MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS01

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008703	CCCGAG	2	12	1078	1089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854892
2	NC_008703	CCTGAG	2	12	1090	1101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119854892
3	NC_008703	CAGCCG	2	12	1405	1416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854892
4	NC_008703	ACGGCG	2	12	2307	2318	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119854893
5	NC_008703	GCGCCG	2	12	2802	2813	0 %	0 %	50 %	50 %	119854893
6	NC_008703	CATCCT	2	12	3515	3526	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119854895
7	NC_008703	CCGACG	2	12	4397	4408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854896
8	NC_008703	CCGACG	2	12	5498	5509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854896
9	NC_008703	CCGCAC	2	12	10213	10224	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854899
10	NC_008703	CGGGCA	2	12	11314	11325	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119854900
11	NC_008703	GCCGCT	2	12	11540	11551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119854900
12	NC_008703	CCGCAC	2	12	13718	13729	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854901
13	NC_008703	GGGGGC	2	12	14880	14891	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	119854902
14	NC_008703	CGCATG	2	12	16846	16857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119854904
15	NC_008703	GGCGTT	2	12	17002	17013	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119854904
16	NC_008703	GGCGGG	2	12	17799	17810	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	119854905
17	NC_008703	GCTGGG	2	12	17875	17886	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119854905
18	NC_008703	CGAGCA	2	12	20050	20061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119854906
19	NC_008703	TCCAGA	2	12	20568	20579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119854906
20	NC_008703	CCGCAC	2	12	23256	23267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854908
21	NC_008703	CGACGG	2	12	25257	25268	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119854910
22	NC_008703	CGGGGG	2	12	25269	25280	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	119854910
23	NC_008703	CCGCAC	2	12	29268	29279	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854915
24	NC_008703	GGTCGG	2	12	31819	31830	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119854918
25	NC_008703	CCGCAC	2	12	33387	33398	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854921
26	NC_008703	GGCCAG	2	12	34290	34301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119854922
27	NC_008703	GGTGCG	2	12	36719	36730	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119854925
28	NC_008703	GACGGC	3	18	39472	39489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119854927
29	NC_008703	ATGGTG	2	12	43796	43807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119854931
30	NC_008703	CGTCGA	2	12	44504	44515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119854932
31	NC_008703	CCGCAC	2	12	45963	45974	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854933
32	NC_008703	CGTTCC	2	12	49022	49033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119854936
33	NC_008703	TACCGA	2	12	53142	53153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119854939
34	NC_008703	CACTGA	2	12	57271	57282	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119854942
35	NC_008703	CACCGA	2	12	59488	59499	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008703	TGATGG	2	12	67189	67200	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119854951
37	NC_008703	GCCGCG	2	12	68452	68463	0 %	0 %	50 %	50 %	119854952
38	NC_008703	GGGTTC	2	12	71080	71091	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008703	CCGGCG	2	12	71231	71242	0 %	0 %	50 %	50 %	119854956
40	NC_008703	ACTGGG	2	12	71620	71631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119854957
41	NC_008703	CACACT	2	12	73015	73026	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008703	GATCCC	2	12	73422	73433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119854959
43	NC_008703	ATCACC	2	12	74079	74090	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119854959
44	NC_008703	GCCGAC	2	12	75038	75049	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854960
45	NC_008703	CGCCGA	2	12	75463	75474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854961
46	NC_008703	GTGGCC	2	12	79576	79587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119854966
47	NC_008703	CCACCG	2	12	81287	81298	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119854967
48	NC_008703	TGATCG	2	12	82114	82125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119854968
49	NC_008703	GCTGGA	2	12	88509	88520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119854972
50	NC_008703	GTCGGC	2	12	90488	90499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119854974
51	NC_008703	GGCGCG	2	12	92258	92269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119854975
52	NC_008703	GCCGCG	2	12	94933	94944	0 %	0 %	50 %	50 %	119854978
53	NC_008703	GACAGT	2	12	96180	96191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008703	TTGGCC	2	12	97019	97030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119854980
55	NC_008703	GGCCGC	2	12	97854	97865	0 %	0 %	50 %	50 %	119854981
56	NC_008703	TGGGTC	2	12	98053	98064	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119854982
57	NC_008703	GCACCG	2	12	103594	103605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119854985
58	NC_008703	CCCGCG	2	12	105622	105633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119854986
59	NC_008703	GCGTTG	2	12	106972	106983	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119854988
60	NC_008703	GTCGCC	2	12	114483	114494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119854997
61	NC_008703	TGCCAG	2	12	116617	116628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008703	TCGACA	2	12	118462	118473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855000
63	NC_008703	TCGTGT	2	12	120819	120830	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119855003
64	NC_008703	CACACG	2	12	124187	124198	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119855006
65	NC_008703	GGCCGC	2	12	136244	136255	0 %	0 %	50 %	50 %	119855016
66	NC_008703	CGGCGT	2	12	138924	138935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855018
67	NC_008703	CGGGGC	2	12	140923	140934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855020
68	NC_008703	CTCGCG	2	12	141332	141343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855020
69	NC_008703	CATGGC	2	12	141549	141560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855021
70	NC_008703	CGTCGC	2	12	141576	141587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855021
71	NC_008703	TGGCGA	2	12	144565	144576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855024
72	NC_008703	CTGGCC	2	12	146628	146639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855027
73	NC_008703	TCGGGG	2	12	152319	152330	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855031
74	NC_008703	GTCAGG	2	12	152893	152904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855032
75	NC_008703	TCCACT	2	12	158604	158615	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008703	ACCGAA	2	12	159762	159773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119855038
77	NC_008703	GCTTCG	2	12	163286	163297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855043
78	NC_008703	TCGACA	2	12	164702	164713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855045
79	NC_008703	TTTCGG	2	12	166345	166356	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008703	CGACGG	2	12	169133	169144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855049
81	NC_008703	ACCCCG	2	12	169333	169344	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855049
82	NC_008703	CAACGC	3	18	169475	169492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008703	CTCGCG	2	12	171256	171267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855051
84	NC_008703	GATCGC	2	12	171956	171967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855052
85	NC_008703	CGGCGC	2	12	172174	172185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008703	ACGGCT	2	12	173336	173347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855054
87	NC_008703	GCGATC	2	12	174215	174226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855055
88	NC_008703	CGGCGT	2	12	175821	175832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855056
89	NC_008703	CGTTCT	2	12	178671	178682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119855059
90	NC_008703	GGCGCC	2	12	178796	178807	0 %	0 %	50 %	50 %	119855059
91	NC_008703	ATCGCG	2	12	182069	182080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855062
92	NC_008703	GCTGCG	2	12	183097	183108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855062
93	NC_008703	GCCGTG	2	12	186786	186797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855063
94	NC_008703	TGAGCC	2	12	187441	187452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855063
95	NC_008703	ACGCCG	2	12	188088	188099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855064
96	NC_008703	TCGACG	2	12	193649	193660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855071
97	NC_008703	GCGACA	2	12	194256	194267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855071
98	NC_008703	CGAGAT	2	12	195563	195574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119855072
99	NC_008703	GGCGAA	2	12	198481	198492	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119855075
100	NC_008703	TGCCGG	2	12	200407	200418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855077
101	NC_008703	CACCCG	2	12	201063	201074	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855078
102	NC_008703	GCTACG	2	12	201945	201956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855079
103	NC_008703	CTGATC	2	12	202436	202447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119855079
104	NC_008703	GGGATG	2	12	207180	207191	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008703	CCGGTG	2	12	214421	214432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855090
106	NC_008703	AGATGG	2	12	219058	219069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119855095
107	NC_008703	GCCAAG	2	12	222960	222971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855100
108	NC_008703	GCGTCG	6	36	223147	223182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855101
109	NC_008703	GGTGCC	2	12	227473	227484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008703	GGCGAA	2	12	230353	230364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119855107
111	NC_008703	GCTGGT	2	12	232213	232224	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119855108
112	NC_008703	CACCGC	2	12	232552	232563	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855108
113	NC_008703	CGCCAG	2	12	233343	233354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855109
114	NC_008703	GATCAG	2	12	233382	233393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119855109
115	NC_008703	CGTAGC	2	12	233873	233884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855109
116	NC_008703	TCGCGG	2	12	237115	237126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855114
117	NC_008703	CGGCGA	2	12	237197	237208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855114
118	NC_008703	AGGGGC	2	12	244172	244183	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119855121
119	NC_008703	CGGTGA	2	12	245163	245174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855122
120	NC_008703	GCGGCC	2	12	247936	247947	0 %	0 %	50 %	50 %	119855125
121	NC_008703	GCTACG	2	12	249569	249580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855128
122	NC_008703	ACCGCG	2	12	249728	249739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855128
123	NC_008703	CTGATC	2	12	250060	250071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119855128
124	NC_008703	CTGCGG	2	12	250912	250923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855130
125	NC_008703	TGGAGG	2	12	251550	251561	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119855130
126	NC_008703	CCCTGG	2	12	253602	253613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855131
127	NC_008703	GATGAC	2	12	253649	253660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119855131
128	NC_008703	GGTCCT	2	12	253822	253833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855131
129	NC_008703	CGAGCG	2	12	258745	258756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855135
130	NC_008703	GTTCGC	2	12	261226	261237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855137
131	NC_008703	ATCGAC	2	12	266712	266723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855142
132	NC_008703	TGGGTC	2	12	272168	272179	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119855148
133	NC_008703	GGGCGG	2	12	272788	272799	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	119855148
134	NC_008703	CTCCGG	2	12	274507	274518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855149
135	NC_008703	CTGCGG	2	12	280428	280439	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855155
136	NC_008703	GTGGCG	2	12	280440	280451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855155
137	NC_008703	GCGGGC	2	12	280778	280789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855155
138	NC_008703	CCGCGG	2	12	282728	282739	0 %	0 %	50 %	50 %	119855157
139	NC_008703	GGGTCG	2	12	282955	282966	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855157
140	NC_008703	GGGCAT	2	12	283988	283999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855157
141	NC_008703	CGATGA	2	12	287359	287370	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119855159
142	NC_008703	CACCGA	2	12	290642	290653	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119855163
143	NC_008703	TGGCCG	3	18	294715	294732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855165
144	NC_008703	ACCGCG	2	12	295424	295435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855166
145	NC_008703	CCGCGC	2	12	295443	295454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855166
146	NC_008703	ATCGTG	2	12	295880	295891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119855166
147	NC_008703	GCTGCC	2	12	296065	296076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855166
148	NC_008703	GGGCTG	2	12	299999	300010	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855170
149	NC_008703	TCGACG	2	12	300689	300700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855170

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.