MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 plasmid pNOCA01

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008697	GA	3	6	88	93	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008697	GC	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008697	AC	3	6	6078	6083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008697	GT	3	6	11386	11391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008697	GA	3	6	11461	11466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008697	GC	3	6	11572	11577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008697	GA	3	6	17846	17851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008697	CT	3	6	21404	21409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008697	CT	3	6	33308	33313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008697	CG	3	6	33374	33379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008697	CT	4	8	41167	41174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008697	GA	3	6	41758	41763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008697	GC	3	6	41768	41773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008697	GC	3	6	41916	41921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008697	GA	3	6	45342	45347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008697	GC	3	6	45410	45415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008697	GT	3	6	54154	54159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008697	CT	3	6	56033	56038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008697	GC	3	6	60355	60360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008697	GC	3	6	67252	67257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008697	CG	3	6	85400	85405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008697	CG	3	6	85931	85936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008697	CT	3	6	85940	85945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008697	GA	3	6	89722	89727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008697	TG	3	6	90348	90353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008697	CG	3	6	90707	90712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008697	GC	3	6	91808	91813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008697	CG	4	8	107475	107482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008697	GC	3	6	113639	113644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008697	CG	3	6	114531	114536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008697	CA	3	6	118755	118760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008697	CT	3	6	127325	127330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008697	GA	3	6	129340	129345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008697	GC	3	6	129348	129353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008697	GT	3	6	134237	134242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008697	GT	3	6	140196	140201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008697	CT	3	6	141640	141645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008697	GT	3	6	148014	148019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008697	CG	3	6	148108	148113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008697	CT	3	6	148148	148153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008697	CA	3	6	152284	152289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008697	GT	3	6	153664	153669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008697	AG	3	6	157299	157304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008697	GC	3	6	159874	159879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008697	CG	3	6	163588	163593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008697	GC	3	6	176505	176510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008697	CG	3	6	176596	176601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008697	CG	3	6	177075	177080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008697	GC	3	6	177170	177175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008697	GC	3	6	177200	177205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008697	AT	3	6	179160	179165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008697	CA	3	6	179781	179786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008697	CG	3	6	184287	184292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008697	TG	3	6	184482	184487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008697	GC	4	8	184588	184595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008697	GC	3	6	190922	190927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008697	TC	3	6	191052	191057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008697	TC	3	6	194589	194594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008697	CG	3	6	199820	199825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008697	GC	3	6	201780	201785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008697	CT	3	6	201915	201920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008697	CG	3	6	203293	203298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008697	GC	3	6	203333	203338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008697	CA	3	6	203884	203889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008697	GC	3	6	204037	204042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008697	GC	3	6	204106	204111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008697	CA	3	6	205707	205712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008697	GC	3	6	205748	205753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008697	AC	4	8	205864	205871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008697	GC	3	6	205881	205886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008697	AC	3	6	208937	208942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008697	CG	3	6	210941	210946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008697	CG	3	6	224974	224979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008697	TG	3	6	225152	225157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008697	AC	3	6	226092	226097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008697	CG	3	6	226116	226121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008697	CG	3	6	226171	226176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008697	GC	3	6	232536	232541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008697	CG	3	6	237480	237485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008697	CG	3	6	240475	240480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008697	GC	3	6	240708	240713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008697	GA	4	8	242521	242528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008697	AG	3	6	247846	247851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008697	AG	3	6	254564	254569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008697	CG	4	8	255581	255588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008697	GT	3	6	255593	255598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008697	GA	3	6	259416	259421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008697	GA	3	6	264191	264196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008697	AG	4	8	264209	264216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008697	AC	3	6	266469	266474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008697	CG	3	6	267732	267737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008697	GC	3	6	274947	274952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008697	TC	3	6	283245	283250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008697	AC	3	6	284362	284367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008697	GC	3	6	285398	285403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008697	TG	3	6	287348	287353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008697	CG	3	6	297798	297803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008697	TG	3	6	300778	300783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008697	CG	3	6	302957	302962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008697	CG	3	6	307176	307181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008697	AC	3	6	307443	307448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008697	GT	3	6	307516	307521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008697	CG	3	6	307750	307755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.