MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008696	TCCACC	2	12	1518	1529	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119709758
2	NC_008696	TAGGCT	2	12	5944	5955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119709767
3	NC_008696	CTGCAC	2	12	6184	6195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119709768
4	NC_008696	TCCTTG	2	12	6967	6978	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119709770
5	NC_008696	CGCTTA	2	12	7475	7486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119709770
6	NC_008696	GGCTAG	2	12	8340	8351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119709771
7	NC_008696	GGTACC	2	12	10633	10644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008696	CTAGGA	2	12	10768	10779	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008696	CACCTT	2	12	11726	11737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119709775
10	NC_008696	CGTCGC	2	12	11741	11752	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119709775
11	NC_008696	GCGGTG	2	12	12492	12503	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119709776
12	NC_008696	CTCCAG	2	12	13070	13081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119709777
13	NC_008696	GTGGAG	2	12	14509	14520	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119709781
14	NC_008696	GGGTCT	2	12	14764	14775	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119709782
15	NC_008696	CCTAGC	2	12	15075	15086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119709783
16	NC_008696	CACCCC	2	12	16205	16216	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	119709784
17	NC_008696	TACACG	2	12	16713	16724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119709784
18	NC_008696	AGCCCT	2	12	17909	17920	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119709787
19	NC_008696	AGGGGG	2	12	18720	18731	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008696	ACGTAG	2	12	20250	20261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119709793
21	NC_008696	TAGCTC	2	12	21518	21529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119709793
22	NC_008696	TAGCCC	2	12	22563	22574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008696	GTAGAG	2	12	22584	22595	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008696	CTCGTC	2	12	24551	24562	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119709796
25	NC_008696	AAGCCC	2	12	26710	26721	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119709799
26	NC_008696	CTGTCC	2	12	26947	26958	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119709801
27	NC_008696	GGCGAG	2	12	27768	27779	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119709802
28	NC_008696	CTTGAC	2	12	27795	27806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119709802
29	NC_008696	GCATAG	2	12	28424	28435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119709805
30	NC_008696	GCTCAG	2	12	30543	30554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119709808

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.