MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008703	AGCGG	2	10	21671	21680	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008703	ACACC	2	10	24770	24779	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_008703	ACACC	2	10	26102	26111	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_008703	ACACC	2	10	27264	27273	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_008703	ACCCA	2	10	30744	30753	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_008703	GCCGG	2	10	30857	30866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008703	ACCCA	2	10	31376	31385	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_008703	GGCCC	2	10	32407	32416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008703	ACCCA	2	10	34942	34951	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_008703	GGGAG	2	10	36628	36637	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008703	ACCGC	2	10	37606	37615	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008703	CAGCG	2	10	41852	41861	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008703	CGCAG	2	10	46906	46915	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008703	CAGTT	2	10	58781	58790	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008703	GTCGG	2	10	58798	58807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008703	TGGCC	2	10	59285	59294	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008703	CGCAG	2	10	62787	62796	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008703	CTTCT	2	10	71558	71567	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008703	AAACG	2	10	78089	78098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008703	CGGCC	2	10	78186	78195	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008703	ACTGC	2	10	82008	82017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008703	GCGCT	2	10	83015	83024	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008703	CGGCG	2	10	85354	85363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008703	TCGGA	2	10	89466	89475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008703	GGCCA	2	10	97717	97726	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008703	CGCGG	2	10	99370	99379	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008703	GGCGT	2	10	99545	99554	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008703	ATTGC	2	10	99636	99645	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008703	AGGTG	2	10	113402	113411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008703	AGCGC	2	10	118518	118527	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008703	GCGCC	2	10	118564	118573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008703	GTACT	2	10	119681	119690	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008703	ATCGA	2	10	125633	125642	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008703	TGGTC	2	10	132637	132646	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008703	TGGTC	2	10	137545	137554	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008703	GTCGG	2	10	148940	148949	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008703	CCCGA	2	10	153266	153275	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_008703	GTGAG	2	10	163012	163021	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008703	TCTGG	2	10	169465	169474	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008703	CGTGC	2	10	172112	172121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008703	CCCCG	2	10	173029	173038	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
42	NC_008703	GCCCA	2	10	177889	177898	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008703	GAGGC	2	10	180777	180786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008703	GCTAC	2	10	180819	180828	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008703	TCGTG	2	10	184137	184146	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008703	CAGCG	2	10	190871	190880	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008703	CGGCC	2	10	199495	199504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_008703	ACGCG	2	10	206637	206646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008703	CGTGG	2	10	219298	219307	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008703	GTGCG	2	10	224573	224582	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008703	GACAG	2	10	224980	224989	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008703	TGACC	2	10	237469	237478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008703	GGCCT	2	10	238019	238028	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008703	GGCGT	2	10	238167	238176	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008703	ATTGC	2	10	238258	238267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008703	TGAGT	2	10	240600	240609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008703	GTCGA	2	10	244410	244419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008703	TCTCG	2	10	263943	263952	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008703	GACCG	2	10	270947	270956	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.