MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 57943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008700	TTG	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773143
2	NC_008700	TTC	2	6	112	117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773143
3	NC_008700	AAT	2	6	185	190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773143
4	NC_008700	CAA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773143
5	NC_008700	GTG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773143
6	NC_008700	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773144
7	NC_008700	GTC	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773144
8	NC_008700	GCC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773144
9	NC_008700	TGA	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
10	NC_008700	GGT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773144
11	NC_008700	TGA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
12	NC_008700	CTG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773144
13	NC_008700	AGG	2	6	967	972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773144
14	NC_008700	CAG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773144
15	NC_008700	ATC	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773144
16	NC_008700	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
17	NC_008700	ACC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773144
18	NC_008700	GCG	2	6	1146	1151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773144
19	NC_008700	TGG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773144
20	NC_008700	TGA	2	6	1394	1399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
21	NC_008700	CAA	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773144
22	NC_008700	TGA	3	9	1541	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
23	NC_008700	AGT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773145
24	NC_008700	CCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773145
25	NC_008700	GCC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773145
26	NC_008700	TGC	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
27	NC_008700	TGC	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
28	NC_008700	CAC	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773145
29	NC_008700	TCG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
30	NC_008700	CGC	2	6	2106	2111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773145
31	NC_008700	CAA	2	6	2130	2135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773145
32	NC_008700	GGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773145
33	NC_008700	GCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
34	NC_008700	TGA	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773145
35	NC_008700	GGC	2	6	2368	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008700	CAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773146
37	NC_008700	CGC	2	6	2547	2552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
38	NC_008700	GAT	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773146
39	NC_008700	GCA	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
40	NC_008700	CGC	2	6	2727	2732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
41	NC_008700	CAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773146
42	NC_008700	ATG	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773146
43	NC_008700	TGG	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773146
44	NC_008700	CCG	2	6	2889	2894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
45	NC_008700	CAG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
46	NC_008700	TCC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119773146
47	NC_008700	GCA	2	6	3054	3059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
48	NC_008700	AGC	2	6	3081	3086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
49	NC_008700	GTG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773146
50	NC_008700	CTG	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773146
51	NC_008700	CGG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773146
52	NC_008700	CCA	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773146
53	NC_008700	GCC	3	9	3298	3306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
54	NC_008700	TCG	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773146
55	NC_008700	GCA	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
56	NC_008700	CTT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773146
57	NC_008700	GGC	2	6	3478	3483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773146
58	NC_008700	TAA	2	6	3492	3497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773146
59	NC_008700	AAT	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008700	TTG	2	6	3711	3716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773147
61	NC_008700	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773147
62	NC_008700	GCC	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773147
63	NC_008700	GTC	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
64	NC_008700	GCA	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773147
65	NC_008700	TGC	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
66	NC_008700	TTC	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773147
67	NC_008700	ATG	2	6	4139	4144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773147
68	NC_008700	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773147
69	NC_008700	GCC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773147
70	NC_008700	GTC	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
71	NC_008700	GCA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773147
72	NC_008700	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773147
73	NC_008700	TGC	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
74	NC_008700	AAG	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773147
75	NC_008700	TGA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773147
76	NC_008700	GGT	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008700	TTG	2	6	4593	4598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008700	GAA	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773148
79	NC_008700	AAT	2	6	4710	4715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773148
80	NC_008700	GTG	2	6	4803	4808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773148
81	NC_008700	GCT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773148
82	NC_008700	GAA	2	6	4940	4945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773148
83	NC_008700	GGC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008700	ATA	2	6	5238	5243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008700	GAA	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773149
86	NC_008700	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773149
87	NC_008700	CGG	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
88	NC_008700	CGG	2	6	5447	5452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
89	NC_008700	GCG	2	6	5469	5474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
90	NC_008700	GTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773149
91	NC_008700	TGA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773149
92	NC_008700	GCA	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773149
93	NC_008700	CAC	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773149
94	NC_008700	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773149
95	NC_008700	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773149
96	NC_008700	GGC	2	6	5868	5873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
97	NC_008700	GCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773149
98	NC_008700	TGG	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773149
99	NC_008700	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
100	NC_008700	GCT	2	6	6107	6112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773149
101	NC_008700	TGA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773149
102	NC_008700	TTG	2	6	6312	6317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773149
103	NC_008700	TGG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773149
104	NC_008700	GTC	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773150
105	NC_008700	CTG	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773150
106	NC_008700	CAG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773150
107	NC_008700	GAC	3	9	6693	6701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773150
108	NC_008700	GCC	2	6	6712	6717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773150
109	NC_008700	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773150
110	NC_008700	CGG	2	6	6936	6941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773150
111	NC_008700	CCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773150
112	NC_008700	CGG	2	6	7050	7055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773150
113	NC_008700	AAT	2	6	7060	7065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773150
114	NC_008700	GTG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773150
115	NC_008700	CAC	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773150
116	NC_008700	TGC	2	6	7233	7238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773150
117	NC_008700	TCA	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773150
118	NC_008700	GCG	2	6	7292	7297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773150
119	NC_008700	CTT	2	6	7326	7331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773150
120	NC_008700	GGC	2	6	7348	7353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773150
121	NC_008700	CCA	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773150
122	NC_008700	GGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773150
123	NC_008700	TGG	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773150
124	NC_008700	CAC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773150
125	NC_008700	GCC	2	6	7609	7614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773150
126	NC_008700	GAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773150
127	NC_008700	CAG	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773150
128	NC_008700	GAT	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773150
129	NC_008700	CGC	2	6	7812	7817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773150
130	NC_008700	GTC	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773150
131	NC_008700	TCT	2	6	7989	7994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773151
132	NC_008700	CTG	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773151
133	NC_008700	GAA	2	6	8059	8064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773151
134	NC_008700	ATC	2	6	8075	8080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773151
135	NC_008700	GCA	2	6	8091	8096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
136	NC_008700	CAG	2	6	8170	8175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
137	NC_008700	GTA	2	6	8185	8190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773151
138	NC_008700	CAG	2	6	8257	8262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
139	NC_008700	GCA	2	6	8295	8300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
140	NC_008700	GCC	2	6	8314	8319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773151
141	NC_008700	CTT	2	6	8338	8343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773151
142	NC_008700	CAT	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773151
143	NC_008700	TCT	2	6	8370	8375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773151
144	NC_008700	TCA	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773151
145	NC_008700	ATG	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773151
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147	NC_008700	ACC	2	6	8734	8739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773151
148	NC_008700	AGT	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773151
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150	NC_008700	CGG	2	6	8898	8903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773151
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152	NC_008700	CAT	3	9	8932	8940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773151
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154	NC_008700	GTT	2	6	9010	9015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773151
155	NC_008700	CGG	3	9	9153	9161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773151
156	NC_008700	GGC	2	6	9184	9189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773151
157	NC_008700	GTT	2	6	9241	9246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773151
158	NC_008700	CAG	2	6	9256	9261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
159	NC_008700	CTT	2	6	9273	9278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773151
160	NC_008700	CAG	2	6	9301	9306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
161	NC_008700	GGC	2	6	9307	9312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773151
162	NC_008700	TGC	2	6	9388	9393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773151
163	NC_008700	GCC	2	6	9461	9466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773151
164	NC_008700	CAG	2	6	9538	9543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773151
165	NC_008700	GCC	2	6	9623	9628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773152
166	NC_008700	TGG	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773152
167	NC_008700	CAG	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773153
168	NC_008700	CGA	2	6	10209	10214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773154
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170	NC_008700	AAG	2	6	10428	10433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008700	CTT	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_008700	TAA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008700	CTC	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_008700	GTC	2	6	11013	11018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773155
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240	NC_008700	AGA	2	6	15384	15389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773158
241	NC_008700	CTG	2	6	15513	15518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773158
242	NC_008700	CTG	2	6	15554	15559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773158
243	NC_008700	ATC	2	6	15596	15601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773158
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248	NC_008700	CAT	4	12	15949	15960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773158
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250	NC_008700	CTT	3	9	16009	16017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773158
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252	NC_008700	GCG	2	6	16200	16205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773158
253	NC_008700	CAT	2	6	16249	16254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773158
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256	NC_008700	AGC	2	6	16716	16721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773158
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