MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008696	C	6	6	696	701	0 %	0 %	0 %	100 %	119709758
2	NC_008696	G	6	6	1753	1758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008696	A	7	7	1763	1769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008696	G	6	6	2671	2676	0 %	0 %	100 %	0 %	119709760
5	NC_008696	C	6	6	2826	2831	0 %	0 %	0 %	100 %	119709760
6	NC_008696	C	6	6	4643	4648	0 %	0 %	0 %	100 %	119709764
7	NC_008696	C	6	6	5098	5103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_008696	C	6	6	5506	5511	0 %	0 %	0 %	100 %	119709766
9	NC_008696	A	6	6	5632	5637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008696	C	6	6	7241	7246	0 %	0 %	0 %	100 %	119709770
11	NC_008696	G	6	6	7338	7343	0 %	0 %	100 %	0 %	119709770
12	NC_008696	A	6	6	8051	8056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008696	A	6	6	8058	8063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008696	G	6	6	8880	8885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008696	G	6	6	8889	8894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008696	A	6	6	9394	9399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008696	T	6	6	9403	9408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008696	T	6	6	10337	10342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008696	G	6	6	10802	10807	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008696	T	6	6	12746	12751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008696	G	6	6	13385	13390	0 %	0 %	100 %	0 %	119709778
22	NC_008696	C	6	6	13466	13471	0 %	0 %	0 %	100 %	119709778
23	NC_008696	G	6	6	13680	13685	0 %	0 %	100 %	0 %	119709779
24	NC_008696	T	6	6	14265	14270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008696	G	6	6	14648	14653	0 %	0 %	100 %	0 %	119709782
26	NC_008696	T	6	6	15411	15416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008696	C	6	6	16431	16436	0 %	0 %	0 %	100 %	119709784
28	NC_008696	T	7	7	17325	17331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008696	G	6	6	17831	17836	0 %	0 %	100 %	0 %	119709786
30	NC_008696	G	6	6	17849	17854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008696	G	6	6	17991	17996	0 %	0 %	100 %	0 %	119709787
32	NC_008696	C	6	6	18060	18065	0 %	0 %	0 %	100 %	119709787
33	NC_008696	G	6	6	18266	18271	0 %	0 %	100 %	0 %	119709787
34	NC_008696	G	6	6	18290	18295	0 %	0 %	100 %	0 %	119709787
35	NC_008696	T	6	6	19130	19135	0 %	100 %	0 %	0 %	119709790
36	NC_008696	G	6	6	19324	19329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008696	A	6	6	19629	19634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008696	A	6	6	19641	19646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008696	A	6	6	19858	19863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008696	C	7	7	19921	19927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_008696	T	6	6	21802	21807	0 %	100 %	0 %	0 %	119709793
42	NC_008696	C	6	6	22057	22062	0 %	0 %	0 %	100 %	119709793
43	NC_008696	C	6	6	22774	22779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_008696	C	6	6	22787	22792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_008696	T	6	6	22858	22863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008696	A	6	6	22904	22909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008696	C	6	6	22993	22998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_008696	A	6	6	23045	23050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008696	G	6	6	23052	23057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008696	A	7	7	23102	23108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008696	A	6	6	23703	23708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008696	A	6	6	24363	24368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008696	A	7	7	24391	24397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008696	C	6	6	25332	25337	0 %	0 %	0 %	100 %	119709797
55	NC_008696	C	6	6	25673	25678	0 %	0 %	0 %	100 %	119709797
56	NC_008696	T	6	6	26736	26741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008696	G	6	6	26823	26828	0 %	0 %	100 %	0 %	119709800
58	NC_008696	C	6	6	27506	27511	0 %	0 %	0 %	100 %	119709801
59	NC_008696	A	6	6	27612	27617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008696	C	6	6	28331	28336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_008696	C	6	6	28960	28965	0 %	0 %	0 %	100 %	119709806
62	NC_008696	G	6	6	29025	29030	0 %	0 %	100 %	0 %	119709806
63	NC_008696	G	6	6	29673	29678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008696	G	6	6	30510	30515	0 %	0 %	100 %	0 %	119709808

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.