MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008696	GC	3	6	1398	1403	0 %	0 %	50 %	50 %	119709758
2	NC_008696	TC	3	6	1460	1465	0 %	50 %	0 %	50 %	119709758
3	NC_008696	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008696	TA	3	6	3322	3327	50 %	50 %	0 %	0 %	119709761
5	NC_008696	AC	3	6	3827	3832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008696	GA	3	6	4076	4081	50 %	0 %	50 %	0 %	119709763
7	NC_008696	TA	3	6	4161	4166	50 %	50 %	0 %	0 %	119709763
8	NC_008696	AG	3	6	4425	4430	50 %	0 %	50 %	0 %	119709764
9	NC_008696	GA	3	6	4439	4444	50 %	0 %	50 %	0 %	119709764
10	NC_008696	GA	4	8	5726	5733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008696	GC	3	6	5746	5751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008696	CT	3	6	5959	5964	0 %	50 %	0 %	50 %	119709767
13	NC_008696	CG	4	8	5971	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	119709767
14	NC_008696	CG	3	6	6724	6729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008696	CG	3	6	7376	7381	0 %	0 %	50 %	50 %	119709770
16	NC_008696	AC	3	6	7598	7603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008696	CA	3	6	7613	7618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008696	GC	3	6	7702	7707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008696	TA	3	6	7951	7956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008696	GC	3	6	8353	8358	0 %	0 %	50 %	50 %	119709771
21	NC_008696	GC	3	6	9030	9035	0 %	0 %	50 %	50 %	119709772
22	NC_008696	CG	3	6	9193	9198	0 %	0 %	50 %	50 %	119709772
23	NC_008696	GC	3	6	9711	9716	0 %	0 %	50 %	50 %	119709773
24	NC_008696	CT	3	6	9775	9780	0 %	50 %	0 %	50 %	119709773
25	NC_008696	AG	3	6	10008	10013	50 %	0 %	50 %	0 %	119709774
26	NC_008696	AC	3	6	12126	12131	50 %	0 %	0 %	50 %	119709776
27	NC_008696	GC	3	6	14582	14587	0 %	0 %	50 %	50 %	119709782
28	NC_008696	AG	4	8	15056	15063	50 %	0 %	50 %	0 %	119709783
29	NC_008696	GA	3	6	15715	15720	50 %	0 %	50 %	0 %	119709784
30	NC_008696	GC	3	6	15754	15759	0 %	0 %	50 %	50 %	119709784
31	NC_008696	CA	4	8	15938	15945	50 %	0 %	0 %	50 %	119709784
32	NC_008696	CT	3	6	16491	16496	0 %	50 %	0 %	50 %	119709784
33	NC_008696	TC	3	6	17335	17340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008696	GA	3	6	18387	18392	50 %	0 %	50 %	0 %	119709788
35	NC_008696	TC	3	6	18522	18527	0 %	50 %	0 %	50 %	119709789
36	NC_008696	CT	4	8	18555	18562	0 %	50 %	0 %	50 %	119709789
37	NC_008696	CT	3	6	18633	18638	0 %	50 %	0 %	50 %	119709789
38	NC_008696	GC	3	6	19104	19109	0 %	0 %	50 %	50 %	119709790
39	NC_008696	CT	3	6	19440	19445	0 %	50 %	0 %	50 %	119709791
40	NC_008696	GA	3	6	19624	19629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008696	CT	3	6	20311	20316	0 %	50 %	0 %	50 %	119709793
42	NC_008696	CG	3	6	20450	20455	0 %	0 %	50 %	50 %	119709793
43	NC_008696	GC	3	6	21265	21270	0 %	0 %	50 %	50 %	119709793
44	NC_008696	TC	4	8	21381	21388	0 %	50 %	0 %	50 %	119709793
45	NC_008696	TG	3	6	21879	21884	0 %	50 %	50 %	0 %	119709793
46	NC_008696	TC	3	6	22072	22077	0 %	50 %	0 %	50 %	119709793
47	NC_008696	TC	3	6	22763	22768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008696	GT	3	6	23174	23179	0 %	50 %	50 %	0 %	119709794
49	NC_008696	GA	4	8	23696	23703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008696	CT	3	6	24135	24140	0 %	50 %	0 %	50 %	119709795
51	NC_008696	GA	3	6	24386	24391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008696	GC	3	6	24768	24773	0 %	0 %	50 %	50 %	119709796
53	NC_008696	CG	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	119709797
54	NC_008696	CG	3	6	25485	25490	0 %	0 %	50 %	50 %	119709797
55	NC_008696	CT	3	6	25508	25513	0 %	50 %	0 %	50 %	119709797
56	NC_008696	GT	3	6	25932	25937	0 %	50 %	50 %	0 %	119709798
57	NC_008696	TA	3	6	26186	26191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008696	AG	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	119709799
59	NC_008696	AG	3	6	27606	27611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008696	TC	3	6	28352	28357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008696	TA	3	6	30724	30729	50 %	50 %	0 %	0 %	119709809
62	NC_008696	CG	3	6	30854	30859	0 %	0 %	50 %	50 %	119709809

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.