MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 plasmid pNOCA01

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008697	CTGT	2	8	4960	4967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008697	GCCA	2	8	5904	5911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008697	TACG	2	8	6031	6038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008697	ACCA	2	8	10795	10802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008697	AGCC	2	8	18141	18148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008697	TCTG	2	8	22373	22380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008697	TCCA	2	8	24212	24219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008697	TCCT	2	8	33180	33187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008697	GAGC	2	8	33492	33499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008697	CGCT	2	8	38660	38667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008697	CACC	2	8	41277	41284	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008697	GCCG	2	8	51287	51294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008697	CACC	2	8	51338	51345	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008697	TCCT	2	8	52966	52973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008697	CGAG	2	8	54228	54235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008697	GTCT	2	8	54248	54255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008697	GGCC	2	8	57778	57785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008697	GGTC	2	8	58209	58216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008697	GCCG	3	12	60252	60263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008697	GTTA	2	8	60490	60497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008697	AGGC	2	8	60930	60937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008697	CGGA	2	8	64446	64453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008697	GTGG	2	8	64617	64624	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008697	CGCC	2	8	65809	65816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_008697	CCGG	2	8	69069	69076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008697	CCGG	2	8	69165	69172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008697	TCCA	2	8	69306	69313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008697	TGCG	2	8	85388	85395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008697	TCGC	2	8	86462	86469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008697	CACT	2	8	88928	88935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008697	CCTA	2	8	89291	89298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008697	GCCG	2	8	89588	89595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008697	CGGG	2	8	89886	89893	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008697	GCCC	2	8	89945	89952	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_008697	GGGT	2	8	90020	90027	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008697	CGGG	2	8	90091	90098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008697	GGCC	2	8	90154	90161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008697	CTGG	2	8	90381	90388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008697	GCCG	2	8	90659	90666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008697	CGGG	2	8	90741	90748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008697	CGAG	2	8	90784	90791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008697	CGAC	2	8	91158	91165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008697	GGGT	2	8	91470	91477	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008697	CAGG	2	8	91756	91763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008697	GGTC	2	8	91924	91931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008697	GTTC	2	8	104743	104750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008697	TGGT	2	8	104786	104793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008697	GGCC	2	8	107360	107367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008697	GGGC	2	8	109661	109668	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008697	GATC	2	8	113733	113740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008697	GGGA	2	8	113981	113988	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008697	GCTC	2	8	114602	114609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008697	TTCC	2	8	115801	115808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008697	TTCT	2	8	115956	115963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008697	AGAA	2	8	118787	118794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008697	CGGG	2	8	124879	124886	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008697	CTGC	2	8	128002	128009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008697	GAAG	2	8	128126	128133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008697	GGTG	2	8	130035	130042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008697	GAAA	2	8	135482	135489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008697	GGGT	2	8	148243	148250	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008697	GCTC	2	8	152065	152072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008697	CTGA	2	8	153128	153135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008697	CGCT	2	8	153302	153309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008697	GGGC	2	8	153310	153317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008697	GAGG	2	8	153679	153686	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008697	TCAC	2	8	153895	153902	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008697	GCAG	2	8	153986	153993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008697	GTGG	2	8	154493	154500	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008697	CGCC	2	8	157237	157244	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_008697	CATC	2	8	157338	157345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008697	GGTC	2	8	159890	159897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008697	GGTC	2	8	176945	176952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008697	AGTG	2	8	178697	178704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008697	GCCA	2	8	179485	179492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008697	GGCC	2	8	179655	179662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008697	CGAA	2	8	179837	179844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008697	GTCA	2	8	180030	180037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008697	TGCC	2	8	184453	184460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008697	GGCG	2	8	184651	184658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008697	GCCA	2	8	190525	190532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008697	GGCC	2	8	190686	190693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008697	CGGC	2	8	190839	190846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008697	TGGT	2	8	190942	190949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008697	ACGG	2	8	191071	191078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008697	TCGG	2	8	191156	191163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008697	AGTG	2	8	194602	194609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008697	CTCG	2	8	196472	196479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008697	GCGA	2	8	196524	196531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008697	TGAC	2	8	199123	199130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008697	GACA	2	8	199876	199883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008697	CTTC	2	8	204056	204063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008697	GTCG	2	8	205251	205258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008697	AGCC	2	8	205305	205312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008697	GCCC	2	8	205597	205604	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_008697	ACGC	2	8	205732	205739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008697	GGGC	2	8	205762	205769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008697	ATGC	2	8	208826	208833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008697	GGTC	2	8	209115	209122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008697	GCGA	2	8	210834	210841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008697	CCGA	2	8	210909	210916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008697	CGAG	2	8	213418	213425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008697	GTTT	2	8	215589	215596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008697	CTGT	2	8	221643	221650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008697	CTAG	2	8	221699	221706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008697	TTCG	2	8	227218	227225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008697	TCCG	2	8	229400	229407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008697	CTGG	2	8	235330	235337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008697	CAGT	2	8	236467	236474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008697	AGGG	2	8	236691	236698	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008697	GGCC	2	8	237504	237511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008697	GGGT	2	8	237523	237530	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008697	GGCC	2	8	240134	240141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008697	CGAC	2	8	240395	240402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008697	GACC	2	8	240421	240428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008697	TCGC	2	8	240574	240581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008697	GCCG	2	8	242662	242669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008697	CCAC	2	8	244950	244957	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_008697	ACCG	2	8	254100	254107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008697	ATGG	2	8	254145	254152	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008697	GGGT	2	8	255884	255891	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008697	GACC	2	8	256611	256618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008697	CGGG	2	8	259406	259413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008697	CAGC	2	8	259440	259447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008697	TACC	2	8	266498	266505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008697	CCGT	2	8	266510	266517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008697	CTCG	2	8	267726	267733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008697	CCGA	2	8	267893	267900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008697	CAAG	2	8	268444	268451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008697	CGAC	2	8	268461	268468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008697	GACT	2	8	274838	274845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008697	CGAG	2	8	275145	275152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008697	CCTC	2	8	275193	275200	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_008697	CTTC	2	8	280408	280415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008697	CCCG	2	8	281060	281067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_008697	ACCT	2	8	283212	283219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008697	GCCC	2	8	283224	283231	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_008697	GGAA	2	8	283332	283339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008697	CGGC	2	8	285392	285399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008697	CCGA	2	8	287224	287231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008697	CGGG	2	8	290182	290189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008697	GCTG	2	8	292936	292943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008697	TCGC	2	8	300462	300469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008697	TGCC	2	8	306192	306199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008697	CCAG	2	8	306381	306388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008697	CGGA	2	8	306398	306405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008697	GCGG	2	8	306440	306447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008697	TGCC	2	8	306528	306535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008697	CGCC	2	8	306601	306608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_008697	AGGC	2	8	306945	306952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008697	CCAC	2	8	307278	307285	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.