MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	CCCAG	2	10	2511	2520	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008704	ACCCC	2	10	12221	12230	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_008704	GTGGG	2	10	12720	12729	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008704	TCACA	2	10	17930	17939	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008704	CCCGC	2	10	18001	18010	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_008704	CACCC	2	10	18030	18039	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_008704	GGGTG	2	10	18902	18911	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008704	CGCTG	2	10	23966	23975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008704	CATCG	2	10	33857	33866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008704	CGCAC	2	10	34052	34061	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008704	AGCCC	2	10	82840	82849	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008704	CGCGC	2	10	100332	100341	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008704	ACCCC	2	10	101859	101868	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_008704	GCACG	2	10	130446	130455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008704	CTCAC	2	10	163098	163107	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008704	CCGCG	2	10	174350	174359	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_008704	GCTCT	2	10	176729	176738	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008704	CGGCG	2	10	176844	176853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008704	CGCGA	2	10	180734	180743	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008704	CGCTG	2	10	210667	210676	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008704	GGGGT	2	10	215303	215312	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.