MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. BH72 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008702	CGGAGC	2	12	11896	11907	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008702	TTTGTG	2	12	35031	35042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008702	TCGTTG	2	12	106322	106333	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008702	GCGGCC	2	12	126043	126054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008702	AGAACA	2	12	135065	135076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008702	GCGGGC	2	12	146813	146824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008702	CGCCGG	2	12	160624	160635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008702	TTCCGC	2	12	218023	218034	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008702	CGCGGC	2	12	224430	224441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008702	TCCGCG	2	12	277375	277386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008702	GGCCGC	2	12	302938	302949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008702	ATCCAG	2	12	340803	340814	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008702	TGCTTC	2	12	348782	348793	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008702	GCGGGG	2	12	367584	367595	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008702	CGGGCC	2	12	374084	374095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008702	CATCCC	2	12	403617	403628	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008702	CGGGGC	2	12	449230	449241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008702	AGGAAC	2	12	467716	467727	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008702	GCGGGG	2	12	486157	486168	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008702	TCGGCA	2	12	506464	506475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008702	CGCGGG	2	12	525197	525208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008702	GCGGTG	2	12	584601	584612	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008702	GCTGCC	2	12	597110	597121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008702	GCGCTG	2	12	799826	799837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008702	GGGGCG	2	12	862637	862648	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008702	GGCTCC	2	12	872207	872218	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008702	AGAACA	2	12	877799	877810	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008702	CCGGGC	2	12	889882	889893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008702	CAGCCG	2	12	952758	952769	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008702	GTGCGG	2	12	960268	960279	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008702	CATTGT	2	12	998598	998609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008702	GCCGGG	2	12	1020688	1020699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008702	GCTTTT	2	12	1035233	1035244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008702	GCCAAC	2	12	1092616	1092627	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008702	GTTTTT	2	12	1111673	1111684	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008702	GGGGCA	2	12	1159006	1159017	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008702	CCCCCG	2	12	1189581	1189592	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_008702	CGAGGG	2	12	1201192	1201203	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008702	GCCGCG	2	12	1214255	1214266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008702	CGGGAT	2	12	1228908	1228919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008702	GCCCCC	2	12	1238168	1238179	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_008702	GCCGGT	2	12	1246003	1246014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008702	TGCCGG	2	12	1247354	1247365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008702	GGGCAG	2	12	1252975	1252986	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008702	CGCGCC	2	12	1272115	1272126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008702	GGGACG	2	12	1293759	1293770	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008702	GCGGTC	2	12	1301207	1301218	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008702	GTGCCG	2	12	1302588	1302599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008702	GAAAAA	3	18	1307455	1307472	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008702	GCGCGG	2	12	1334304	1334315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008702	CGCGCC	2	12	1336107	1336118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008702	GGCACT	2	12	1344615	1344626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008702	CACAAC	2	12	1367282	1367293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008702	CGCGGC	2	12	1376018	1376029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008702	TCCTGT	2	12	1435471	1435482	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008702	GTTGGG	2	12	1460333	1460344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008702	GCACCG	2	12	1478781	1478792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008702	GTCGGC	2	12	1484219	1484230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008702	GAAAAA	2	12	1599002	1599013	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008702	GCGCGT	2	12	1622908	1622919	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008702	GCGCCG	2	12	1674217	1674228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008702	TCCTGC	2	12	1744912	1744923	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008702	CCCGCC	2	12	1779478	1779489	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
64	NC_008702	GTGCCG	2	12	1799322	1799333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008702	CTGCGG	2	12	1848796	1848807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008702	AAAAGG	2	12	1871849	1871860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008702	CGGCGC	2	12	1934476	1934487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008702	TTCCGG	2	12	1967624	1967635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008702	CCCCAT	2	12	2015163	2015174	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008702	GGGCGC	2	12	2025692	2025703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008702	CCCCTT	2	12	2040562	2040573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008702	CCCCAT	2	12	2040850	2040861	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008702	CGGACG	2	12	2052906	2052917	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008702	TTTTGA	2	12	2056379	2056390	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008702	CGGCGC	2	12	2106349	2106360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008702	CCCCAT	2	12	2149338	2149349	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008702	GGGATG	2	12	2150267	2150278	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008702	ATTTTA	2	12	2196945	2196956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008702	CCCCTT	2	12	2202182	2202193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008702	GGGATG	2	12	2202207	2202218	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008702	ATCAAA	2	12	2233818	2233829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008702	TTGTGC	2	12	2242049	2242060	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008702	CCCCCG	2	12	2247304	2247315	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
84	NC_008702	CCTTGC	2	12	2285284	2285295	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008702	CCGCGC	2	12	2462710	2462721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008702	CTCGCC	2	12	2487796	2487807	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008702	CCCCGC	2	12	2511030	2511041	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_008702	CGCCTG	2	12	2512969	2512980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008702	GCCGCG	2	12	2579852	2579863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008702	TTGTCC	2	12	2583186	2583197	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008702	GTCGCT	2	12	2613963	2613974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008702	CAAGAA	2	12	2629174	2629185	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008702	CCCCAC	2	12	2632016	2632027	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_008702	CCCGGA	2	12	2647623	2647634	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008702	CCCCAC	2	12	2678719	2678730	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_008702	CCCATC	2	12	2681503	2681514	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008702	GCCGCG	2	12	2708466	2708477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008702	CGATCC	2	12	2725253	2725264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008702	AGACTG	2	12	2735024	2735035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008702	GCGCCC	2	12	2775313	2775324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008702	CCGCCC	2	12	2776028	2776039	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
102	NC_008702	CCCTTC	2	12	2803719	2803730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008702	CGCCGG	2	12	2836060	2836071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008702	CCGCCC	2	12	2836715	2836726	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_008702	CCCGTG	2	12	2837625	2837636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008702	TCGCCG	2	12	2903371	2903382	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008702	GGCGCG	2	12	2938822	2938833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008702	CTGCTC	3	18	2957211	2957228	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008702	GCCGGC	2	12	3023451	3023462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008702	CGCGCC	2	12	3249924	3249935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008702	AGGGGG	2	12	3258676	3258687	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008702	CCCCAC	2	12	3273120	3273131	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_008702	CCCCAT	2	12	3274126	3274137	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008702	GGGATG	2	12	3291136	3291147	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008702	GCCGGC	2	12	3295527	3295538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008702	CCCCAT	2	12	3348474	3348485	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008702	CCATCC	2	12	3379793	3379804	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008702	GGCCGG	2	12	3422418	3422429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008702	CATGCG	2	12	3422907	3422918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008702	CGCCTG	2	12	3438470	3438481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008702	CGGAAA	2	12	3444780	3444791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008702	GGGTGA	2	12	3488107	3488118	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008702	ACCGAT	2	12	3520034	3520045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008702	ACGGCC	2	12	3559559	3559570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008702	CGGGGC	2	12	3603626	3603637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008702	CGCTGG	2	12	3622307	3622318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008702	GGACAG	2	12	3643430	3643441	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008702	TGGGCC	2	12	3645090	3645101	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008702	GCTCGT	2	12	3707251	3707262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008702	AATCAG	2	12	3760626	3760637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008702	GGCCCG	2	12	3766374	3766385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008702	GCGGGC	2	12	3775765	3775776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008702	GCCTTG	2	12	3778311	3778322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008702	GTGTGC	2	12	3843617	3843628	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_008702	CAAAAA	2	12	3843698	3843709	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_008702	GGAACC	2	12	3857440	3857451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008702	CCCTCA	2	12	3858026	3858037	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008702	CGCCTG	2	12	3873366	3873377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008702	CCGCAG	2	12	4022512	4022523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008702	CCCGAA	2	12	4031962	4031973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008702	CCCGCG	2	12	4036268	4036279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008702	GCCGGC	2	12	4048717	4048728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008702	GCCGGC	2	12	4051607	4051618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008702	CGGCAC	2	12	4058212	4058223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008702	CAACTG	2	12	4074596	4074607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008702	GACCGG	2	12	4124034	4124045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008702	CCCCGC	2	12	4142337	4142348	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
148	NC_008702	GCATCG	2	12	4144811	4144822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008702	CCCCGA	2	12	4177075	4177086	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_008702	GTCCGC	2	12	4247147	4247158	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008702	GCAAAG	2	12	4350943	4350954	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_008702	GCGCCC	2	12	4354467	4354478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.