MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	CGGG	2	8	32	39	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008704	GCCC	2	8	43	50	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008704	GCCC	2	8	614	621	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008704	CACC	2	8	2501	2508	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_008704	GGCC	2	8	3540	3547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008704	ACCC	2	8	3578	3585	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008704	GTGG	2	8	4136	4143	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008704	CTGC	2	8	4205	4212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008704	CGAG	2	8	4509	4516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008704	CTCG	2	8	9888	9895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008704	CAAC	2	8	10060	10067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008704	ACCG	2	8	10976	10983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008704	CCCA	2	8	11099	11106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008704	CCCG	2	8	12284	12291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_008704	GCCC	2	8	12596	12603	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_008704	CCCT	2	8	12666	12673	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_008704	CACC	2	8	17952	17959	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_008704	CAGG	2	8	18921	18928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008704	GGAG	2	8	23140	23147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008704	GCCG	2	8	23940	23947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008704	CCGT	2	8	25371	25378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008704	GCGG	2	8	34149	34156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008704	GAGC	2	8	34176	34183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008704	GACA	2	8	34938	34945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008704	AGTC	2	8	39111	39118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008704	TGGC	2	8	40662	40669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008704	GTCA	2	8	44950	44957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008704	CGAT	2	8	50727	50734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008704	GACG	2	8	51074	51081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008704	CTTT	2	8	52704	52711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008704	GTGC	2	8	53736	53743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008704	GCCC	2	8	76338	76345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008704	CCGG	2	8	83094	83101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008704	CGAC	2	8	84860	84867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008704	GTCG	2	8	84891	84898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008704	GACC	2	8	89243	89250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008704	CGGT	2	8	89351	89358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008704	ATGC	2	8	101595	101602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008704	GCCT	2	8	102007	102014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008704	GTCG	2	8	103433	103440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008704	ACCC	2	8	107477	107484	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008704	TGCG	2	8	116096	116103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008704	CCTC	2	8	120060	120067	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_008704	AGCG	2	8	130509	130516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008704	GCCG	2	8	130719	130726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008704	CGGC	2	8	133474	133481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008704	CCGC	2	8	150028	150035	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008704	TTCC	2	8	152896	152903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008704	TGGC	2	8	160836	160843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008704	CGTA	2	8	170868	170875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008704	CATA	2	8	170891	170898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008704	CGGT	2	8	171186	171193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008704	AGGA	2	8	171283	171290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008704	TGCG	2	8	174388	174395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008704	CGGA	2	8	174546	174553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008704	GACT	2	8	180707	180714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008704	TACC	2	8	181245	181252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008704	CCGG	2	8	187962	187969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008704	CAGC	2	8	188176	188183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008704	ACGG	2	8	188214	188221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008704	AAGG	2	8	190729	190736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008704	GCTG	2	8	195367	195374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008704	CGCT	2	8	197152	197159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008704	TCCG	2	8	197211	197218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008704	CTTT	2	8	197386	197393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008704	CCCG	2	8	202128	202135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_008704	TTCG	2	8	202146	202153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008704	AACG	2	8	202178	202185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008704	TGAT	2	8	206658	206665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008704	CGGG	2	8	216711	216718	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008704	GCCC	2	8	216722	216729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.