MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 2125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008700	TTGGG	2	10	4718	4727	0 %	40 %	60 %	0 %	119773148
2	NC_008700	GGATT	2	10	6251	6260	20 %	40 %	40 %	0 %	119773149
3	NC_008700	CAACC	2	10	8820	8829	40 %	0 %	0 %	60 %	119773151
4	NC_008700	AGTGA	2	10	15500	15509	40 %	20 %	40 %	0 %	119773158
5	NC_008700	CCAGA	2	10	25900	25909	40 %	0 %	20 %	40 %	119773168
6	NC_008700	GACTC	2	10	32473	32482	20 %	20 %	20 %	40 %	119773172
7	NC_008700	ACCAA	2	10	32651	32660	60 %	0 %	0 %	40 %	119773172
8	NC_008700	TACTG	2	10	34751	34760	20 %	40 %	20 %	20 %	119773174
9	NC_008700	ACATC	2	10	34805	34814	40 %	20 %	0 %	40 %	119773174
10	NC_008700	GCCTT	2	10	35623	35632	0 %	40 %	20 %	40 %	119773174
11	NC_008700	CGGTC	2	10	39372	39381	0 %	20 %	40 %	40 %	119773177
12	NC_008700	CTCAT	2	10	41062	41071	20 %	40 %	0 %	40 %	119773179
13	NC_008700	GCCGC	2	10	46689	46698	0 %	0 %	40 %	60 %	119773184
14	NC_008700	GGCCA	2	10	47426	47435	20 %	0 %	40 %	40 %	119773185
15	NC_008700	GTGAT	2	10	48154	48163	20 %	40 %	40 %	0 %	119773186
16	NC_008700	GGTTG	2	10	49848	49857	0 %	40 %	60 %	0 %	119773187
17	NC_008700	CCAGG	2	10	50306	50315	20 %	0 %	40 %	40 %	119773188
18	NC_008700	ATTTG	2	10	61680	61689	20 %	60 %	20 %	0 %	119773198
19	NC_008700	ATACC	2	10	64207	64216	40 %	20 %	0 %	40 %	119773201
20	NC_008700	ATTTG	2	10	64309	64318	20 %	60 %	20 %	0 %	119773201
21	NC_008700	CAGTT	2	10	64368	64377	20 %	40 %	20 %	20 %	119773201
22	NC_008700	TGTCC	2	10	65196	65205	0 %	40 %	20 %	40 %	119773202
23	NC_008700	GCCTG	2	10	65318	65327	0 %	20 %	40 %	40 %	119773202
24	NC_008700	TGGCT	2	10	66974	66983	0 %	40 %	40 %	20 %	119773203
25	NC_008700	CGTAT	2	10	68368	68377	20 %	40 %	20 %	20 %	119773205
26	NC_008700	TGGTT	2	10	68721	68730	0 %	60 %	40 %	0 %	119773205
27	NC_008700	TTTGG	2	10	68845	68854	0 %	60 %	40 %	0 %	119773205
28	NC_008700	TGTGA	2	10	68869	68878	20 %	40 %	40 %	0 %	119773205
29	NC_008700	GTTTG	2	10	69697	69706	0 %	60 %	40 %	0 %	119773206
30	NC_008700	TGTGT	2	10	71770	71779	0 %	60 %	40 %	0 %	119773207
31	NC_008700	TTTGG	2	10	73642	73651	0 %	60 %	40 %	0 %	119773209
32	NC_008700	GATTG	2	10	74965	74974	20 %	40 %	40 %	0 %	119773209
33	NC_008700	GACTG	2	10	81838	81847	20 %	20 %	40 %	20 %	119773218
34	NC_008700	CATCC	2	10	86381	86390	20 %	20 %	0 %	60 %	119773220
35	NC_008700	TGATT	2	10	88719	88728	20 %	60 %	20 %	0 %	119773222
36	NC_008700	ACCTT	2	10	90050	90059	20 %	40 %	0 %	40 %	119773223
37	NC_008700	GGCAG	2	10	90593	90602	20 %	0 %	60 %	20 %	119773224
38	NC_008700	TGCAG	2	10	96131	96140	20 %	20 %	40 %	20 %	119773227
39	NC_008700	GCTGA	2	10	96363	96372	20 %	20 %	40 %	20 %	119773227
40	NC_008700	AAATC	2	10	97735	97744	60 %	20 %	0 %	20 %	119773228
41	NC_008700	GGCTC	2	10	98862	98871	0 %	20 %	40 %	40 %	119773229
42	NC_008700	GACAA	2	10	98966	98975	60 %	0 %	20 %	20 %	119773229
43	NC_008700	CAGGG	2	10	100862	100871	20 %	0 %	60 %	20 %	119773232
44	NC_008700	GCCAA	2	10	103128	103137	40 %	0 %	20 %	40 %	119773234
45	NC_008700	GCTAT	2	10	104669	104678	20 %	40 %	20 %	20 %	119773235
46	NC_008700	GCATG	2	10	110069	110078	20 %	20 %	40 %	20 %	119773239
47	NC_008700	CGGGG	2	10	114687	114696	0 %	0 %	80 %	20 %	119773243
48	NC_008700	TGAAG	2	10	116272	116281	40 %	20 %	40 %	0 %	119773245
49	NC_008700	TGGTC	2	10	116725	116734	0 %	40 %	40 %	20 %	119773245
50	NC_008700	GGTCT	2	10	120221	120230	0 %	40 %	40 %	20 %	119773249
51	NC_008700	CGTTA	2	10	127967	127976	20 %	40 %	20 %	20 %	119773256
52	NC_008700	CAGTC	2	10	132368	132377	20 %	20 %	20 %	40 %	119773260
53	NC_008700	GCAGG	2	10	133847	133856	20 %	0 %	60 %	20 %	119773262
54	NC_008700	GCTCA	2	10	142940	142949	20 %	20 %	20 %	40 %	119773269
55	NC_008700	TCCTG	2	10	143386	143395	0 %	40 %	20 %	40 %	119773270
56	NC_008700	CTGCC	2	10	143718	143727	0 %	20 %	20 %	60 %	119773270
57	NC_008700	GTAGC	2	10	154713	154722	20 %	20 %	40 %	20 %	119773279
58	NC_008700	GATTC	2	10	161218	161227	20 %	40 %	20 %	20 %	119773284
59	NC_008700	CAAAC	2	10	161607	161616	60 %	0 %	0 %	40 %	119773284
60	NC_008700	AGTGA	2	10	161770	161779	40 %	20 %	40 %	0 %	119773284
61	NC_008700	GCACA	2	10	164738	164747	40 %	0 %	20 %	40 %	119773285
62	NC_008700	GCCGC	2	10	165179	165188	0 %	0 %	40 %	60 %	119773285
63	NC_008700	TGGCA	2	10	166142	166151	20 %	20 %	40 %	20 %	119773286
64	NC_008700	TGCGC	2	10	168129	168138	0 %	20 %	40 %	40 %	119773287
65	NC_008700	TGATT	2	10	168389	168398	20 %	60 %	20 %	0 %	119773288
66	NC_008700	CGAAC	2	10	169709	169718	40 %	0 %	20 %	40 %	119773289
67	NC_008700	TGATG	2	10	170482	170491	20 %	40 %	40 %	0 %	119773290
68	NC_008700	TTGTT	2	10	171468	171477	0 %	80 %	20 %	0 %	119773291
69	NC_008700	TGGTC	2	10	176461	176470	0 %	40 %	40 %	20 %	119773293
70	NC_008700	CTGAT	2	10	177447	177456	20 %	40 %	20 %	20 %	119773293
71	NC_008700	CTGGC	2	10	179795	179804	0 %	20 %	40 %	40 %	119773295
72	NC_008700	GGCGA	2	10	180273	180282	20 %	0 %	60 %	20 %	119773296
73	NC_008700	TGCTT	2	10	181139	181148	0 %	60 %	20 %	20 %	119773297
74	NC_008700	TGGGC	2	10	183533	183542	0 %	20 %	60 %	20 %	119773298
75	NC_008700	GGTCG	2	10	185344	185353	0 %	20 %	60 %	20 %	119773298
76	NC_008700	GCGCC	2	10	189586	189595	0 %	0 %	40 %	60 %	119773302
77	NC_008700	GATTG	2	10	189662	189671	20 %	40 %	40 %	0 %	119773302
78	NC_008700	CTTTA	2	10	192529	192538	20 %	60 %	0 %	20 %	119773304
79	NC_008700	GCGCT	2	10	195893	195902	0 %	20 %	40 %	40 %	119773307
80	NC_008700	AGCAC	2	10	196856	196865	40 %	0 %	20 %	40 %	119773308
81	NC_008700	ATGGC	2	10	199568	199577	20 %	20 %	40 %	20 %	119773310
82	NC_008700	GGATG	2	10	202804	202813	20 %	20 %	60 %	0 %	119773312
83	NC_008700	TGATT	2	10	203786	203795	20 %	60 %	20 %	0 %	119773314
84	NC_008700	TGGCT	2	10	206750	206759	0 %	40 %	40 %	20 %	119773318
85	NC_008700	GTTGA	2	10	208591	208600	20 %	40 %	40 %	0 %	119773320
86	NC_008700	TGATT	2	10	209684	209693	20 %	60 %	20 %	0 %	119773322
87	NC_008700	AATCA	2	10	211993	212002	60 %	20 %	0 %	20 %	119773325
88	NC_008700	CGCTG	2	10	212421	212430	0 %	20 %	40 %	40 %	119773325
89	NC_008700	GCACA	2	10	213843	213852	40 %	0 %	20 %	40 %	119773327
90	NC_008700	AAAGT	2	10	214463	214472	60 %	20 %	20 %	0 %	119773328
91	NC_008700	GGCGC	2	10	215207	215216	0 %	0 %	60 %	40 %	119773328
92	NC_008700	TCCAG	2	10	217283	217292	20 %	20 %	20 %	40 %	119773330
93	NC_008700	TTGTT	2	10	218808	218817	0 %	80 %	20 %	0 %	119773331
94	NC_008700	CCAGC	2	10	219993	220002	20 %	0 %	20 %	60 %	119773332
95	NC_008700	CTTTT	2	10	222196	222205	0 %	80 %	0 %	20 %	119773334
96	NC_008700	TTGGC	2	10	222538	222547	0 %	40 %	40 %	20 %	119773335
97	NC_008700	CAGCA	2	10	223682	223691	40 %	0 %	20 %	40 %	119773336
98	NC_008700	CCTTG	2	10	231701	231710	0 %	40 %	20 %	40 %	119773338
99	NC_008700	GAAAG	2	10	235229	235238	60 %	0 %	40 %	0 %	119773341
100	NC_008700	AAAGA	2	10	235443	235452	80 %	0 %	20 %	0 %	119773342
101	NC_008700	GCTGA	2	10	236425	236434	20 %	20 %	40 %	20 %	119773343
102	NC_008700	GAAGA	2	10	238194	238203	60 %	0 %	40 %	0 %	119773346
103	NC_008700	ACCTG	2	10	242845	242854	20 %	20 %	20 %	40 %	119773348
104	NC_008700	TGGCC	2	10	243931	243940	0 %	20 %	40 %	40 %	119773348
105	NC_008700	GTCTG	2	10	244774	244783	0 %	40 %	40 %	20 %	119773348
106	NC_008700	ACAGC	2	10	245386	245395	40 %	0 %	20 %	40 %	119773348
107	NC_008700	GCTGA	2	10	252520	252529	20 %	20 %	40 %	20 %	119773354
108	NC_008700	CGCTA	2	10	259490	259499	20 %	20 %	20 %	40 %	119773369
109	NC_008700	TGAAA	2	10	262406	262415	60 %	20 %	20 %	0 %	119773375
110	NC_008700	ATGGC	2	10	263064	263073	20 %	20 %	40 %	20 %	119773377
111	NC_008700	CATCT	2	10	265837	265846	20 %	40 %	0 %	40 %	119773381
112	NC_008700	GTGAA	2	10	273045	273054	40 %	20 %	40 %	0 %	119773389
113	NC_008700	CCGGT	2	10	274244	274253	0 %	20 %	40 %	40 %	119773390
114	NC_008700	TGGCT	2	10	289570	289579	0 %	40 %	40 %	20 %	119773394
115	NC_008700	CGACG	2	10	290375	290384	20 %	0 %	40 %	40 %	119773395
116	NC_008700	TGGGG	2	10	299829	299838	0 %	20 %	80 %	0 %	119773402
117	NC_008700	GATGG	2	10	301780	301789	20 %	20 %	60 %	0 %	119773403
118	NC_008700	GCTTT	2	10	303280	303289	0 %	60 %	20 %	20 %	119773405
119	NC_008700	CGATA	2	10	305904	305913	40 %	20 %	20 %	20 %	119773407
120	NC_008700	CGGCG	2	10	307140	307149	0 %	0 %	60 %	40 %	119773408
121	NC_008700	GCTGT	2	10	307150	307159	0 %	40 %	40 %	20 %	119773408
122	NC_008700	CCCAT	2	10	309935	309944	20 %	20 %	0 %	60 %	119773411
123	NC_008700	GGCTG	2	10	312321	312330	0 %	20 %	60 %	20 %	119773413
124	NC_008700	AGCAA	2	10	319365	319374	60 %	0 %	20 %	20 %	119773417
125	NC_008700	GCTGA	2	10	320411	320420	20 %	20 %	40 %	20 %	119773417
126	NC_008700	GATGA	2	10	320966	320975	40 %	20 %	40 %	0 %	119773417
127	NC_008700	AGATG	2	10	323782	323791	40 %	20 %	40 %	0 %	119773419
128	NC_008700	TGGTT	2	10	325019	325028	0 %	60 %	40 %	0 %	119773419
129	NC_008700	CTATG	2	10	327723	327732	20 %	40 %	20 %	20 %	119773421
130	NC_008700	GTAAA	2	10	327827	327836	60 %	20 %	20 %	0 %	119773421
131	NC_008700	GCTGG	2	10	330235	330244	0 %	20 %	60 %	20 %	119773422
132	NC_008700	TGAAC	2	10	333717	333726	40 %	20 %	20 %	20 %	119773426
133	NC_008700	TACCG	2	10	340514	340523	20 %	20 %	20 %	40 %	119773428
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