MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	TGC	2	6	100	105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008704	TGC	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008704	TGC	2	6	287	292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008704	CAT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008704	CCG	2	6	2449	2454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008704	ACC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008704	GTG	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008704	GCC	2	6	2540	2545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008704	CCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008704	CGG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008704	CTC	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008704	CCG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008704	CGA	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008704	CGA	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008704	CGA	2	6	4173	4178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008704	CGC	2	6	4188	4193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008704	CTA	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008704	GCA	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008704	CCA	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008704	CGG	2	6	4458	4463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008704	GCG	3	9	5028	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008704	ACC	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008704	ACA	2	6	9917	9922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008704	GCC	2	6	9933	9938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008704	ACC	2	6	9962	9967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008704	AAC	2	6	9983	9988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008704	GTC	2	6	10038	10043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008704	CAC	2	6	10157	10162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008704	ACC	3	9	10165	10173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008704	ACC	2	6	10964	10969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008704	ACA	2	6	10990	10995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008704	GCC	2	6	11008	11013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008704	ACC	3	9	11031	11039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008704	GCG	2	6	11066	11071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008704	ACC	2	6	12156	12161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008704	GTA	2	6	12247	12252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008704	GTC	2	6	12336	12341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008704	CCG	2	6	12380	12385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008704	CCG	2	6	12402	12407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008704	CGT	2	6	12449	12454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008704	ATG	2	6	12571	12576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008704	ACC	2	6	12620	12625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008704	ACC	2	6	12639	12644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008704	ACA	2	6	12646	12651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008704	CGA	4	12	12652	12663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008704	CAC	2	6	12707	12712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008704	TCG	3	9	14105	14113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008704	GCG	3	9	14114	14122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008704	GCG	2	6	14146	14151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008704	TGC	2	6	14166	14171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008704	CCG	2	6	14191	14196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008704	CCG	2	6	14214	14219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008704	GCG	2	6	14250	14255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008704	CAC	2	6	14367	14372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008704	GAG	2	6	17897	17902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008704	GCC	2	6	17983	17988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008704	CCA	2	6	17993	17998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008704	CGC	2	6	18024	18029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008704	GGT	2	6	18057	18062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008704	GTG	3	9	18909	18917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008704	CAC	2	6	18946	18951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008704	ACA	2	6	19890	19895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008704	GTG	2	6	19928	19933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008704	CGG	2	6	19951	19956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008704	TGG	2	6	23100	23105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008704	GCC	2	6	23179	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008704	AAC	2	6	23236	23241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008704	CGA	2	6	25310	25315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008704	CCA	2	6	25343	25348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008704	CAC	2	6	25349	25354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008704	GCT	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008704	GTG	2	6	25446	25451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008704	GAG	2	6	25542	25547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008704	GCA	2	6	26816	26821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008704	GCC	2	6	26860	26865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008704	GCC	2	6	26869	26874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008704	GCG	2	6	26939	26944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008704	TCA	2	6	33742	33747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008704	TGC	2	6	33993	33998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008704	GGT	2	6	34014	34019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008704	CTG	2	6	34120	34125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008704	CCT	2	6	34487	34492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008704	TGA	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008704	TGG	2	6	34732	34737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008704	TGA	2	6	34797	34802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008704	GGC	2	6	34832	34837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008704	CGG	2	6	34841	34846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008704	CGG	2	6	34866	34871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008704	CAA	2	6	34951	34956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008704	GTG	2	6	35016	35021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008704	TCG	2	6	36191	36196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008704	TCA	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008704	CAC	2	6	39097	39102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008704	ATC	2	6	40583	40588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008704	TCG	2	6	40755	40760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008704	CGA	2	6	40799	40804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008704	CGC	2	6	40834	40839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008704	GCT	2	6	44919	44924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008704	GCA	2	6	44927	44932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008704	ACG	2	6	44975	44980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008704	TCA	2	6	45054	45059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008704	CGC	3	9	45101	45109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008704	GTC	2	6	48357	48362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008704	GAG	2	6	49627	49632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008704	CCG	2	6	50672	50677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008704	CGG	2	6	50688	50693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008704	CGA	2	6	50739	50744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008704	GAC	2	6	50772	50777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008704	GGC	2	6	50811	50816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008704	CGA	2	6	50832	50837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008704	GAT	2	6	50989	50994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008704	CCA	2	6	51011	51016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008704	CCG	2	6	51059	51064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008704	TAA	2	6	51103	51108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008704	CGT	2	6	51155	51160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008704	GGT	2	6	52698	52703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008704	CAG	2	6	53671	53676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008704	CCT	2	6	54215	54220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008704	GTC	2	6	54226	54231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008704	CAC	2	6	56334	56339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008704	CGA	2	6	56456	56461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008704	CCA	2	6	56474	56479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008704	CCT	2	6	56728	56733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008704	TGG	2	6	60707	60712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008704	GGC	2	6	60713	60718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008704	CGG	2	6	61845	61850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008704	GCC	2	6	61855	61860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008704	ATG	2	6	61864	61869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008704	GAT	2	6	63855	63860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008704	TAT	2	6	63875	63880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008704	CGG	2	6	63898	63903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008704	GAT	2	6	64007	64012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008704	TTC	2	6	65462	65467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008704	CCA	2	6	65489	65494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008704	GTG	2	6	65815	65820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008704	GAG	2	6	65911	65916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008704	GCA	2	6	67185	67190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008704	GGT	2	6	69339	69344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008704	CAC	2	6	71733	71738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008704	CCG	2	6	71771	71776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008704	CAC	2	6	71844	71849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.