MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008698	GACAG	2	10	2343	2352	40 %	0 %	40 %	20 %	119718921
2	NC_008698	AGTCC	2	10	5897	5906	20 %	20 %	20 %	40 %	119718924
3	NC_008698	CGCTC	2	10	8756	8765	0 %	20 %	20 %	60 %	119718927
4	NC_008698	AGAGG	2	10	10091	10100	40 %	0 %	60 %	0 %	119718929
5	NC_008698	GCTAC	2	10	11925	11934	20 %	20 %	20 %	40 %	119718931
6	NC_008698	GTGGG	2	10	12419	12428	0 %	20 %	80 %	0 %	119718931
7	NC_008698	TCTCC	2	10	16189	16198	0 %	40 %	0 %	60 %	119718937
8	NC_008698	GAAAG	2	10	18167	18176	60 %	0 %	40 %	0 %	119718940
9	NC_008698	TCTCC	2	10	18701	18710	0 %	40 %	0 %	60 %	119718942
10	NC_008698	TCGCG	2	10	23569	23578	0 %	20 %	40 %	40 %	119718949
11	NC_008698	CTGGA	2	10	24490	24499	20 %	20 %	40 %	20 %	119718950
12	NC_008698	TGTAG	2	10	26542	26551	20 %	40 %	40 %	0 %	119718953
13	NC_008698	GTAGC	2	10	31624	31633	20 %	20 %	40 %	20 %	119718960
14	NC_008698	AGAGG	2	10	37767	37776	40 %	0 %	60 %	0 %	119718967
15	NC_008698	AGCCC	2	10	40690	40699	20 %	0 %	20 %	60 %	119718971
16	NC_008698	AGCCC	2	10	40910	40919	20 %	0 %	20 %	60 %	119718971
17	NC_008698	CCGCG	2	10	43331	43340	0 %	0 %	40 %	60 %	119718976
18	NC_008698	GAGTA	2	10	49998	50007	40 %	20 %	40 %	0 %	119718984
19	NC_008698	GTAGA	2	10	52192	52201	40 %	20 %	40 %	0 %	119718986
20	NC_008698	ACTCG	2	10	54108	54117	20 %	20 %	20 %	40 %	119718988
21	NC_008698	AGGAG	2	10	57443	57452	40 %	0 %	60 %	0 %	119718991
22	NC_008698	CTTGT	2	10	58216	58225	0 %	60 %	20 %	20 %	119718992
23	NC_008698	GCATC	2	10	58749	58758	20 %	20 %	20 %	40 %	119718993
24	NC_008698	GGCTT	2	10	59060	59069	0 %	40 %	40 %	20 %	119718994
25	NC_008698	CCTGG	2	10	60027	60036	0 %	20 %	40 %	40 %	119718995
26	NC_008698	CTTCT	2	10	60253	60262	0 %	60 %	0 %	40 %	119718995
27	NC_008698	TTTCA	2	10	60960	60969	20 %	60 %	0 %	20 %	119718995
28	NC_008698	AGGAG	2	10	64804	64813	40 %	0 %	60 %	0 %	119719000
29	NC_008698	CTATA	2	10	67281	67290	40 %	40 %	0 %	20 %	119719003
30	NC_008698	ACAGG	2	10	68954	68963	40 %	0 %	40 %	20 %	119719005
31	NC_008698	AGAGG	2	10	71122	71131	40 %	0 %	60 %	0 %	119719008
32	NC_008698	TTCCT	2	10	80708	80717	0 %	60 %	0 %	40 %	119719021
33	NC_008698	AAAGC	2	10	81053	81062	60 %	0 %	20 %	20 %	119719022
34	NC_008698	TATAG	2	10	85006	85015	40 %	40 %	20 %	0 %	119719028
35	NC_008698	CCCTC	2	10	86518	86527	0 %	20 %	0 %	80 %	119719029
36	NC_008698	ACTTC	2	10	86785	86794	20 %	40 %	0 %	40 %	119719029
37	NC_008698	GCCGT	2	10	86808	86817	0 %	20 %	40 %	40 %	119719029
38	NC_008698	GGGCT	2	10	93267	93276	0 %	20 %	60 %	20 %	119719036
39	NC_008698	TCCAC	2	10	96316	96325	20 %	20 %	0 %	60 %	119719039
40	NC_008698	AAGCC	2	10	102383	102392	40 %	0 %	20 %	40 %	119719046
41	NC_008698	GCTAC	2	10	104002	104011	20 %	20 %	20 %	40 %	119719048
42	NC_008698	AGGGA	2	10	104931	104940	40 %	0 %	60 %	0 %	119719048
43	NC_008698	GCGAG	2	10	106206	106215	20 %	0 %	60 %	20 %	119719048
44	NC_008698	GCTAG	2	10	106669	106678	20 %	20 %	40 %	20 %	119719049
45	NC_008698	GAGAA	2	10	108273	108282	60 %	0 %	40 %	0 %	119719050
46	NC_008698	CTCTT	2	10	114082	114091	0 %	60 %	0 %	40 %	119719055
47	NC_008698	TTCGC	2	10	114685	114694	0 %	40 %	20 %	40 %	119719056
48	NC_008698	AGAGC	2	10	115961	115970	40 %	0 %	40 %	20 %	119719057
49	NC_008698	AGCGG	2	10	117508	117517	20 %	0 %	60 %	20 %	119719060
50	NC_008698	TCCTC	2	10	117700	117709	0 %	40 %	0 %	60 %	119719060
51	NC_008698	TGGAG	2	10	117862	117871	20 %	20 %	60 %	0 %	119719060
52	NC_008698	CTCTT	2	10	120471	120480	0 %	60 %	0 %	40 %	119719063
53	NC_008698	TCGGG	2	10	123955	123964	0 %	20 %	60 %	20 %	119719066
54	NC_008698	AGAGA	2	10	136278	136287	60 %	0 %	40 %	0 %	119719077
55	NC_008698	GAAGA	2	10	142916	142925	60 %	0 %	40 %	0 %	119719086
56	NC_008698	ATGGA	2	10	143615	143624	40 %	20 %	40 %	0 %	119719086
57	NC_008698	CGAGC	2	10	144009	144018	20 %	0 %	40 %	40 %	119719087
58	NC_008698	GCCTT	2	10	150899	150908	0 %	40 %	20 %	40 %	119719094
59	NC_008698	CCGTA	2	10	151599	151608	20 %	20 %	20 %	40 %	119719094
60	NC_008698	CCTCT	2	10	154271	154280	0 %	40 %	0 %	60 %	119719097
61	NC_008698	AGGAA	2	10	160872	160881	60 %	0 %	40 %	0 %	119719103
62	NC_008698	TGGCG	2	10	166699	166708	0 %	20 %	60 %	20 %	119719108
63	NC_008698	CGAGG	2	10	168028	168037	20 %	0 %	60 %	20 %	119719108
64	NC_008698	TCCGC	2	10	170250	170259	0 %	20 %	20 %	60 %	119719110
65	NC_008698	AGCAA	2	10	170377	170386	60 %	0 %	20 %	20 %	119719110
66	NC_008698	TACTC	2	10	173345	173354	20 %	40 %	0 %	40 %	119719113
67	NC_008698	GCGAA	2	10	175206	175215	40 %	0 %	40 %	20 %	119719115
68	NC_008698	CTGCC	2	10	176266	176275	0 %	20 %	20 %	60 %	119719115
69	NC_008698	GTCCA	2	10	179194	179203	20 %	20 %	20 %	40 %	119719117
70	NC_008698	AGAGA	2	10	184440	184449	60 %	0 %	40 %	0 %	119719123
71	NC_008698	TCCTT	2	10	190763	190772	0 %	60 %	0 %	40 %	119719129
72	NC_008698	GCGCG	2	10	193842	193851	0 %	0 %	60 %	40 %	119719132
73	NC_008698	TGGTT	2	10	196863	196872	0 %	60 %	40 %	0 %	119719136
74	NC_008698	GCTGG	2	10	200374	200383	0 %	20 %	60 %	20 %	119719139
75	NC_008698	TACCT	2	10	203636	203645	20 %	40 %	0 %	40 %	119719144
76	NC_008698	GTAAG	2	10	205678	205687	40 %	20 %	40 %	0 %	119719146
77	NC_008698	ACCTC	2	10	206531	206540	20 %	20 %	0 %	60 %	119719148
78	NC_008698	TGGCG	2	10	206608	206617	0 %	20 %	60 %	20 %	119719148
79	NC_008698	TCCTC	2	10	208230	208239	0 %	40 %	0 %	60 %	119719149
80	NC_008698	TAACA	2	10	209719	209728	60 %	20 %	0 %	20 %	119719151
81	NC_008698	TACCA	2	10	210752	210761	40 %	20 %	0 %	40 %	119719152
82	NC_008698	CTCTT	2	10	211308	211317	0 %	60 %	0 %	40 %	119719153
83	NC_008698	GCCTT	2	10	211739	211748	0 %	40 %	20 %	40 %	119719154
84	NC_008698	CCCCT	2	10	212994	213003	0 %	20 %	0 %	80 %	119719156
85	NC_008698	CTTAT	2	10	213457	213466	20 %	60 %	0 %	20 %	119719157
86	NC_008698	TCGAG	2	10	216391	216400	20 %	20 %	40 %	20 %	119719163
87	NC_008698	AGGCT	2	10	218759	218768	20 %	20 %	40 %	20 %	119719166
88	NC_008698	CGAGC	2	10	218928	218937	20 %	0 %	40 %	40 %	119719166
89	NC_008698	GCTGT	2	10	224396	224405	0 %	40 %	40 %	20 %	119719172
90	NC_008698	ACTTC	2	10	225782	225791	20 %	40 %	0 %	40 %	119719174
91	NC_008698	CCTGA	2	10	228634	228643	20 %	20 %	20 %	40 %	119719178
92	NC_008698	CGCGG	2	10	228942	228951	0 %	0 %	60 %	40 %	119719178
93	NC_008698	AGCCC	2	10	229155	229164	20 %	0 %	20 %	60 %	119719178
94	NC_008698	GCGCG	2	10	230989	230998	0 %	0 %	60 %	40 %	119719180
95	NC_008698	GGAGG	2	10	231677	231686	20 %	0 %	80 %	0 %	119719181
96	NC_008698	AGCCT	2	10	233713	233722	20 %	20 %	20 %	40 %	119719183
97	NC_008698	GAGCT	2	10	234403	234412	20 %	20 %	40 %	20 %	119719183
98	NC_008698	GAGAG	2	10	234419	234428	40 %	0 %	60 %	0 %	119719183
99	NC_008698	AGAGC	2	10	235525	235534	40 %	0 %	40 %	20 %	119719184
100	NC_008698	CCTCC	2	10	237191	237200	0 %	20 %	0 %	80 %	119719186
101	NC_008698	GAGAG	2	10	239330	239339	40 %	0 %	60 %	0 %	119719188
102	NC_008698	ACGCT	2	10	239645	239654	20 %	20 %	20 %	40 %	119719189
103	NC_008698	CCTTC	2	10	239709	239718	0 %	40 %	0 %	60 %	119719189
104	NC_008698	TTCTC	2	10	247432	247441	0 %	60 %	0 %	40 %	119719200
105	NC_008698	CTAGC	2	10	247876	247885	20 %	20 %	20 %	40 %	119719201
106	NC_008698	TGGCG	2	10	248562	248571	0 %	20 %	60 %	20 %	119719202
107	NC_008698	ACCGT	2	10	250077	250086	20 %	20 %	20 %	40 %	119719203
108	NC_008698	CCTCC	2	10	250985	250994	0 %	20 %	0 %	80 %	119719203
109	NC_008698	TACCC	2	10	252270	252279	20 %	20 %	0 %	60 %	119719204
110	NC_008698	CTTCC	2	10	258357	258366	0 %	40 %	0 %	60 %	119719208
111	NC_008698	TCCTC	2	10	259237	259246	0 %	40 %	0 %	60 %	119719209
112	NC_008698	ATTGT	2	10	260535	260544	20 %	60 %	20 %	0 %	119719210
113	NC_008698	AGAGT	2	10	261894	261903	40 %	20 %	40 %	0 %	119719212
114	NC_008698	TCACC	2	10	262759	262768	20 %	20 %	0 %	60 %	119719213
115	NC_008698	AAGAA	2	10	265647	265656	80 %	0 %	20 %	0 %	119719216
116	NC_008698	TCCGC	2	10	266783	266792	0 %	20 %	20 %	60 %	119719217
117	NC_008698	CAGAA	2	10	272787	272796	60 %	0 %	20 %	20 %	119719223
118	NC_008698	AAGCT	2	10	276740	276749	40 %	20 %	20 %	20 %	119719226
119	NC_008698	GAGAA	2	10	278902	278911	60 %	0 %	40 %	0 %	119719230
120	NC_008698	TCCAT	2	10	280103	280112	20 %	40 %	0 %	40 %	119719233
121	NC_008698	GGTAC	2	10	281876	281885	20 %	20 %	40 %	20 %	119719234
122	NC_008698	CCCCA	2	10	282961	282970	20 %	0 %	0 %	80 %	119719235
123	NC_008698	CTCTC	2	10	286223	286232	0 %	40 %	0 %	60 %	119719237
124	NC_008698	CGCGG	2	10	288957	288966	0 %	0 %	60 %	40 %	119719239
125	NC_008698	CCTGA	2	10	297411	297420	20 %	20 %	20 %	40 %	119719247
126	NC_008698	GTAGG	2	10	300257	300266	20 %	20 %	60 %	0 %	119719248
127	NC_008698	TCGGG	2	10	303149	303158	0 %	20 %	60 %	20 %	119719252
128	NC_008698	GGAAG	2	10	305581	305590	40 %	0 %	60 %	0 %	119719253
129	NC_008698	GAAAA	2	10	307499	307508	80 %	0 %	20 %	0 %	119719254
130	NC_008698	CTACT	2	10	308486	308495	20 %	40 %	0 %	40 %	119719254
131	NC_008698	CTCTC	2	10	309086	309095	0 %	40 %	0 %	60 %	119719254
132	NC_008698	AAAAG	2	10	315568	315577	80 %	0 %	20 %	0 %	119719260
133	NC_008698	CAGCC	2	10	316537	316546	20 %	0 %	20 %	60 %	119719261
134	NC_008698	GCGTG	2	10	316615	316624	0 %	20 %	60 %	20 %	119719261
135	NC_008698	TCCGC	2	10	318995	319004	0 %	20 %	20 %	60 %	119719264
136	NC_008698	CCTTG	2	10	319224	319233	0 %	40 %	20 %	40 %	119719264
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150	NC_008698	CAGCC	2	10	343852	343861	20 %	0 %	20 %	60 %	119719295
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