MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008698	GACAG	2	10	2343	2352	40 %	0 %	40 %	20 %	119718921
2	NC_008698	AGTCC	2	10	5897	5906	20 %	20 %	20 %	40 %	119718924
3	NC_008698	CGCTC	2	10	8756	8765	0 %	20 %	20 %	60 %	119718927
4	NC_008698	AGAGG	2	10	10091	10100	40 %	0 %	60 %	0 %	119718929
5	NC_008698	GCTAC	2	10	11925	11934	20 %	20 %	20 %	40 %	119718931
6	NC_008698	GTGGG	2	10	12419	12428	0 %	20 %	80 %	0 %	119718931
7	NC_008698	TCTCC	2	10	16189	16198	0 %	40 %	0 %	60 %	119718937
8	NC_008698	GAAAG	2	10	18167	18176	60 %	0 %	40 %	0 %	119718940
9	NC_008698	TCTCC	2	10	18701	18710	0 %	40 %	0 %	60 %	119718942
10	NC_008698	AGTTT	3	15	23433	23447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008698	TCGCG	2	10	23569	23578	0 %	20 %	40 %	40 %	119718949
12	NC_008698	CTGGA	2	10	24490	24499	20 %	20 %	40 %	20 %	119718950
13	NC_008698	TGTAG	2	10	26542	26551	20 %	40 %	40 %	0 %	119718953
14	NC_008698	GTAGC	2	10	31624	31633	20 %	20 %	40 %	20 %	119718960
15	NC_008698	AGCCC	2	10	37197	37206	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008698	AGAGG	2	10	37767	37776	40 %	0 %	60 %	0 %	119718967
17	NC_008698	AGCCC	2	10	40690	40699	20 %	0 %	20 %	60 %	119718971
18	NC_008698	AGCCC	2	10	40910	40919	20 %	0 %	20 %	60 %	119718971
19	NC_008698	CCGCG	2	10	43331	43340	0 %	0 %	40 %	60 %	119718976
20	NC_008698	TGTAT	2	10	43998	44007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008698	ACCTT	2	10	48277	48286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008698	GAGTA	2	10	49998	50007	40 %	20 %	40 %	0 %	119718984
23	NC_008698	GTAGA	2	10	52192	52201	40 %	20 %	40 %	0 %	119718986
24	NC_008698	ACTCG	2	10	54108	54117	20 %	20 %	20 %	40 %	119718988
25	NC_008698	AGGAG	2	10	57443	57452	40 %	0 %	60 %	0 %	119718991
26	NC_008698	CTTGT	2	10	58216	58225	0 %	60 %	20 %	20 %	119718992
27	NC_008698	GCATC	2	10	58749	58758	20 %	20 %	20 %	40 %	119718993
28	NC_008698	GGCTT	2	10	59060	59069	0 %	40 %	40 %	20 %	119718994
29	NC_008698	CCTGG	2	10	60027	60036	0 %	20 %	40 %	40 %	119718995
30	NC_008698	CTTCT	2	10	60253	60262	0 %	60 %	0 %	40 %	119718995
31	NC_008698	TTTCA	2	10	60960	60969	20 %	60 %	0 %	20 %	119718995
32	NC_008698	AGCCT	2	10	63158	63167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_008698	AGGAG	2	10	64804	64813	40 %	0 %	60 %	0 %	119719000
34	NC_008698	CTATA	2	10	67281	67290	40 %	40 %	0 %	20 %	119719003
35	NC_008698	ACAGG	2	10	68954	68963	40 %	0 %	40 %	20 %	119719005
36	NC_008698	AGAGG	2	10	71122	71131	40 %	0 %	60 %	0 %	119719008
37	NC_008698	TTCCT	2	10	80708	80717	0 %	60 %	0 %	40 %	119719021
38	NC_008698	TAACG	2	10	80922	80931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008698	AAAGC	2	10	81053	81062	60 %	0 %	20 %	20 %	119719022
40	NC_008698	TATAG	2	10	85006	85015	40 %	40 %	20 %	0 %	119719028
41	NC_008698	CCCTC	2	10	86518	86527	0 %	20 %	0 %	80 %	119719029
42	NC_008698	ACTTC	2	10	86785	86794	20 %	40 %	0 %	40 %	119719029
43	NC_008698	GCCGT	2	10	86808	86817	0 %	20 %	40 %	40 %	119719029
44	NC_008698	CGTTT	2	10	87112	87121	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008698	GGGCT	2	10	93267	93276	0 %	20 %	60 %	20 %	119719036
46	NC_008698	TCCAC	2	10	96316	96325	20 %	20 %	0 %	60 %	119719039
47	NC_008698	AAGCC	2	10	102383	102392	40 %	0 %	20 %	40 %	119719046
48	NC_008698	GCTAC	2	10	104002	104011	20 %	20 %	20 %	40 %	119719048
49	NC_008698	AGGGA	2	10	104931	104940	40 %	0 %	60 %	0 %	119719048
50	NC_008698	GCGAG	2	10	106206	106215	20 %	0 %	60 %	20 %	119719048
51	NC_008698	GCTAG	2	10	106669	106678	20 %	20 %	40 %	20 %	119719049
52	NC_008698	GAGAA	2	10	108273	108282	60 %	0 %	40 %	0 %	119719050
53	NC_008698	CTCTT	2	10	114082	114091	0 %	60 %	0 %	40 %	119719055
54	NC_008698	TTCGC	2	10	114685	114694	0 %	40 %	20 %	40 %	119719056
55	NC_008698	AGAGC	2	10	115961	115970	40 %	0 %	40 %	20 %	119719057
56	NC_008698	AGCGG	2	10	117508	117517	20 %	0 %	60 %	20 %	119719060
57	NC_008698	TCCTC	2	10	117700	117709	0 %	40 %	0 %	60 %	119719060
58	NC_008698	TGGAG	2	10	117862	117871	20 %	20 %	60 %	0 %	119719060
59	NC_008698	CTCTT	2	10	120471	120480	0 %	60 %	0 %	40 %	119719063
60	NC_008698	TCGGG	2	10	123955	123964	0 %	20 %	60 %	20 %	119719066
61	NC_008698	ACTCT	2	10	127503	127512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008698	AGAGA	2	10	136278	136287	60 %	0 %	40 %	0 %	119719077
63	NC_008698	GAAGA	2	10	142916	142925	60 %	0 %	40 %	0 %	119719086
64	NC_008698	ATGGA	2	10	143615	143624	40 %	20 %	40 %	0 %	119719086
65	NC_008698	CGAGC	2	10	144009	144018	20 %	0 %	40 %	40 %	119719087
66	NC_008698	GCCTT	2	10	150899	150908	0 %	40 %	20 %	40 %	119719094
67	NC_008698	CCGTA	2	10	151599	151608	20 %	20 %	20 %	40 %	119719094
68	NC_008698	CCTCT	2	10	154271	154280	0 %	40 %	0 %	60 %	119719097
69	NC_008698	ATAAA	2	10	154524	154533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008698	AGGAA	2	10	160872	160881	60 %	0 %	40 %	0 %	119719103
71	NC_008698	TGGCG	2	10	166699	166708	0 %	20 %	60 %	20 %	119719108
72	NC_008698	CGAGG	2	10	168028	168037	20 %	0 %	60 %	20 %	119719108
73	NC_008698	ACTCT	2	10	169663	169672	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008698	TCCGC	2	10	170250	170259	0 %	20 %	20 %	60 %	119719110
75	NC_008698	AGCAA	2	10	170377	170386	60 %	0 %	20 %	20 %	119719110
76	NC_008698	TACTC	2	10	173345	173354	20 %	40 %	0 %	40 %	119719113
77	NC_008698	GCGAA	2	10	175206	175215	40 %	0 %	40 %	20 %	119719115
78	NC_008698	CTGCC	2	10	176266	176275	0 %	20 %	20 %	60 %	119719115
79	NC_008698	GTCCA	2	10	179194	179203	20 %	20 %	20 %	40 %	119719117
80	NC_008698	AGAGA	2	10	184440	184449	60 %	0 %	40 %	0 %	119719123
81	NC_008698	TCCTT	2	10	190763	190772	0 %	60 %	0 %	40 %	119719129
82	NC_008698	CACAA	2	10	193239	193248	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008698	GCGCG	2	10	193842	193851	0 %	0 %	60 %	40 %	119719132
84	NC_008698	TGGTT	2	10	196863	196872	0 %	60 %	40 %	0 %	119719136
85	NC_008698	GCTGG	2	10	200374	200383	0 %	20 %	60 %	20 %	119719139
86	NC_008698	TACCT	2	10	203636	203645	20 %	40 %	0 %	40 %	119719144
87	NC_008698	GTAAG	2	10	205678	205687	40 %	20 %	40 %	0 %	119719146
88	NC_008698	ACCTC	2	10	206531	206540	20 %	20 %	0 %	60 %	119719148
89	NC_008698	TGGCG	2	10	206608	206617	0 %	20 %	60 %	20 %	119719148
90	NC_008698	TCCTC	2	10	208230	208239	0 %	40 %	0 %	60 %	119719149
91	NC_008698	TAACA	2	10	209719	209728	60 %	20 %	0 %	20 %	119719151
92	NC_008698	TACCA	2	10	210752	210761	40 %	20 %	0 %	40 %	119719152
93	NC_008698	CTCTT	2	10	211308	211317	0 %	60 %	0 %	40 %	119719153
94	NC_008698	GCCTT	2	10	211739	211748	0 %	40 %	20 %	40 %	119719154
95	NC_008698	CCCCT	2	10	212994	213003	0 %	20 %	0 %	80 %	119719156
96	NC_008698	CTTAT	2	10	213457	213466	20 %	60 %	0 %	20 %	119719157
97	NC_008698	TCGAG	2	10	216391	216400	20 %	20 %	40 %	20 %	119719163
98	NC_008698	AGGCT	2	10	218759	218768	20 %	20 %	40 %	20 %	119719166
99	NC_008698	CGAGC	2	10	218928	218937	20 %	0 %	40 %	40 %	119719166
100	NC_008698	GCTGT	2	10	224396	224405	0 %	40 %	40 %	20 %	119719172
101	NC_008698	ACTTC	2	10	225782	225791	20 %	40 %	0 %	40 %	119719174
102	NC_008698	CCTGA	2	10	228634	228643	20 %	20 %	20 %	40 %	119719178
103	NC_008698	CGCGG	2	10	228942	228951	0 %	0 %	60 %	40 %	119719178
104	NC_008698	AGCCC	2	10	229155	229164	20 %	0 %	20 %	60 %	119719178
105	NC_008698	GCGCG	2	10	230989	230998	0 %	0 %	60 %	40 %	119719180
106	NC_008698	GGAGG	2	10	231677	231686	20 %	0 %	80 %	0 %	119719181
107	NC_008698	AGCCT	2	10	233713	233722	20 %	20 %	20 %	40 %	119719183
108	NC_008698	GAGCT	2	10	234403	234412	20 %	20 %	40 %	20 %	119719183
109	NC_008698	GAGAG	2	10	234419	234428	40 %	0 %	60 %	0 %	119719183
110	NC_008698	AGAGC	2	10	235525	235534	40 %	0 %	40 %	20 %	119719184
111	NC_008698	CCTCC	2	10	237191	237200	0 %	20 %	0 %	80 %	119719186
112	NC_008698	GAGAG	2	10	239330	239339	40 %	0 %	60 %	0 %	119719188
113	NC_008698	ACGCT	2	10	239645	239654	20 %	20 %	20 %	40 %	119719189
114	NC_008698	CCTTC	2	10	239709	239718	0 %	40 %	0 %	60 %	119719189
115	NC_008698	GCCTT	2	10	242782	242791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008698	TTCTC	2	10	247432	247441	0 %	60 %	0 %	40 %	119719200
117	NC_008698	CTAGC	2	10	247876	247885	20 %	20 %	20 %	40 %	119719201
118	NC_008698	TGGCG	2	10	248562	248571	0 %	20 %	60 %	20 %	119719202
119	NC_008698	ACCGT	2	10	250077	250086	20 %	20 %	20 %	40 %	119719203
120	NC_008698	CCTCC	2	10	250985	250994	0 %	20 %	0 %	80 %	119719203
121	NC_008698	TACCC	2	10	252270	252279	20 %	20 %	0 %	60 %	119719204
122	NC_008698	CTTCC	2	10	258357	258366	0 %	40 %	0 %	60 %	119719208
123	NC_008698	TCCTC	2	10	259237	259246	0 %	40 %	0 %	60 %	119719209
124	NC_008698	ATTGT	2	10	260535	260544	20 %	60 %	20 %	0 %	119719210
125	NC_008698	AGCAA	2	10	261018	261027	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008698	AGAGT	2	10	261894	261903	40 %	20 %	40 %	0 %	119719212
127	NC_008698	TCACC	2	10	262759	262768	20 %	20 %	0 %	60 %	119719213
128	NC_008698	AAGAA	2	10	265647	265656	80 %	0 %	20 %	0 %	119719216
129	NC_008698	TCCGC	2	10	266783	266792	0 %	20 %	20 %	60 %	119719217
130	NC_008698	CAGAA	2	10	272787	272796	60 %	0 %	20 %	20 %	119719223
131	NC_008698	AAGGC	2	10	273627	273636	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008698	AAGCT	2	10	276740	276749	40 %	20 %	20 %	20 %	119719226
133	NC_008698	GAGAA	2	10	278902	278911	60 %	0 %	40 %	0 %	119719230
134	NC_008698	TCCAT	2	10	280103	280112	20 %	40 %	0 %	40 %	119719233
135	NC_008698	GGTAC	2	10	281876	281885	20 %	20 %	40 %	20 %	119719234
136	NC_008698	CCCCA	2	10	282961	282970	20 %	0 %	0 %	80 %	119719235
137	NC_008698	AAAGC	2	10	284553	284562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008698	CTCTC	2	10	286223	286232	0 %	40 %	0 %	60 %	119719237
139	NC_008698	CGGAG	2	10	288022	288031	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008698	CGCGG	2	10	288957	288966	0 %	0 %	60 %	40 %	119719239
141	NC_008698	ACGCG	2	10	295066	295075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008698	CCTGA	2	10	297411	297420	20 %	20 %	20 %	40 %	119719247
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147	NC_008698	CTACT	2	10	308486	308495	20 %	40 %	0 %	40 %	119719254
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149	NC_008698	AAAAG	2	10	315568	315577	80 %	0 %	20 %	0 %	119719260
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152	NC_008698	TCCGC	2	10	318995	319004	0 %	20 %	20 %	60 %	119719264
153	NC_008698	CCTTG	2	10	319224	319233	0 %	40 %	20 %	40 %	119719264
154	NC_008698	TCTCC	2	10	319740	319749	0 %	40 %	0 %	60 %	119719264
155	NC_008698	CCGGG	2	10	320650	320659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_008698	GAGAA	2	10	322478	322487	60 %	0 %	40 %	0 %	119719268
157	NC_008698	GGCCC	2	10	325042	325051	0 %	0 %	40 %	60 %	119719272
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159	NC_008698	GTACT	2	10	329754	329763	20 %	40 %	20 %	20 %	119719277
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168	NC_008698	CGCGC	2	10	341158	341167	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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177	NC_008698	TCCCG	2	10	355650	355659	0 %	20 %	20 %	60 %	119719310
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193	NC_008698	CGGGC	2	10	378600	378609	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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254	NC_008698	GGCGC	2	10	526836	526845	0 %	0 %	60 %	40 %	119719488
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259	NC_008698	AAGGC	2	10	538466	538475	40 %	0 %	40 %	20 %	119719499
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263	NC_008698	TCCTC	2	10	554718	554727	0 %	40 %	0 %	60 %	119719513
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265	NC_008698	CGGAC	2	10	559371	559380	20 %	0 %	40 %	40 %	119719517
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