MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008696	GC	3	6	1398	1403	0 %	0 %	50 %	50 %	119709758
2	NC_008696	TC	3	6	1460	1465	0 %	50 %	0 %	50 %	119709758
3	NC_008696	TA	3	6	3322	3327	50 %	50 %	0 %	0 %	119709761
4	NC_008696	GA	3	6	4076	4081	50 %	0 %	50 %	0 %	119709763
5	NC_008696	TA	3	6	4161	4166	50 %	50 %	0 %	0 %	119709763
6	NC_008696	AG	3	6	4425	4430	50 %	0 %	50 %	0 %	119709764
7	NC_008696	GA	3	6	4439	4444	50 %	0 %	50 %	0 %	119709764
8	NC_008696	CT	3	6	5959	5964	0 %	50 %	0 %	50 %	119709767
9	NC_008696	CG	4	8	5971	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	119709767
10	NC_008696	CG	3	6	7376	7381	0 %	0 %	50 %	50 %	119709770
11	NC_008696	GC	3	6	8353	8358	0 %	0 %	50 %	50 %	119709771
12	NC_008696	GC	3	6	9030	9035	0 %	0 %	50 %	50 %	119709772
13	NC_008696	CG	3	6	9193	9198	0 %	0 %	50 %	50 %	119709772
14	NC_008696	GC	3	6	9711	9716	0 %	0 %	50 %	50 %	119709773
15	NC_008696	CT	3	6	9775	9780	0 %	50 %	0 %	50 %	119709773
16	NC_008696	AG	3	6	10008	10013	50 %	0 %	50 %	0 %	119709774
17	NC_008696	AC	3	6	12126	12131	50 %	0 %	0 %	50 %	119709776
18	NC_008696	GC	3	6	14582	14587	0 %	0 %	50 %	50 %	119709782
19	NC_008696	AG	4	8	15056	15063	50 %	0 %	50 %	0 %	119709783
20	NC_008696	GA	3	6	15715	15720	50 %	0 %	50 %	0 %	119709784
21	NC_008696	GC	3	6	15754	15759	0 %	0 %	50 %	50 %	119709784
22	NC_008696	CA	4	8	15938	15945	50 %	0 %	0 %	50 %	119709784
23	NC_008696	CT	3	6	16491	16496	0 %	50 %	0 %	50 %	119709784
24	NC_008696	GA	3	6	18387	18392	50 %	0 %	50 %	0 %	119709788
25	NC_008696	TC	3	6	18522	18527	0 %	50 %	0 %	50 %	119709789
26	NC_008696	CT	4	8	18555	18562	0 %	50 %	0 %	50 %	119709789
27	NC_008696	CT	3	6	18633	18638	0 %	50 %	0 %	50 %	119709789
28	NC_008696	GC	3	6	19104	19109	0 %	0 %	50 %	50 %	119709790
29	NC_008696	CT	3	6	19440	19445	0 %	50 %	0 %	50 %	119709791
30	NC_008696	CT	3	6	20311	20316	0 %	50 %	0 %	50 %	119709793
31	NC_008696	CG	3	6	20450	20455	0 %	0 %	50 %	50 %	119709793
32	NC_008696	GC	3	6	21265	21270	0 %	0 %	50 %	50 %	119709793
33	NC_008696	TC	4	8	21381	21388	0 %	50 %	0 %	50 %	119709793
34	NC_008696	TG	3	6	21879	21884	0 %	50 %	50 %	0 %	119709793
35	NC_008696	TC	3	6	22072	22077	0 %	50 %	0 %	50 %	119709793
36	NC_008696	GT	3	6	23174	23179	0 %	50 %	50 %	0 %	119709794
37	NC_008696	CT	3	6	24135	24140	0 %	50 %	0 %	50 %	119709795
38	NC_008696	GC	3	6	24768	24773	0 %	0 %	50 %	50 %	119709796
39	NC_008696	CG	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	119709797
40	NC_008696	CG	3	6	25485	25490	0 %	0 %	50 %	50 %	119709797
41	NC_008696	CT	3	6	25508	25513	0 %	50 %	0 %	50 %	119709797
42	NC_008696	GT	3	6	25932	25937	0 %	50 %	50 %	0 %	119709798
43	NC_008696	AG	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	119709799
44	NC_008696	TA	3	6	30724	30729	50 %	50 %	0 %	0 %	119709809
45	NC_008696	CG	3	6	30854	30859	0 %	0 %	50 %	50 %	119709809

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.