544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_008705	GGAG	2	8	805884	805891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008705	TTCC	2	8	808262	808269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008705	CGGT	2	8	840038	840045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008705	CAAA	2	8	841503	841510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008705	GTCC	2	8	857133	857140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008705	CCAG	2	8	858772	858779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008705	GAAA	2	8	860136	860143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008705	CTGA	2	8	872847	872854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008705	CGTG	2	8	873289	873296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008705	AGGC	2	8	891704	891711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008705	GTCA	2	8	897383	897390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008705	ATGG	2	8	897391	897398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008705	GTCT	2	8	913626	913633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008705	CCCA	2	8	916333	916340	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_008705	CCGT	2	8	916387	916394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_008705	TGAA	2	8	2267795	2267802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_008705	GGCC	2	8	2428027	2428034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_008705	GCAC	2	8	2431812	2431819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
467	NC_008705	CAGC	2	8	2431891	2431898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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469	NC_008705	TACG	2	8	2455310	2455317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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474	NC_008705	TCCG	2	8	2525554	2525561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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482	NC_008705	GCGG	2	8	2568931	2568938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
483	NC_008705	CAGC	2	8	2568988	2568995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_008705	CTGA	2	8	2569329	2569336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_008705	GTGG	2	8	2569340	2569347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_008705	TGCG	2	8	2646235	2646242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_008705	CGGC	2	8	2675160	2675167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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