MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 plasmid pNOCA01

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008697	GGCCG	2	10	11557	11566	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008697	CGAAC	2	10	38702	38711	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008697	CTCGC	2	10	39516	39525	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_008697	CGCAG	2	10	41223	41232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008697	TCGGA	2	10	44105	44114	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008697	ACCGC	2	10	54007	54016	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_008697	CACCC	2	10	65675	65684	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_008697	CGCGG	2	10	86940	86949	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008697	ACGGG	2	10	90435	90444	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008697	GTGCT	2	10	91358	91367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008697	CACGG	2	10	114442	114451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008697	GTTCC	2	10	127418	127427	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008697	AACTG	2	10	127875	127884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008697	GTCGG	2	10	131210	131219	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008697	CCCGA	2	10	131232	131241	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008697	CGGAC	2	10	153699	153708	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008697	GGCAG	2	10	154353	154362	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008697	ACCAC	2	10	171379	171388	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008697	ACCCG	2	10	176044	176053	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_008697	CGGGT	2	10	186843	186852	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008697	CGGTC	2	10	199052	199061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008697	ACGCC	2	10	201960	201969	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008697	GCCCC	2	10	202269	202278	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_008697	GTCGC	2	10	205363	205372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008697	CCTGC	2	10	226075	226084	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_008697	TCGGA	2	10	227203	227212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008697	TCGGA	2	10	233174	233183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008697	CGACT	2	10	236547	236556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008697	CGTCC	2	10	237488	237497	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_008697	TCCCA	2	10	254174	254183	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_008697	TCAGG	2	10	265681	265690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008697	GGTCG	2	10	265728	265737	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008697	CGCGC	2	10	267870	267879	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_008697	CGTCA	2	10	268411	268420	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008697	GTCGA	2	10	281162	281171	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008697	CCTGC	2	10	289297	289306	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_008697	GGGCC	2	10	300421	300430	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.