MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	CG	3	6	329	334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008704	GC	3	6	402	407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008704	CG	3	6	411	416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008704	CG	3	6	498	503	0 %	0 %	50 %	50 %	119855175
5	NC_008704	CG	3	6	830	835	0 %	0 %	50 %	50 %	119855176
6	NC_008704	GC	3	6	1291	1296	0 %	0 %	50 %	50 %	119855177
7	NC_008704	GC	3	6	1470	1475	0 %	0 %	50 %	50 %	119855177
8	NC_008704	GC	3	6	2655	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008704	CG	3	6	2661	2666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008704	CG	3	6	2772	2777	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
11	NC_008704	GC	4	8	3107	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
12	NC_008704	GC	4	8	3446	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
13	NC_008704	CG	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	119855181
14	NC_008704	GT	3	6	4905	4910	0 %	50 %	50 %	0 %	119855182
15	NC_008704	CG	3	6	5025	5030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008704	GC	3	6	5242	5247	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
17	NC_008704	CG	4	8	6167	6174	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
18	NC_008704	GC	3	6	6732	6737	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
19	NC_008704	CA	3	6	6766	6771	50 %	0 %	0 %	50 %	119855183
20	NC_008704	CG	3	6	7017	7022	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
21	NC_008704	GC	3	6	7218	7223	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
22	NC_008704	CG	3	6	8828	8833	0 %	0 %	50 %	50 %	119855184
23	NC_008704	CG	3	6	8960	8965	0 %	0 %	50 %	50 %	119855184
24	NC_008704	GA	3	6	9426	9431	50 %	0 %	50 %	0 %	119855184
25	NC_008704	CG	3	6	9764	9769	0 %	0 %	50 %	50 %	119855184
26	NC_008704	CA	3	6	10005	10010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008704	GC	3	6	10313	10318	0 %	0 %	50 %	50 %	119855185
28	NC_008704	CG	3	6	10439	10444	0 %	0 %	50 %	50 %	119855185
29	NC_008704	CA	3	6	10820	10825	50 %	0 %	0 %	50 %	119855185
30	NC_008704	AC	3	6	11253	11258	50 %	0 %	0 %	50 %	119855186
31	NC_008704	CG	3	6	11584	11589	0 %	0 %	50 %	50 %	119855186
32	NC_008704	GC	3	6	11811	11816	0 %	0 %	50 %	50 %	119855186
33	NC_008704	CA	3	6	11970	11975	50 %	0 %	0 %	50 %	119855186
34	NC_008704	GC	3	6	12878	12883	0 %	0 %	50 %	50 %	119855187
35	NC_008704	GC	3	6	13203	13208	0 %	0 %	50 %	50 %	119855187
36	NC_008704	GC	3	6	13617	13622	0 %	0 %	50 %	50 %	119855187
37	NC_008704	GC	3	6	14331	14336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008704	GC	3	6	14468	14473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008704	GC	3	6	14995	15000	0 %	0 %	50 %	50 %	119855188
40	NC_008704	GC	3	6	16011	16016	0 %	0 %	50 %	50 %	119855189
41	NC_008704	GC	3	6	16109	16114	0 %	0 %	50 %	50 %	119855189
42	NC_008704	GC	3	6	16721	16726	0 %	0 %	50 %	50 %	119855189
43	NC_008704	GC	3	6	16828	16833	0 %	0 %	50 %	50 %	119855190
44	NC_008704	GC	3	6	16905	16910	0 %	0 %	50 %	50 %	119855190
45	NC_008704	CG	3	6	17349	17354	0 %	0 %	50 %	50 %	119855190
46	NC_008704	CG	3	6	19444	19449	0 %	0 %	50 %	50 %	119855193
47	NC_008704	GC	3	6	19545	19550	0 %	0 %	50 %	50 %	119855193
48	NC_008704	CG	3	6	20070	20075	0 %	0 %	50 %	50 %	119855194
49	NC_008704	CG	3	6	20552	20557	0 %	0 %	50 %	50 %	119855194
50	NC_008704	CG	4	8	21180	21187	0 %	0 %	50 %	50 %	119855195
51	NC_008704	CG	3	6	22628	22633	0 %	0 %	50 %	50 %	119855197
52	NC_008704	TG	3	6	23210	23215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008704	TG	4	8	23457	23464	0 %	50 %	50 %	0 %	119855198
54	NC_008704	GC	3	6	23731	23736	0 %	0 %	50 %	50 %	119855198
55	NC_008704	CG	3	6	23805	23810	0 %	0 %	50 %	50 %	119855198
56	NC_008704	CA	3	6	23997	24002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008704	GC	3	6	24275	24280	0 %	0 %	50 %	50 %	119855199
58	NC_008704	GC	3	6	25323	25328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008704	GC	3	6	27168	27173	0 %	0 %	50 %	50 %	119855202
60	NC_008704	CT	3	6	27681	27686	0 %	50 %	0 %	50 %	119855203
61	NC_008704	CG	3	6	28125	28130	0 %	0 %	50 %	50 %	119855204
62	NC_008704	GC	3	6	28206	28211	0 %	0 %	50 %	50 %	119855204
63	NC_008704	CA	3	6	28564	28569	50 %	0 %	0 %	50 %	119855204
64	NC_008704	CG	3	6	29850	29855	0 %	0 %	50 %	50 %	119855206
65	NC_008704	CG	3	6	31151	31156	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
66	NC_008704	GT	3	6	31630	31635	0 %	50 %	50 %	0 %	119855207
67	NC_008704	CG	3	6	32497	32502	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
68	NC_008704	AC	3	6	32632	32637	50 %	0 %	0 %	50 %	119855207
69	NC_008704	AC	3	6	32684	32689	50 %	0 %	0 %	50 %	119855207
70	NC_008704	GC	3	6	32777	32782	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
71	NC_008704	CG	3	6	32857	32862	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
72	NC_008704	CG	3	6	33731	33736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008704	CA	3	6	33823	33828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008704	CG	3	6	33869	33874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008704	GT	3	6	34454	34459	0 %	50 %	50 %	0 %	119855209
76	NC_008704	CT	3	6	34848	34853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008704	CA	3	6	35877	35882	50 %	0 %	0 %	50 %	119855210
78	NC_008704	GT	3	6	36265	36270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008704	AC	3	6	39081	39086	50 %	0 %	0 %	50 %	119855215
80	NC_008704	CG	3	6	39903	39908	0 %	0 %	50 %	50 %	119855216
81	NC_008704	GC	3	6	40185	40190	0 %	0 %	50 %	50 %	119855216
82	NC_008704	GC	3	6	40541	40546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008704	GT	3	6	42080	42085	0 %	50 %	50 %	0 %	119855219
84	NC_008704	GC	3	6	44332	44337	0 %	0 %	50 %	50 %	119855221
85	NC_008704	GT	4	8	45075	45082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008704	GC	3	6	45098	45103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008704	CG	3	6	46017	46022	0 %	0 %	50 %	50 %	119855223
88	NC_008704	GC	3	6	46071	46076	0 %	0 %	50 %	50 %	119855223
89	NC_008704	GC	3	6	47251	47256	0 %	0 %	50 %	50 %	119855224
90	NC_008704	CA	3	6	48384	48389	50 %	0 %	0 %	50 %	119855226
91	NC_008704	TG	3	6	48585	48590	0 %	50 %	50 %	0 %	119855226
92	NC_008704	AC	3	6	48776	48781	50 %	0 %	0 %	50 %	119855226
93	NC_008704	CG	3	6	49093	49098	0 %	0 %	50 %	50 %	119855226
94	NC_008704	GA	3	6	49317	49322	50 %	0 %	50 %	0 %	119855226
95	NC_008704	CG	3	6	49438	49443	0 %	0 %	50 %	50 %	119855226
96	NC_008704	GC	3	6	49531	49536	0 %	0 %	50 %	50 %	119855226
97	NC_008704	TC	3	6	49594	49599	0 %	50 %	0 %	50 %	119855226
98	NC_008704	CG	3	6	49985	49990	0 %	0 %	50 %	50 %	119855227
99	NC_008704	CG	3	6	50338	50343	0 %	0 %	50 %	50 %	119855227
100	NC_008704	GC	3	6	51281	51286	0 %	0 %	50 %	50 %	119855228
101	NC_008704	CG	3	6	51728	51733	0 %	0 %	50 %	50 %	119855228
102	NC_008704	AG	3	6	51954	51959	50 %	0 %	50 %	0 %	119855228
103	NC_008704	CG	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	119855230
104	NC_008704	GC	3	6	53876	53881	0 %	0 %	50 %	50 %	119855231
105	NC_008704	AG	3	6	53922	53927	50 %	0 %	50 %	0 %	119855231
106	NC_008704	GC	3	6	54088	54093	0 %	0 %	50 %	50 %	119855231
107	NC_008704	CT	3	6	54875	54880	0 %	50 %	0 %	50 %	119855233
108	NC_008704	AC	3	6	55980	55985	50 %	0 %	0 %	50 %	119855233
109	NC_008704	GT	3	6	57459	57464	0 %	50 %	50 %	0 %	119855235
110	NC_008704	GC	3	6	58006	58011	0 %	0 %	50 %	50 %	119855236
111	NC_008704	CG	4	8	58628	58635	0 %	0 %	50 %	50 %	119855237
112	NC_008704	CG	3	6	59136	59141	0 %	0 %	50 %	50 %	119855237
113	NC_008704	AG	3	6	60078	60083	50 %	0 %	50 %	0 %	119855238
114	NC_008704	CG	3	6	61156	61161	0 %	0 %	50 %	50 %	119855239
115	NC_008704	GC	3	6	61773	61778	0 %	0 %	50 %	50 %	119855239
116	NC_008704	CG	3	6	62028	62033	0 %	0 %	50 %	50 %	119855240
117	NC_008704	CG	4	8	62264	62271	0 %	0 %	50 %	50 %	119855240
118	NC_008704	CG	3	6	62378	62383	0 %	0 %	50 %	50 %	119855240
119	NC_008704	AC	4	8	63283	63290	50 %	0 %	0 %	50 %	119855241
120	NC_008704	GC	3	6	63330	63335	0 %	0 %	50 %	50 %	119855241
121	NC_008704	CG	3	6	63537	63542	0 %	0 %	50 %	50 %	119855241
122	NC_008704	GA	3	6	63680	63685	50 %	0 %	50 %	0 %	119855241
123	NC_008704	CG	3	6	63715	63720	0 %	0 %	50 %	50 %	119855241
124	NC_008704	GC	3	6	64049	64054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008704	GC	3	6	64405	64410	0 %	0 %	50 %	50 %	119855242
126	NC_008704	GC	3	6	64686	64691	0 %	0 %	50 %	50 %	119855242
127	NC_008704	CG	3	6	67422	67427	0 %	0 %	50 %	50 %	119855245
128	NC_008704	GC	4	8	67524	67531	0 %	0 %	50 %	50 %	119855246
129	NC_008704	GC	3	6	68364	68369	0 %	0 %	50 %	50 %	119855246
130	NC_008704	CG	5	10	68487	68496	0 %	0 %	50 %	50 %	119855246
131	NC_008704	TG	3	6	68913	68918	0 %	50 %	50 %	0 %	119855247
132	NC_008704	GC	3	6	69067	69072	0 %	0 %	50 %	50 %	119855248
133	NC_008704	CG	3	6	69424	69429	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
134	NC_008704	CG	3	6	69747	69752	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
135	NC_008704	GC	3	6	69875	69880	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
136	NC_008704	GC	3	6	70005	70010	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
137	NC_008704	CG	3	6	70277	70282	0 %	0 %	50 %	50 %	119855250
138	NC_008704	GC	3	6	70494	70499	0 %	0 %	50 %	50 %	119855250
139	NC_008704	CG	3	6	71275	71280	0 %	0 %	50 %	50 %	119855251
140	NC_008704	AC	3	6	71585	71590	50 %	0 %	0 %	50 %	119855251
141	NC_008704	CG	3	6	72283	72288	0 %	0 %	50 %	50 %	119855252
142	NC_008704	CG	3	6	72411	72416	0 %	0 %	50 %	50 %	119855252
143	NC_008704	GC	3	6	72433	72438	0 %	0 %	50 %	50 %	119855252
144	NC_008704	CA	3	6	72497	72502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008704	CA	3	6	72586	72591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.