MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008698	CTCG	2	8	1799	1806	0 %	25 %	25 %	50 %	119718920
2	NC_008698	GGTG	2	8	2689	2696	0 %	25 %	75 %	0 %	119718921
3	NC_008698	GACC	2	8	2777	2784	25 %	0 %	25 %	50 %	119718921
4	NC_008698	TCGT	2	8	3229	3236	0 %	50 %	25 %	25 %	119718922
5	NC_008698	CTAG	2	8	4897	4904	25 %	25 %	25 %	25 %	119718923
6	NC_008698	TCCC	2	8	5538	5545	0 %	25 %	0 %	75 %	119718924
7	NC_008698	CGCT	2	8	6387	6394	0 %	25 %	25 %	50 %	119718925
8	NC_008698	TGCC	2	8	7545	7552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008698	GCTG	2	8	7853	7860	0 %	25 %	50 %	25 %	119718927
10	NC_008698	CAGC	2	8	8016	8023	25 %	0 %	25 %	50 %	119718927
11	NC_008698	CCAC	2	8	8453	8460	25 %	0 %	0 %	75 %	119718927
12	NC_008698	AGCT	2	8	9172	9179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008698	TACG	2	8	9417	9424	25 %	25 %	25 %	25 %	119718928
14	NC_008698	GGGC	2	8	10230	10237	0 %	0 %	75 %	25 %	119718929
15	NC_008698	CTAC	2	8	10389	10396	25 %	25 %	0 %	50 %	119718929
16	NC_008698	AGTC	2	8	10970	10977	25 %	25 %	25 %	25 %	119718930
17	NC_008698	CCGT	2	8	11796	11803	0 %	25 %	25 %	50 %	119718931
18	NC_008698	CTTC	2	8	12011	12018	0 %	50 %	0 %	50 %	119718931
19	NC_008698	AAGG	2	8	12691	12698	50 %	0 %	50 %	0 %	119718932
20	NC_008698	AGCC	2	8	13522	13529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008698	CCTC	2	8	13884	13891	0 %	25 %	0 %	75 %	119718933
22	NC_008698	TGCC	2	8	14447	14454	0 %	25 %	25 %	50 %	119718934
23	NC_008698	AACG	2	8	14529	14536	50 %	0 %	25 %	25 %	119718934
24	NC_008698	CGAC	2	8	15470	15477	25 %	0 %	25 %	50 %	119718936
25	NC_008698	TTCC	2	8	15949	15956	0 %	50 %	0 %	50 %	119718937
26	NC_008698	CCTC	2	8	16054	16061	0 %	25 %	0 %	75 %	119718937
27	NC_008698	CCCT	2	8	16545	16552	0 %	25 %	0 %	75 %	119718937
28	NC_008698	CTTG	2	8	16635	16642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008698	GCTC	2	8	16904	16911	0 %	25 %	25 %	50 %	119718938
30	NC_008698	CCCT	2	8	17848	17855	0 %	25 %	0 %	75 %	119718940
31	NC_008698	GCGG	2	8	17890	17897	0 %	0 %	75 %	25 %	119718940
32	NC_008698	CCCG	2	8	18031	18038	0 %	0 %	25 %	75 %	119718940
33	NC_008698	GCTC	2	8	18110	18117	0 %	25 %	25 %	50 %	119718940
34	NC_008698	CTTC	2	8	18631	18638	0 %	50 %	0 %	50 %	119718941
35	NC_008698	AAAG	2	8	18886	18893	75 %	0 %	25 %	0 %	119718942
36	NC_008698	TAGG	2	8	18917	18924	25 %	25 %	50 %	0 %	119718942
37	NC_008698	CGCC	2	8	20328	20335	0 %	0 %	25 %	75 %	119718944
38	NC_008698	TAGG	2	8	21046	21053	25 %	25 %	50 %	0 %	119718945
39	NC_008698	CGAG	2	8	21166	21173	25 %	0 %	50 %	25 %	119718945
40	NC_008698	CTGC	2	8	22699	22706	0 %	25 %	25 %	50 %	119718947
41	NC_008698	TTGC	2	8	23118	23125	0 %	50 %	25 %	25 %	119718948
42	NC_008698	GAGG	2	8	23627	23634	25 %	0 %	75 %	0 %	119718949
43	NC_008698	CTGC	2	8	26164	26171	0 %	25 %	25 %	50 %	119718953
44	NC_008698	CCAC	2	8	26277	26284	25 %	0 %	0 %	75 %	119718953
45	NC_008698	GACG	2	8	27800	27807	25 %	0 %	50 %	25 %	119718956
46	NC_008698	ACCT	2	8	28149	28156	25 %	25 %	0 %	50 %	119718956
47	NC_008698	GCAG	2	8	29542	29549	25 %	0 %	50 %	25 %	119718958
48	NC_008698	CCTA	2	8	31573	31580	25 %	25 %	0 %	50 %	119718960
49	NC_008698	GCCC	2	8	31827	31834	0 %	0 %	25 %	75 %	119718960
50	NC_008698	CGAG	2	8	32401	32408	25 %	0 %	50 %	25 %	119718961
51	NC_008698	GTGG	2	8	33309	33316	0 %	25 %	75 %	0 %	119718961
52	NC_008698	TGGG	2	8	33647	33654	0 %	25 %	75 %	0 %	119718962
53	NC_008698	GGAG	2	8	34360	34367	25 %	0 %	75 %	0 %	119718962
54	NC_008698	TACG	2	8	35411	35418	25 %	25 %	25 %	25 %	119718963
55	NC_008698	CTGC	2	8	35639	35646	0 %	25 %	25 %	50 %	119718964
56	NC_008698	GCAC	2	8	36437	36444	25 %	0 %	25 %	50 %	119718964
57	NC_008698	AGGC	2	8	36655	36662	25 %	0 %	50 %	25 %	119718965
58	NC_008698	AGGG	2	8	37231	37238	25 %	0 %	75 %	0 %	119718966
59	NC_008698	GCGG	2	8	37344	37351	0 %	0 %	75 %	25 %	119718966
60	NC_008698	AGGC	2	8	38604	38611	25 %	0 %	50 %	25 %	119718969
61	NC_008698	GGCG	2	8	39399	39406	0 %	0 %	75 %	25 %	119718970
62	NC_008698	CCCT	2	8	39775	39782	0 %	25 %	0 %	75 %	119718971
63	NC_008698	CGAG	2	8	40079	40086	25 %	0 %	50 %	25 %	119718971
64	NC_008698	CCCG	2	8	40464	40471	0 %	0 %	25 %	75 %	119718971
65	NC_008698	CCTC	2	8	40709	40716	0 %	25 %	0 %	75 %	119718971
66	NC_008698	CTCC	2	8	41000	41007	0 %	25 %	0 %	75 %	119718972
67	NC_008698	AGAA	2	8	41336	41343	75 %	0 %	25 %	0 %	119718972
68	NC_008698	ACTC	2	8	41415	41422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008698	TTTC	2	8	41437	41444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008698	GCCA	2	8	42476	42483	25 %	0 %	25 %	50 %	119718974
71	NC_008698	AGAA	2	8	42928	42935	75 %	0 %	25 %	0 %	119718975
72	NC_008698	ATTT	2	8	44072	44079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008698	GGGA	2	8	45479	45486	25 %	0 %	75 %	0 %	119718977
74	NC_008698	GCAT	2	8	45504	45511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008698	CTCC	2	8	45721	45728	0 %	25 %	0 %	75 %	119718978
76	NC_008698	CGCC	2	8	47092	47099	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_008698	TTCC	2	8	47412	47419	0 %	50 %	0 %	50 %	119718980
78	NC_008698	GCGA	2	8	47513	47520	25 %	0 %	50 %	25 %	119718980
79	NC_008698	TTCG	2	8	47614	47621	0 %	50 %	25 %	25 %	119718980
80	NC_008698	GAGC	2	8	47749	47756	25 %	0 %	50 %	25 %	119718980
81	NC_008698	CCTG	2	8	47917	47924	0 %	25 %	25 %	50 %	119718981
82	NC_008698	GCTT	2	8	48322	48329	0 %	50 %	25 %	25 %	119718982
83	NC_008698	GGTT	2	8	52047	52054	0 %	50 %	50 %	0 %	119718986
84	NC_008698	AGGC	2	8	52293	52300	25 %	0 %	50 %	25 %	119718986
85	NC_008698	GGCT	2	8	52914	52921	0 %	25 %	50 %	25 %	119718987
86	NC_008698	AGTG	2	8	53002	53009	25 %	25 %	50 %	0 %	119718987
87	NC_008698	CAAG	2	8	53644	53651	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008698	GATA	2	8	54573	54580	50 %	25 %	25 %	0 %	119718988
89	NC_008698	GGCT	2	8	54636	54643	0 %	25 %	50 %	25 %	119718988
90	NC_008698	GGGC	2	8	54687	54694	0 %	0 %	75 %	25 %	119718988
91	NC_008698	AGCT	2	8	54748	54755	25 %	25 %	25 %	25 %	119718988
92	NC_008698	TAGG	2	8	54798	54805	25 %	25 %	50 %	0 %	119718989
93	NC_008698	TGGA	2	8	54898	54905	25 %	25 %	50 %	0 %	119718989
94	NC_008698	CTTG	2	8	54954	54961	0 %	50 %	25 %	25 %	119718989
95	NC_008698	CCAG	2	8	56120	56127	25 %	0 %	25 %	50 %	119718989
96	NC_008698	AGGG	2	8	56879	56886	25 %	0 %	75 %	0 %	119718991
97	NC_008698	GTAG	2	8	57350	57357	25 %	25 %	50 %	0 %	119718991
98	NC_008698	CGTC	2	8	57604	57611	0 %	25 %	25 %	50 %	119718991
99	NC_008698	CAAC	2	8	57794	57801	50 %	0 %	0 %	50 %	119718991
100	NC_008698	CCAG	2	8	58227	58234	25 %	0 %	25 %	50 %	119718992
101	NC_008698	CATT	2	8	58670	58677	25 %	50 %	0 %	25 %	119718992
102	NC_008698	TAAA	2	8	59040	59047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008698	GAGG	2	8	59289	59296	25 %	0 %	75 %	0 %	119718994
104	NC_008698	CTGC	2	8	59987	59994	0 %	25 %	25 %	50 %	119718995
105	NC_008698	AGGA	2	8	60295	60302	50 %	0 %	50 %	0 %	119718995
106	NC_008698	GGTT	2	8	61049	61056	0 %	50 %	50 %	0 %	119718996
107	NC_008698	CCCT	2	8	61117	61124	0 %	25 %	0 %	75 %	119718996
108	NC_008698	GGCT	2	8	61259	61266	0 %	25 %	50 %	25 %	119718996
109	NC_008698	GGTA	2	8	61684	61691	25 %	25 %	50 %	0 %	119718996
110	NC_008698	TCCA	2	8	62175	62182	25 %	25 %	0 %	50 %	119718997
111	NC_008698	GTAA	2	8	63149	63156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008698	TCAC	2	8	63244	63251	25 %	25 %	0 %	50 %	119718999
113	NC_008698	CCTT	2	8	63523	63530	0 %	50 %	0 %	50 %	119718999
114	NC_008698	ATTG	2	8	64398	64405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008698	AGGA	2	8	64643	64650	50 %	0 %	50 %	0 %	119719000
116	NC_008698	AGGG	2	8	65400	65407	25 %	0 %	75 %	0 %	119719002
117	NC_008698	AGGA	2	8	66409	66416	50 %	0 %	50 %	0 %	119719003
118	NC_008698	AGCA	2	8	67162	67169	50 %	0 %	25 %	25 %	119719003
119	NC_008698	AGTT	2	8	67397	67404	25 %	50 %	25 %	0 %	119719003
120	NC_008698	TACG	2	8	67898	67905	25 %	25 %	25 %	25 %	119719004
121	NC_008698	CCCT	2	8	69281	69288	0 %	25 %	0 %	75 %	119719005
122	NC_008698	CTTT	2	8	70189	70196	0 %	75 %	0 %	25 %	119719006
123	NC_008698	GTTG	2	8	72303	72310	0 %	50 %	50 %	0 %	119719009
124	NC_008698	CGAC	2	8	72367	72374	25 %	0 %	25 %	50 %	119719009
125	NC_008698	TCCA	2	8	74248	74255	25 %	25 %	0 %	50 %	119719011
126	NC_008698	TCCG	2	8	74371	74378	0 %	25 %	25 %	50 %	119719011
127	NC_008698	GCAT	2	8	75881	75888	25 %	25 %	25 %	25 %	119719012
128	NC_008698	GTGG	2	8	76148	76155	0 %	25 %	75 %	0 %	119719012
129	NC_008698	AGGC	2	8	76298	76305	25 %	0 %	50 %	25 %	119719012
130	NC_008698	CTTC	2	8	76846	76853	0 %	50 %	0 %	50 %	119719014
131	NC_008698	GCCC	2	8	76949	76956	0 %	0 %	25 %	75 %	119719014
132	NC_008698	AAGC	2	8	76961	76968	50 %	0 %	25 %	25 %	119719014
133	NC_008698	GCCT	2	8	77056	77063	0 %	25 %	25 %	50 %	119719014
134	NC_008698	AGGC	2	8	77579	77586	25 %	0 %	50 %	25 %	119719015
135	NC_008698	ATAG	2	8	78682	78689	50 %	25 %	25 %	0 %	119719017
136	NC_008698	CCGT	2	8	79690	79697	0 %	25 %	25 %	50 %	119719019
137	NC_008698	GGAC	2	8	79828	79835	25 %	0 %	50 %	25 %	119719019
138	NC_008698	GTCT	2	8	79962	79969	0 %	50 %	25 %	25 %	119719019
139	NC_008698	CCTT	2	8	80093	80100	0 %	50 %	0 %	50 %	119719019
140	NC_008698	TCTA	2	8	81171	81178	25 %	50 %	0 %	25 %	119719022
141	NC_008698	ACAG	2	8	81740	81747	50 %	0 %	25 %	25 %	119719023
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